104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0354 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0354  hemolysin activation/secretion protein  100 
 
 		 555 aa  1122    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0188948 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2576  hemolysin activation/secretion protein  66.8 
 
 		 537 aa  679    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2406  hemolysin activation/secretion protein  46.89 
 
 		 547 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2993  hemolysin activation/secretion protein  44.51 
 
 		 590 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00815358 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2226  hypothetical protein  41.7 
 
 		 543 aa  386  1e-106  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.933636  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4818  hypothetical protein  39.54 
 
 		 544 aa  361  2e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2219  hemolysin activation/secretion protein  40.11 
 
 		 575 aa  360  3e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0458384  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2921  hemolysin activation/secretion protein  36.41 
 
 		 593 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.502908  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55380  hypothetical protein  40.04 
 
 		 544 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0347835 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2497  surface antigen (D15)  39.8 
 
 		 531 aa  349  6e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  38.22 
 
 		 543 aa  347  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1457  surface antigen (D15)  37.9 
 
 		 555 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2104  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  38.42 
 
 		 538 aa  322  9.999999999999999e-87  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2200  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  38.46 
 
 		 541 aa  321  1.9999999999999998e-86  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1086  surface antigen (D15)  36.07 
 
 		 550 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0945143  normal  0.205962 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.38 
 
 		 538 aa  190  5e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1126  hypothetical protein  26.16 
 
 		 531 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5860  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.39 
 
 		 576 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  25.69 
 
 		 595 aa  99.4  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.52 
 
 		 747 aa  95.5  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  24.9 
 
 		 588 aa  90.9  5e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  23.18 
 
 		 585 aa  89  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  23.65 
 
 		 608 aa  84.7  0.000000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.24 
 
 		 567 aa  84.3  0.000000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.57 
 
 		 572 aa  82  0.00000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  22.4 
 
 		 1570 aa  80.5  0.00000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0378  surface antigen (D15)  22.89 
 
 		 595 aa  78.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  23.29 
 
 		 692 aa  77  0.0000000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  21.6 
 
 		 554 aa  76.6  0.000000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  22.31 
 
 		 1391 aa  76.6  0.000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.77 
 
 		 580 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  21.81 
 
 		 1349 aa  74.7  0.000000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  23.35 
 
 		 584 aa  74.7  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  24.53 
 
 		 553 aa  73.6  0.000000000009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  24.76 
 
 		 558 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.24 
 
 		 565 aa  71.6  0.00000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  23.43 
 
 		 607 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.26 
 
 		 567 aa  70.5  0.00000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.22 
 
 		 561 aa  67  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.9 
 
 		 639 aa  67  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.79 
 
 		 584 aa  67  0.0000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  23.93 
 
 		 556 aa  66.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.99 
 
 		 554 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_003296  RS02601  activation/secretion signal peptide protein  23.94 
 
 		 557 aa  63.2  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.415625 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  22.05 
 
 		 558 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.29 
 
 		 571 aa  62.8  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.63 
 
 		 549 aa  62.4  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  23.4 
 
 		 568 aa  61.6  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.48 
 
 		 692 aa  61.2  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1646  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.84 
 
 		 569 aa  60.8  0.00000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0281  surface antigen (D15)  23.06 
 
 		 568 aa  60.8  0.00000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.44 
 
 		 573 aa  60.5  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  23.54 
 
 		 548 aa  60.1  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.76 
 
 		 569 aa  60.1  0.0000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.9 
 
 		 558 aa  59.7  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.31 
 
 		 553 aa  58.9  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2806  putative hemolysin activation/secretion signal peptide protein, FhaC/HxuB  22.6 
 
 		 569 aa  58.2  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.07 
 
 		 583 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2460  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.29 
 
 		 587 aa  58.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118018  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  21.58 
 
 		 550 aa  57.4  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4655  hemolysin activation/secretion protein  22.38 
 
 		 561 aa  57  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55265  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  21.09 
 
 		 599 aa  56.2  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0612  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.22 
 
 		 554 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  20.73 
 
 		 557 aa  57  0.000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4241  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.94 
 
 		 581 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.398994  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4351  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.94 
 
 		 581 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.891663 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.51 
 
 		 568 aa  54.7  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  22.18 
 
 		 568 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0618  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.05 
 
 		 554 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.135926 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.51 
 
 		 546 aa  54.7  0.000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  18.52 
 
 		 554 aa  53.9  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  22.18 
 
 		 568 aa  53.9  0.000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  24.28 
 
 		 555 aa  53.1  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  25.28 
 
 		 570 aa  52.8  0.00001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  23.68 
 
 		 574 aa  52.4  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  25.56 
 
 		 442 aa  52.4  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  17.2 
 
 		 554 aa  52.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1034  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  22.33 
 
 		 561 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1514  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.33 
 
 		 561 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.27 
 
 		 561 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  0.0000615286 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  20.46 
 
 		 578 aa  51.2  0.00005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  21.25 
 
 		 569 aa  50.8  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  23.61 
 
 		 582 aa  50.8  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  21.14 
 
 		 558 aa  50.8  0.00006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3190  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.35 
 
 		 589 aa  50.4  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.68 
 
 		 585 aa  50.4  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2626  Outer membrane protein/protective antigen OMA87- like protein  32.5 
 
 		 416 aa  50.4  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000575123  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.9 
 
 		 561 aa  50.4  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.8 
 
 		 585 aa  48.9  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1064  surface antigen (D15)  30.23 
 
 		 587 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459737 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1248  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.16 
 
 		 560 aa  47.8  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000540972  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3523  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.33 
 
 		 548 aa  47.8  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.33 
 
 		 561 aa  47  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.46 
 
 		 561 aa  45.8  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1436  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.05 
 
 		 561 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0737479  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.67 
 
 		 585 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3644  putative activator/secretion protein  23.02 
 
 		 584 aa  44.7  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2550  hypothetical protein  30.38 
 
 		 597 aa  43.9  0.009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0719761  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  30.77 
 
 		 559 aa  43.5  0.01  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  30.77 
 
 		 551 aa  43.5  0.01  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>