152 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0378 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008312  Tery_0378  surface antigen (D15)  100 
 
 
595 aa  1199    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  52.27 
 
 
568 aa  573  1.0000000000000001e-162  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0281  surface antigen (D15)  52.45 
 
 
568 aa  555  1e-157  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  52.31 
 
 
595 aa  501  1e-140  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  51.22 
 
 
608 aa  472  1e-132  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  44.15 
 
 
588 aa  469  1.0000000000000001e-131  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  42.83 
 
 
1570 aa  454  1.0000000000000001e-126  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.84 
 
 
1391 aa  449  1e-125  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  41.32 
 
 
1349 aa  446  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  46.56 
 
 
580 aa  436  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  44.44 
 
 
585 aa  435  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  45.7 
 
 
584 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  45.38 
 
 
639 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  45.38 
 
 
584 aa  398  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  35.61 
 
 
692 aa  318  2e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  35.94 
 
 
585 aa  298  3e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1064  surface antigen (D15)  31.01 
 
 
587 aa  234  3e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459737 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5639  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.24 
 
 
533 aa  168  2.9999999999999998e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000755047 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5478  surface antigen (D15)  26.33 
 
 
579 aa  158  2e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.492721 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  26.42 
 
 
558 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.27 
 
 
567 aa  114  5e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1630  surface antigen variable number  43.97 
 
 
143 aa  110  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.479161  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4818  hypothetical protein  24.2 
 
 
544 aa  108  4e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.9 
 
 
546 aa  100  6e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55380  hypothetical protein  23.39 
 
 
544 aa  99.8  1e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0347835 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.64 
 
 
572 aa  99.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  24.55 
 
 
558 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2200  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.72 
 
 
541 aa  95.1  3e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13693  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.1 
 
 
747 aa  95.1  3e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  24.44 
 
 
574 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  26.67 
 
 
550 aa  93.2  1e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2497  surface antigen (D15)  24.47 
 
 
531 aa  91.7  3e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  24.91 
 
 
553 aa  91.3  5e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.86 
 
 
554 aa  90.5  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  24.55 
 
 
583 aa  89.4  2e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.68 
 
 
561 aa  87  8e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0612  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.65 
 
 
554 aa  87.4  8e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331915  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  24.8 
 
 
583 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  23.24 
 
 
554 aa  86.3  0.000000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2406  hemolysin activation/secretion protein  23.41 
 
 
547 aa  85.5  0.000000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.67 
 
 
575 aa  84  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1086  surface antigen (D15)  23.48 
 
 
550 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0945143  normal  0.205962 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4591  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.14 
 
 
552 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0179388 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  21.81 
 
 
602 aa  82.4  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.11 
 
 
561 aa  79.7  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  25.57 
 
 
568 aa  79.3  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  25.66 
 
 
568 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.34 
 
 
590 aa  77  0.0000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0354  hemolysin activation/secretion protein  23.05 
 
 
555 aa  77  0.000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.0188948 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.8 
 
 
573 aa  76.6  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.4 
 
 
692 aa  75.9  0.000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.66 
 
 
592 aa  75.1  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0618  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.74 
 
 
554 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.135926 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  23.69 
 
 
607 aa  72  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  24.26 
 
 
556 aa  71.6  0.00000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1629  surface antigen variable number  46.48 
 
 
71 aa  71.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.432291  normal  0.500247 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  22.59 
 
 
596 aa  71.2  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.59 
 
 
596 aa  71.2  0.00000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  23.25 
 
 
582 aa  70.5  0.00000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.12 
 
 
554 aa  70.5  0.00000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  22.82 
 
 
569 aa  69.7  0.0000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21 
 
 
585 aa  70.1  0.0000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1989  hemolysin activation/secretion protein-like  25.05 
 
 
587 aa  68.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548358  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1126  hypothetical protein  23.21 
 
 
531 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.15 
 
 
583 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.81 
 
 
585 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.05 
 
 
586 aa  68.6  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  22.59 
 
 
596 aa  68.9  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.7 
 
 
580 aa  66.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  20.76 
 
 
442 aa  66.2  0.000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  20.85 
 
 
568 aa  66.6  0.000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.84 
 
 
608 aa  65.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.43 
 
 
597 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02601  activation/secretion signal peptide protein  22.3 
 
 
557 aa  62.8  0.00000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.415625 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.88 
 
 
559 aa  62.4  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5860  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.13 
 
 
576 aa  62  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680877  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2104  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.09 
 
 
538 aa  62  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.7 
 
 
567 aa  61.2  0.00000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.06 
 
 
578 aa  60.8  0.00000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  23.95 
 
 
548 aa  60.5  0.00000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  22.95 
 
 
545 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  22.52 
 
 
599 aa  60.1  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  21.05 
 
 
567 aa  59.3  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  21.05 
 
 
567 aa  59.3  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.66 
 
 
560 aa  58.9  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4182  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.99 
 
 
592 aa  59.3  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0159904  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.86 
 
 
549 aa  58.9  0.0000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.6 
 
 
543 aa  58.9  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  21.53 
 
 
567 aa  58.5  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3190  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.02 
 
 
589 aa  57.8  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376319  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.93 
 
 
591 aa  57.8  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2610  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.46 
 
 
591 aa  57  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000294226  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  22.43 
 
 
575 aa  57  0.0000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4029  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.46 
 
 
591 aa  57  0.0000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000138882  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1034  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  29.2 
 
 
561 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1514  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.2 
 
 
561 aa  56.2  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0608  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase; ATP-PRT)  22.88 
 
 
590 aa  55.5  0.000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1457  surface antigen (D15)  27.54 
 
 
555 aa  55.5  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  24.03 
 
 
565 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  22.54 
 
 
562 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>