107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_0482 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_0482  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 		 579 aa  1164    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5786  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.54 
 
 		 592 aa  329  8e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.564372  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2460  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  38.92 
 
 		 587 aa  327  3e-88  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118018  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  27.2 
 
 		 568 aa  99.4  2e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  27.2 
 
 		 568 aa  98.6  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  26.72 
 
 		 550 aa  96.7  1e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3523  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.1 
 
 		 548 aa  87.4  6e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  26.29 
 
 		 607 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.35 
 
 		 583 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.98 
 
 		 557 aa  84  0.000000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  26.6 
 
 		 599 aa  83.6  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  26.63 
 
 		 545 aa  82.8  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  25.8 
 
 		 548 aa  81.3  0.00000000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2383  hemolysin activation/secretion protein-like  25.51 
 
 		 624 aa  76.6  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.418836  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.09 
 
 		 561 aa  76.6  0.000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.95 
 
 		 554 aa  75.9  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1989  hemolysin activation/secretion protein-like  25.32 
 
 		 587 aa  75.5  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548358  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  25.7 
 
 		 553 aa  73.9  0.000000000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.56 
 
 		 559 aa  70.9  0.00000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  23.41 
 
 		 558 aa  69.7  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.7 
 
 		 595 aa  68.2  0.0000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.53 
 
 		 585 aa  68.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  23.79 
 
 		 554 aa  67.4  0.0000000007  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.79 
 
 		 586 aa  66.6  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.35 
 
 		 585 aa  66.6  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  28.47 
 
 		 556 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  24.4 
 
 		 558 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  24.62 
 
 		 442 aa  65.1  0.000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1248  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.52 
 
 		 560 aa  64.7  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000540972  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  23.28 
 
 		 570 aa  64.3  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.01 
 
 		 572 aa  60.8  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  24.16 
 
 		 551 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1646  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.06 
 
 		 569 aa  60.5  0.00000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0055  hemolysin activation/secretion protein-like  24.85 
 
 		 533 aa  59.7  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.8 
 
 		 561 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.64 
 
 		 592 aa  60.1  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1436  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.99 
 
 		 561 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0737479  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  22.41 
 
 		 584 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  24.16 
 
 		 559 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1285  hypothetical protein  23.11 
 
 		 565 aa  59.3  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000102142  hitchhiker  0.0000179621 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  23.92 
 
 		 565 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.19 
 
 		 747 aa  59.3  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  24.43 
 
 		 551 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  24.43 
 
 		 551 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  24.23 
 
 		 551 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  24.43 
 
 		 551 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.32 
 
 		 554 aa  59.3  0.0000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  24.43 
 
 		 559 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4655  hemolysin activation/secretion protein  21.66 
 
 		 561 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55265  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2550  hypothetical protein  23.23 
 
 		 597 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0719761  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3190  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.46 
 
 		 589 aa  58.5  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376319  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  24.94 
 
 		 562 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  24.94 
 
 		 562 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  24.46 
 
 		 574 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0618  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.15 
 
 		 554 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.135926 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0351  hemolysin activation/secretion protein-like protein  24.3 
 
 		 607 aa  57.4  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410508  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.99 
 
 		 561 aa  57.4  0.0000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.87 
 
 		 569 aa  57  0.0000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0612  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.62 
 
 		 554 aa  57  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  23.47 
 
 		 567 aa  56.2  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  23.47 
 
 		 567 aa  56.2  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  23.47 
 
 		 567 aa  56.6  0.000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  26.46 
 
 		 595 aa  55.8  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  24.14 
 
 		 562 aa  56.2  0.000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.8 
 
 		 553 aa  55.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1034  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  22.4 
 
 		 561 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1514  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.4 
 
 		 561 aa  55.5  0.000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  26.34 
 
 		 555 aa  54.3  0.000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2095  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.68 
 
 		 592 aa  54.3  0.000006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5860  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.12 
 
 		 576 aa  54.3  0.000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680877  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.95 
 
 		 578 aa  53.9  0.000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.06 
 
 		 554 aa  53.5  0.000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  23.39 
 
 		 576 aa  52.8  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  23.22 
 
 		 585 aa  52.4  0.00002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.94 
 
 		 568 aa  52.4  0.00002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.61 
 
 		 558 aa  52.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1126  hypothetical protein  24.24 
 
 		 531 aa  52  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.66 
 
 		 561 aa  52  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  0.0000615286 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1282  hemolysin activator-related protein  25.47 
 
 		 539 aa  52  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395972 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0432  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.46 
 
 		 592 aa  51.6  0.00004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.46 
 
 		 580 aa  51.2  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  24.14 
 
 		 558 aa  50.8  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.25 
 
 		 639 aa  50.8  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.25 
 
 		 584 aa  50.4  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  22.52 
 
 		 588 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  21.83 
 
 		 608 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.56 
 
 		 560 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  23.02 
 
 		 575 aa  48.5  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  23.39 
 
 		 596 aa  48.9  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.39 
 
 		 596 aa  48.9  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.92 
 
 		 590 aa  48.5  0.0003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4481  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  22.84 
 
 		 558 aa  48.1  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1056  hemolysin activation/secretion protein-like  22.2 
 
 		 576 aa  47.8  0.0006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000536803  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.14 
 
 		 549 aa  47.8  0.0006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02601  activation/secretion signal peptide protein  22.87 
 
 		 557 aa  47.4  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.415625 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  23.04 
 
 		 569 aa  47  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  27.39 
 
 		 692 aa  46.6  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.78 
 
 		 567 aa  47  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.97 
 
 		 597 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  23.39 
 
 		 596 aa  46.2  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>