181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0727 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  64.58 
 
 
574 aa  734    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  100 
 
 
575 aa  1154    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  56.72 
 
 
590 aa  662    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  56.45 
 
 
595 aa  584  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  37.29 
 
 
567 aa  316  7e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  37.29 
 
 
567 aa  316  7e-85  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  37.11 
 
 
567 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  35 
 
 
442 aa  258  1e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  32.72 
 
 
607 aa  192  1e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  32.57 
 
 
550 aa  192  1e-47  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.56 
 
 
554 aa  191  2.9999999999999997e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.38 
 
 
585 aa  190  7e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.7 
 
 
554 aa  188  2e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.55 
 
 
583 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  31.07 
 
 
556 aa  184  4.0000000000000006e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  33.09 
 
 
572 aa  183  9.000000000000001e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  30.98 
 
 
553 aa  181  2.9999999999999997e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.03 
 
 
586 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  27.37 
 
 
554 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  31.97 
 
 
545 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  29.37 
 
 
548 aa  157  7e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.21 
 
 
578 aa  146  1e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.68 
 
 
596 aa  144  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  25.68 
 
 
596 aa  144  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  25.68 
 
 
596 aa  141  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0764  putative outer-membrane protein  26.43 
 
 
508 aa  140  3.9999999999999997e-32  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.408754  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  26.26 
 
 
576 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  28.81 
 
 
558 aa  137  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.02 
 
 
567 aa  137  5e-31  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.72 
 
 
561 aa  137  6.0000000000000005e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.2 
 
 
569 aa  135  1.9999999999999998e-30  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.95 
 
 
692 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0087  hypothetical protein  27.61 
 
 
581 aa  130  6e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00223104  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1056  hemolysin activation/secretion protein-like  24.5 
 
 
576 aa  130  7.000000000000001e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000536803  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0530  putative outer-membrane protein  25.06 
 
 
551 aa  128  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1744  hypothetical protein  25.06 
 
 
551 aa  128  4.0000000000000003e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.77 
 
 
592 aa  122  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1531  hypothetical protein  23.26 
 
 
597 aa  111  3e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.46 
 
 
545 aa  109  2e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000416346 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.86 
 
 
571 aa  107  9e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.22 
 
 
747 aa  98.6  3e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.54 
 
 
561 aa  93.2  1e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  24.95 
 
 
692 aa  90.9  5e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  24.51 
 
 
562 aa  90.9  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.53 
 
 
549 aa  89.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  25.39 
 
 
565 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5786  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.33 
 
 
592 aa  89.4  2e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.564372  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25 
 
 
585 aa  88.6  3e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.05 
 
 
567 aa  87.8  5e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  27.57 
 
 
595 aa  85.5  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.85 
 
 
560 aa  85.5  0.000000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  25 
 
 
562 aa  85.5  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  25.21 
 
 
569 aa  84.3  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  24.78 
 
 
562 aa  83.6  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.1 
 
 
554 aa  82.4  0.00000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.31 
 
 
1391 aa  82.4  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.31 
 
 
1349 aa  82  0.00000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  23.98 
 
 
584 aa  79.7  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  22.93 
 
 
1570 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.52 
 
 
573 aa  79.3  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.66 
 
 
558 aa  79.3  0.0000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2460  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.98 
 
 
587 aa  79  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118018  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.51 
 
 
559 aa  78.6  0.0000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.84 
 
 
554 aa  78.6  0.0000000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.23 
 
 
546 aa  78.6  0.0000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.04 
 
 
563 aa  77.4  0.0000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0094  hemolysin activator HlyB  24.59 
 
 
574 aa  77  0.000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0375  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.22 
 
 
568 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.46 
 
 
557 aa  75.5  0.000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  24.44 
 
 
570 aa  75.5  0.000000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0419  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.13 
 
 
570 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  27.19 
 
 
568 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1779  activation/secretion signal peptide protein  25.83 
 
 
564 aa  74.7  0.000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000346081  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  26.27 
 
 
558 aa  72.8  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  26.75 
 
 
568 aa  73.2  0.00000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  26.2 
 
 
555 aa  71.2  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  25.67 
 
 
582 aa  70.9  0.00000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  27.05 
 
 
585 aa  69.3  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  25.33 
 
 
583 aa  68.6  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02601  activation/secretion signal peptide protein  27.15 
 
 
557 aa  67.4  0.0000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.415625 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1285  hypothetical protein  26.49 
 
 
565 aa  67.4  0.0000000007  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000102142  hitchhiker  0.0000179621 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.69 
 
 
580 aa  66.2  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.51 
 
 
565 aa  65.9  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.53 
 
 
608 aa  65.5  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.45 
 
 
568 aa  65.9  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.32 
 
 
584 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  24.95 
 
 
599 aa  65.1  0.000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  28.99 
 
 
551 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.05 
 
 
561 aa  64.7  0.000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.84 
 
 
575 aa  64.3  0.000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  28.99 
 
 
559 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  28.99 
 
 
559 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  28.99 
 
 
551 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  28.99 
 
 
551 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1436  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.05 
 
 
561 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0737479  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  28.99 
 
 
551 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  28.99 
 
 
551 aa  63.9  0.000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.74 
 
 
561 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0432  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.19 
 
 
592 aa  63.5  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5132  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.7 
 
 
566 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.506347 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>