134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5402 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  100 
 
 		 555 aa  1132    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  72.09 
 
 		 558 aa  849    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02601  activation/secretion signal peptide protein  56.57 
 
 		 557 aa  634  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.415625 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4351  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  56.68 
 
 		 581 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.891663 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4241  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  56.68 
 
 		 581 aa  632  1e-180  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.398994  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1646  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  46.65 
 
 		 569 aa  487  1e-136  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2806  putative hemolysin activation/secretion signal peptide protein, FhaC/HxuB  46.65 
 
 		 569 aa  484  1e-135  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1034  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  45.94 
 
 		 561 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1514  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  45.94 
 
 		 561 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  45.57 
 
 		 561 aa  462  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  45.79 
 
 		 559 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  45.79 
 
 		 559 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2550  hypothetical protein  45.88 
 
 		 597 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0719761  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  45.79 
 
 		 551 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  45.79 
 
 		 551 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  45.98 
 
 		 551 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  45.79 
 
 		 551 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  45.79 
 
 		 551 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  46.28 
 
 		 561 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  0.0000615286 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  44.78 
 
 		 561 aa  458  1e-127  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1436  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  44.59 
 
 		 561 aa  457  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0737479  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4655  hemolysin activation/secretion protein  45.54 
 
 		 561 aa  455  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55265  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  35.81 
 
 		 558 aa  315  1.9999999999999998e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1285  hypothetical protein  32.73 
 
 		 565 aa  288  2e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000102142  hitchhiker  0.0000179621 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4591  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.32 
 
 		 552 aa  263  8e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0179388 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0612  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.18 
 
 		 554 aa  256  7e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331915  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  31.56 
 
 		 574 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0618  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.81 
 
 		 554 aa  249  8e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.135926 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1655  hypothetical protein  30.76 
 
 		 588 aa  248  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0147  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.41 
 
 		 572 aa  235  1.0000000000000001e-60  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.96 
 
 		 559 aa  181  2e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.63 
 
 		 553 aa  136  9.999999999999999e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  26.62 
 
 		 607 aa  120  7e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1248  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.4 
 
 		 560 aa  116  7.999999999999999e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000540972  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2095  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.2 
 
 		 592 aa  110  9.000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  23.99 
 
 		 599 aa  107  7e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  28.19 
 
 		 556 aa  106  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  25.27 
 
 		 568 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  25.63 
 
 		 548 aa  105  3e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  25.09 
 
 		 568 aa  104  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  23.43 
 
 		 550 aa  100  1e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.57 
 
 		 572 aa  98.6  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.29 
 
 		 583 aa  92  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.18 
 
 		 567 aa  90.9  5e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2383  hemolysin activation/secretion protein-like  22.87 
 
 		 624 aa  90.1  1e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.418836  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.16 
 
 		 578 aa  90.1  1e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1989  hemolysin activation/secretion protein-like  23.98 
 
 		 587 aa  89.4  2e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548358  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0351  hemolysin activation/secretion protein-like protein  25.14 
 
 		 607 aa  87  8e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410508  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  27.35 
 
 		 553 aa  87  8e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.11 
 
 		 586 aa  87  8e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  29.91 
 
 		 545 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  26.67 
 
 		 558 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3523  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.41 
 
 		 548 aa  81.3  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2104  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.14 
 
 		 538 aa  78.6  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  24.44 
 
 		 567 aa  77.8  0.0000000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  24.44 
 
 		 567 aa  77.4  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  24.44 
 
 		 567 aa  77.4  0.0000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.04 
 
 		 747 aa  77.4  0.0000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3190  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.29 
 
 		 589 aa  74.7  0.000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.63 
 
 		 554 aa  74.7  0.000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.77 
 
 		 554 aa  73.9  0.000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.67 
 
 		 590 aa  73.9  0.000000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.92 
 
 		 585 aa  72.4  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  26.2 
 
 		 575 aa  71.2  0.00000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5786  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30 
 
 		 592 aa  70.9  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.564372  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.13 
 
 		 571 aa  70.9  0.00000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.51 
 
 		 565 aa  70.5  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.37 
 
 		 567 aa  70.1  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  25.53 
 
 		 554 aa  69.3  0.0000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2200  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.13 
 
 		 541 aa  69.3  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2497  surface antigen (D15)  24.37 
 
 		 531 aa  67.8  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.96 
 
 		 692 aa  67  0.0000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.15 
 
 		 585 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.91 
 
 		 592 aa  66.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  24.28 
 
 		 588 aa  65.5  0.000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.98 
 
 		 561 aa  65.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.45 
 
 		 1391 aa  65.1  0.000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5860  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.84 
 
 		 576 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680877  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  28.95 
 
 		 1349 aa  64.7  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  35.29 
 
 		 639 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  35.29 
 
 		 584 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1086  surface antigen (D15)  24.13 
 
 		 550 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0945143  normal  0.205962 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  38.37 
 
 		 1570 aa  62.4  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2460  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.12 
 
 		 587 aa  62  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118018  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0764  putative outer-membrane protein  22.38 
 
 		 508 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.408754  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  22.75 
 
 		 569 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  23.23 
 
 		 582 aa  58.5  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.17 
 
 		 538 aa  58.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.02 
 
 		 595 aa  58.9  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2226  hypothetical protein  23.37 
 
 		 543 aa  58.2  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.933636  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  26.76 
 
 		 584 aa  57.4  0.0000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55380  hypothetical protein  24.88 
 
 		 544 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0347835 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4818  hypothetical protein  24.94 
 
 		 544 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  33.03 
 
 		 580 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.44 
 
 		 561 aa  54.3  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  22.51 
 
 		 442 aa  53.1  0.00001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  26.03 
 
 		 585 aa  52.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.9 
 
 		 574 aa  52.4  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  27.03 
 
 		 595 aa  52  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  24.14 
 
 		 568 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>