135 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A0094 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A0094  hemolysin activator HlyB  100 
 
 
574 aa  1170    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1779  activation/secretion signal peptide protein  48.55 
 
 
564 aa  515  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000346081  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  48.02 
 
 
563 aa  514  1e-144  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0375  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  48.37 
 
 
568 aa  491  1e-137  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0419  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  39.22 
 
 
570 aa  365  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3716  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  38.23 
 
 
593 aa  347  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6356  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  36.63 
 
 
563 aa  337  2.9999999999999997e-91  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4522  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  35.59 
 
 
582 aa  335  2e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02577  activation/secretion protein  35.88 
 
 
578 aa  317  4e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5132  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.88 
 
 
566 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  35.34 
 
 
562 aa  301  3e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1084  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  35.34 
 
 
562 aa  300  3e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1518  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  34.7 
 
 
562 aa  300  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.15 
 
 
562 aa  300  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1621  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.7 
 
 
562 aa  300  6e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2721  outer membrane hemolysin activator protein  34.78 
 
 
578 aa  299  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0112  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  35.31 
 
 
574 aa  298  2e-79  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.034369 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0432  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  33.85 
 
 
592 aa  298  3e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3644  putative activator/secretion protein  34.89 
 
 
584 aa  292  1e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2328  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  32.86 
 
 
580 aa  291  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2070  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.85 
 
 
584 aa  287  4e-76  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3879  outer membrane hemolysin activator protein  35.12 
 
 
561 aa  286  5e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7312  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.15 
 
 
595 aa  286  5e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027625  normal  0.0739719 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0484  hemolysin activator HlyB  33.58 
 
 
572 aa  284  2.0000000000000002e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5729  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.42 
 
 
594 aa  284  2.0000000000000002e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503116  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4292  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.99 
 
 
593 aa  284  3.0000000000000004e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185481  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02975  outer membrane hemolysin activator protein  34.61 
 
 
570 aa  279  8e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3782  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.55 
 
 
586 aa  276  8e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.627469  normal  0.463538 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0888  activation/secretion protein  34.25 
 
 
590 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1125  hemolysin activation/secretion protein  34.74 
 
 
585 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000467799  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1132  hemolysin activation/secretion protein  34.62 
 
 
568 aa  273  7e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.330921  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2842  putative activation/secretion signal peptide protein, HlyB like  34.33 
 
 
584 aa  272  1e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0483717  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5340  hemolysin activator translocator  35.04 
 
 
588 aa  272  1e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1278  outer membrane hemolysin activator protein  34.36 
 
 
585 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03929  activation/secretion signal peptide protein  34.23 
 
 
590 aa  269  1e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2800  outer membrane hemolysin activator protein  32.47 
 
 
586 aa  267  4e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1169  outer membrane hemolysin activator protein  32.68 
 
 
586 aa  266  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2040  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.38 
 
 
581 aa  264  4e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.354299  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2120  outer membrane hemolysin activator protein  31.79 
 
 
581 aa  260  4e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4078  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.49 
 
 
581 aa  259  6e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0371  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  33.85 
 
 
585 aa  256  5e-67  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4730  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  27.7 
 
 
550 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.370373  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1282  hemolysin activator-related protein  25.84 
 
 
539 aa  188  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.395972 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4076  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  28.32 
 
 
556 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0086  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.53 
 
 
587 aa  188  3e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1537  putative hemolysin activation protein HecB  24.22 
 
 
566 aa  172  1e-41  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.395998  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.16 
 
 
558 aa  167  5e-40  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.86 
 
 
549 aa  160  5e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.73 
 
 
554 aa  152  1e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  26.97 
 
 
570 aa  148  3e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.83 
 
 
585 aa  148  3e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0608  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase; ATP-PRT)  22.16 
 
 
590 aa  145  1e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.26 
 
 
554 aa  146  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1681  putative periplasmic protein  21.98 
 
 
590 aa  144  3e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  26.8 
 
 
562 aa  144  6e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  27.48 
 
 
562 aa  143  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  27.48 
 
 
562 aa  143  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  24.62 
 
 
569 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  26.6 
 
 
565 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.48 
 
 
557 aa  139  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.91 
 
 
560 aa  138  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.1 
 
 
568 aa  137  7.000000000000001e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.99 
 
 
573 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0072  HlyB family hemolysin activator protein  34.7 
 
 
294 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.569784  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.17 
 
 
608 aa  125  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0300  hemolysin activator protein  23.63 
 
 
562 aa  113  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00625551  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25 
 
 
610 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.35 
 
 
597 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.7 
 
 
580 aa  107  7e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  23.85 
 
 
602 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4481  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  22.42 
 
 
558 aa  104  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359281  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.1 
 
 
575 aa  102  2e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3792  hemolysin activator HlyB  23.85 
 
 
575 aa  102  2e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.609243  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1381  potra domain, shlb-type family  30.12 
 
 
354 aa  99.8  1e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.163797 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  24.09 
 
 
583 aa  98.2  4e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  23.56 
 
 
582 aa  93.2  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4641  hemolysin activator protein  24.37 
 
 
570 aa  91.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4029  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.86 
 
 
591 aa  91.7  4e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000138882  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  23.2 
 
 
583 aa  91.3  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2610  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.86 
 
 
591 aa  90.9  6e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000294226  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.65 
 
 
565 aa  90.1  9e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4182  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.78 
 
 
592 aa  89  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0159904  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4169  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.07 
 
 
559 aa  88.6  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.987649 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1450  TPS family activation/secretion protein  24.79 
 
 
565 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.86 
 
 
591 aa  88.2  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4271  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.07 
 
 
560 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214751  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2045  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  23.06 
 
 
513 aa  88.2  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102664  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4055  hemolysin activator protein  35.56 
 
 
180 aa  84.3  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2157  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  22.69 
 
 
553 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2481  HlyB family hemolysin activator protein  27.27 
 
 
554 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2439  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  22.46 
 
 
553 aa  81.6  0.00000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00155436  decreased coverage  0.0000110124 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0154  hypothetical protein  43.27 
 
 
121 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1613  HlyB family hemolysin activator protein  25.62 
 
 
558 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0491  HlyB family hemolysin activator protein  25.62 
 
 
558 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.84 
 
 
583 aa  78.2  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.3 
 
 
585 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0802  HlyB family hemolysin activator protein  27.05 
 
 
551 aa  77  0.0000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  24.59 
 
 
575 aa  77  0.0000000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1821  HlyB family hemolysin activator protein  27.05 
 
 
554 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2342  HlyB family hemolysin activator protein  26.76 
 
 
554 aa  77  0.0000000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>