137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0419 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0419  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  100 
 
 
570 aa  1161    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0375  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  53.51 
 
 
568 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  46.36 
 
 
563 aa  468  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1779  activation/secretion signal peptide protein  45.26 
 
 
564 aa  464  1e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000346081  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0094  hemolysin activator HlyB  39.22 
 
 
574 aa  365  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3716  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.87 
 
 
593 aa  305  1.0000000000000001e-81  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1518  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  34.19 
 
 
562 aa  286  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1621  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.19 
 
 
562 aa  286  1.0000000000000001e-75  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0432  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  35.06 
 
 
592 aa  281  2e-74  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5132  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.42 
 
 
566 aa  281  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  33.14 
 
 
562 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3644  putative activator/secretion protein  35.6 
 
 
584 aa  276  9e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.94 
 
 
562 aa  275  2.0000000000000002e-72  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1084  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  32.94 
 
 
562 aa  274  3e-72  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5340  hemolysin activator translocator  35.34 
 
 
588 aa  273  5.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2328  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  34 
 
 
580 aa  269  1e-70  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5729  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.48 
 
 
594 aa  269  1e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503116  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2721  outer membrane hemolysin activator protein  34.72 
 
 
578 aa  268  2e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3879  outer membrane hemolysin activator protein  33.57 
 
 
561 aa  268  2e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2070  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.65 
 
 
584 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1169  outer membrane hemolysin activator protein  34.03 
 
 
586 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2800  outer membrane hemolysin activator protein  34.03 
 
 
586 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4292  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.48 
 
 
593 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185481  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4522  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  33.93 
 
 
582 aa  259  1e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1278  outer membrane hemolysin activator protein  34.23 
 
 
585 aa  259  1e-67  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1125  hemolysin activation/secretion protein  34.04 
 
 
585 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000467799  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1132  hemolysin activation/secretion protein  34.04 
 
 
568 aa  256  7e-67  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.330921  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6356  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  33.53 
 
 
563 aa  255  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7312  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.17 
 
 
595 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027625  normal  0.0739719 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0112  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  33.16 
 
 
574 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.034369 
 
 
-
 
NC_003296  RS02577  activation/secretion protein  33.91 
 
 
578 aa  253  9.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2842  putative activation/secretion signal peptide protein, HlyB like  33.4 
 
 
584 aa  249  7e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0483717  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0888  activation/secretion protein  32.13 
 
 
590 aa  249  1e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3782  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.96 
 
 
586 aa  249  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.627469  normal  0.463538 
 
 
-
 
NC_003296  RS03929  activation/secretion signal peptide protein  31.75 
 
 
590 aa  247  4.9999999999999997e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02975  outer membrane hemolysin activator protein  33.02 
 
 
570 aa  230  6e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0484  hemolysin activator HlyB  32.82 
 
 
572 aa  224  3e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0371  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.36 
 
 
585 aa  224  4e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4078  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.2 
 
 
581 aa  223  6e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2040  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.64 
 
 
581 aa  221  1.9999999999999999e-56  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.354299  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2120  outer membrane hemolysin activator protein  29.29 
 
 
581 aa  218  2.9999999999999998e-55  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4730  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  30.44 
 
 
550 aa  198  3e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.370373  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0086  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.21 
 
 
587 aa  191  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4076  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  28.6 
 
 
556 aa  191  4e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1537  putative hemolysin activation protein HecB  24.9 
 
 
566 aa  172  1e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.395998  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1681  putative periplasmic protein  25.53 
 
 
590 aa  164  5.0000000000000005e-39  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0608  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase; ATP-PRT)  25.55 
 
 
590 aa  161  2e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1282  hemolysin activator-related protein  26.57 
 
 
539 aa  160  6e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.395972 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  26.17 
 
 
562 aa  154  5e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  26.06 
 
 
570 aa  153  7e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  27.01 
 
 
562 aa  153  8.999999999999999e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  27.01 
 
 
562 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  26.27 
 
 
565 aa  150  9e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  25.83 
 
 
569 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.76 
 
 
549 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.72 
 
 
585 aa  139  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.25 
 
 
554 aa  139  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0072  HlyB family hemolysin activator protein  35.23 
 
 
294 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.569784  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.98 
 
 
557 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.69 
 
 
573 aa  134  3.9999999999999996e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.74 
 
 
554 aa  134  6e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0300  hemolysin activator protein  26.91 
 
 
562 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00625551  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.84 
 
 
558 aa  128  3e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.4 
 
 
560 aa  127  5e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.21 
 
 
568 aa  125  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2045  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  23.73 
 
 
513 aa  108  2e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102664  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4481  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  26.04 
 
 
558 aa  108  2e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359281  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2439  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  23.17 
 
 
553 aa  99  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00155436  decreased coverage  0.0000110124 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4169  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.91 
 
 
559 aa  94.4  6e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.987649 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.12 
 
 
575 aa  93.6  9e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3792  hemolysin activator HlyB  25.42 
 
 
575 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.609243  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2157  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  22.95 
 
 
553 aa  93.2  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.54 
 
 
608 aa  92.8  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.96 
 
 
565 aa  90.1  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  25 
 
 
582 aa  89.4  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1381  potra domain, shlb-type family  30.91 
 
 
354 aa  87.4  6e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.163797 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1450  TPS family activation/secretion protein  24.95 
 
 
565 aa  86.3  0.000000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  23.19 
 
 
602 aa  85.1  0.000000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4271  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.41 
 
 
560 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214751  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0154  hypothetical protein  46.96 
 
 
121 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1757  HlyB family hemolysin activator protein  26 
 
 
520 aa  80.5  0.00000000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.598538  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0802  HlyB family hemolysin activator protein  26.41 
 
 
551 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1821  HlyB family hemolysin activator protein  26 
 
 
554 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2481  HlyB family hemolysin activator protein  25.64 
 
 
554 aa  80.1  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2610  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.97 
 
 
591 aa  79.7  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000294226  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1613  HlyB family hemolysin activator protein  26 
 
 
558 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0491  HlyB family hemolysin activator protein  26 
 
 
558 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4029  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.48 
 
 
591 aa  79.3  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000138882  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4055  hemolysin activator protein  32.39 
 
 
180 aa  79  0.0000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.86 
 
 
591 aa  78.2  0.0000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.74 
 
 
580 aa  78.2  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4182  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.75 
 
 
592 aa  77.8  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0159904  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2342  HlyB family hemolysin activator protein  25.8 
 
 
554 aa  77.8  0.0000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4641  hemolysin activator protein  27.46 
 
 
570 aa  77.4  0.0000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  22.86 
 
 
583 aa  76.3  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  23.15 
 
 
583 aa  75.1  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  30.61 
 
 
575 aa  74.7  0.000000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.35 
 
 
610 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.57 
 
 
590 aa  70.5  0.00000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.73 
 
 
574 aa  69.3  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>