145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0068 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 		 559 aa  1128    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.62 
 
 		 561 aa  217  4e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  0.0000615286 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1034  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  29.08 
 
 		 561 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1514  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.08 
 
 		 561 aa  213  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.17 
 
 		 561 aa  211  3e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1436  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.11 
 
 		 561 aa  210  5e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0737479  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.93 
 
 		 561 aa  209  7e-53  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4655  hemolysin activation/secretion protein  29.03 
 
 		 561 aa  209  2e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55265  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  30.16 
 
 		 551 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  30.16 
 
 		 559 aa  200  5e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  30.16 
 
 		 559 aa  200  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  30.16 
 
 		 551 aa  200  6e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  30.16 
 
 		 551 aa  200  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  30.16 
 
 		 551 aa  200  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  30.16 
 
 		 551 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2550  hypothetical protein  29.6 
 
 		 597 aa  194  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0719761  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2806  putative hemolysin activation/secretion signal peptide protein, FhaC/HxuB  28 
 
 		 569 aa  192  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1646  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.86 
 
 		 569 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  25.96 
 
 		 555 aa  182  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  26.31 
 
 		 558 aa  177  4e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  27.57 
 
 		 558 aa  170  6e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4351  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.49 
 
 		 581 aa  169  9e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.891663 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4241  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.49 
 
 		 581 aa  169  9e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.398994  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_003296  RS02601  activation/secretion signal peptide protein  24.36 
 
 		 557 aa  166  8e-40  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.415625 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0147  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.13 
 
 		 572 aa  150  5e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  25.4 
 
 		 568 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  25.22 
 
 		 568 aa  143  7e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  25.51 
 
 		 599 aa  141  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1655  hypothetical protein  25.98 
 
 		 588 aa  140  6e-32  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.26 
 
 		 572 aa  130  5.0000000000000004e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0618  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.47 
 
 		 554 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.135926 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3523  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.76 
 
 		 548 aa  129  1.0000000000000001e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0612  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.17 
 
 		 554 aa  126  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.58 
 
 		 553 aa  125  2e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1248  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.54 
 
 		 560 aa  124  6e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000540972  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  25.39 
 
 		 574 aa  123  9e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2095  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.04 
 
 		 592 aa  123  9.999999999999999e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2383  hemolysin activation/secretion protein-like  24.45 
 
 		 624 aa  119  1.9999999999999998e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.418836  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4591  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.95 
 
 		 552 aa  117  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0179388 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1285  hypothetical protein  23.08 
 
 		 565 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000102142  hitchhiker  0.0000179621 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0351  hemolysin activation/secretion protein-like protein  23.11 
 
 		 607 aa  116  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410508  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2460  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.94 
 
 		 587 aa  115  2.0000000000000002e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118018  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  26.64 
 
 		 550 aa  110  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  24.46 
 
 		 553 aa  109  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.37 
 
 		 567 aa  107  8e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.61 
 
 		 583 aa  106  9e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  23.89 
 
 		 567 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  23.89 
 
 		 567 aa  105  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  23.89 
 
 		 567 aa  106  1e-21  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1989  hemolysin activation/secretion protein-like  22.57 
 
 		 587 aa  105  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548358  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.15 
 
 		 595 aa  103  9e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  26.02 
 
 		 607 aa  100  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  24.92 
 
 		 548 aa  99  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.43 
 
 		 692 aa  98.2  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.17 
 
 		 554 aa  97.4  6e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  24.28 
 
 		 588 aa  97.1  8e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.75 
 
 		 569 aa  96.7  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.76 
 
 		 554 aa  96.7  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.73 
 
 		 747 aa  95.9  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.79 
 
 		 585 aa  94  6e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  24.03 
 
 		 442 aa  92.4  2e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  24.67 
 
 		 585 aa  91.7  3e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  24.07 
 
 		 692 aa  90.9  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.01 
 
 		 578 aa  90.9  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3190  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.2 
 
 		 589 aa  90.9  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376319  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5786  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.81 
 
 		 592 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.564372  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.37 
 
 		 590 aa  87  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.54 
 
 		 586 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  24.15 
 
 		 554 aa  84.3  0.000000000000005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.24 
 
 		 596 aa  82.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.62 
 
 		 561 aa  82  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  22.24 
 
 		 596 aa  82.8  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  23.54 
 
 		 584 aa  81.6  0.00000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.49 
 
 		 561 aa  81.3  0.00000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  22.68 
 
 		 545 aa  80.5  0.00000000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.32 
 
 		 1349 aa  80.1  0.00000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  22.24 
 
 		 596 aa  80.1  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  24.44 
 
 		 558 aa  78.6  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  22.76 
 
 		 1391 aa  78.6  0.0000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  25.12 
 
 		 556 aa  77.4  0.0000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  23.39 
 
 		 595 aa  75.5  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  22.39 
 
 		 1570 aa  75.1  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.29 
 
 		 565 aa  73.6  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.04 
 
 		 592 aa  73.6  0.00000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  26.72 
 
 		 575 aa  72.8  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.3 
 
 		 574 aa  72  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4818  hypothetical protein  23.85 
 
 		 544 aa  72  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.78 
 
 		 567 aa  71.6  0.00000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.96 
 
 		 546 aa  70.9  0.00000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0482  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.88 
 
 		 579 aa  70.9  0.00000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.75 
 
 		 554 aa  69.7  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  24.17 
 
 		 583 aa  69.3  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.77 
 
 		 560 aa  69.3  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2104  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.91 
 
 		 538 aa  66.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  23.14 
 
 		 608 aa  65.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.04 
 
 		 554 aa  65.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55380  hypothetical protein  23.23 
 
 		 544 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0347835 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.91 
 
 		 571 aa  64.7  0.000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2497  surface antigen (D15)  21.98 
 
 		 531 aa  63.9  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889807 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2200  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.71 
 
 		 541 aa  63.5  0.000000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.13693  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>