145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1054 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  100 
 
 		 576 aa  1192    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1056  hemolysin activation/secretion protein-like  82.29 
 
 		 576 aa  966    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000536803  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  31.64 
 
 		 554 aa  218  2e-55  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.12 
 
 		 554 aa  214  2.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  31.05 
 
 		 550 aa  210  5e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.09 
 
 		 592 aa  206  8e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  31.26 
 
 		 553 aa  201  3.9999999999999996e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.25 
 
 		 571 aa  192  1e-47  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.98 
 
 		 583 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.34 
 
 		 554 aa  186  8e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  29.76 
 
 		 548 aa  185  2.0000000000000003e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.69 
 
 		 585 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  28.42 
 
 		 607 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.77 
 
 		 572 aa  178  2e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  31.1 
 
 		 556 aa  176  9.999999999999999e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  29.79 
 
 		 545 aa  171  5e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  27.56 
 
 		 567 aa  170  7e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  27.56 
 
 		 567 aa  170  7e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  27.56 
 
 		 567 aa  170  7e-41  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.28 
 
 		 692 aa  169  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.84 
 
 		 586 aa  167  5e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.96 
 
 		 567 aa  164  3e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.73 
 
 		 578 aa  162  2e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.1 
 
 		 561 aa  159  1e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.17 
 
 		 596 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  25.17 
 
 		 596 aa  155  2e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0087  hypothetical protein  27.6 
 
 		 581 aa  154  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00223104  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.96 
 
 		 595 aa  153  8e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  25 
 
 		 596 aa  150  7e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.82 
 
 		 590 aa  148  3e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.01 
 
 		 569 aa  147  5e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  28.81 
 
 		 442 aa  145  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.63 
 
 		 545 aa  135  1.9999999999999998e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000416346 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.76 
 
 		 574 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  25.39 
 
 		 575 aa  133  1.0000000000000001e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0530  putative outer-membrane protein  25.05 
 
 		 551 aa  113  8.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1744  hypothetical protein  25.05 
 
 		 551 aa  113  8.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0764  putative outer-membrane protein  24.27 
 
 		 508 aa  112  2.0000000000000002e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.408754  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.29 
 
 		 747 aa  96.7  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  27.08 
 
 		 599 aa  94.4  6e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1531  hypothetical protein  22.84 
 
 		 597 aa  84.7  0.000000000000004  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.98 
 
 		 585 aa  82  0.00000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  24.79 
 
 		 558 aa  80.5  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1248  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.99 
 
 		 560 aa  79.7  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000540972  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0771  polypeptide-transport-associated domain protein, ShlB-type  27.67 
 
 		 310 aa  77.8  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.891277 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.18 
 
 		 560 aa  77  0.0000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1621  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.93 
 
 		 562 aa  77  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1518  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  24.93 
 
 		 562 aa  77  0.0000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  25.78 
 
 		 562 aa  75.5  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.4 
 
 		 610 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.5 
 
 		 562 aa  71.6  0.00000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  23.72 
 
 		 568 aa  71.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1084  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  25.5 
 
 		 562 aa  71.6  0.00000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  22.89 
 
 		 692 aa  71.6  0.00000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  22.67 
 
 		 568 aa  71.2  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.78 
 
 		 567 aa  69.7  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  24.21 
 
 		 569 aa  69.3  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2328  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.57 
 
 		 580 aa  68.2  0.0000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.06 
 
 		 608 aa  67.4  0.0000000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3523  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.63 
 
 		 548 aa  65.1  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  21.81 
 
 		 585 aa  65.1  0.000000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.79 
 
 		 549 aa  63.5  0.000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2721  outer membrane hemolysin activator protein  21.62 
 
 		 578 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.35 
 
 		 585 aa  63.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0351  hemolysin activation/secretion protein-like protein  24.48 
 
 		 607 aa  61.2  0.00000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410508  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.01 
 
 		 553 aa  61.2  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.3 
 
 		 563 aa  60.8  0.00000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  23.11 
 
 		 608 aa  60.5  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0055  hemolysin activation/secretion protein-like  23.97 
 
 		 533 aa  60.5  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193341  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.44 
 
 		 597 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  21.67 
 
 		 584 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  23.56 
 
 		 595 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  21.35 
 
 		 565 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  21.91 
 
 		 588 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1278  outer membrane hemolysin activator protein  23.17 
 
 		 585 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  20.53 
 
 		 570 aa  58.9  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.11 
 
 		 580 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1169  outer membrane hemolysin activator protein  23.59 
 
 		 586 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1655  hypothetical protein  22.97 
 
 		 588 aa  58.5  0.0000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2460  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.54 
 
 		 587 aa  58.5  0.0000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118018  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1125  hemolysin activation/secretion protein  22.86 
 
 		 585 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000467799  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1132  hemolysin activation/secretion protein  22.86 
 
 		 568 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.330921  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2800  outer membrane hemolysin activator protein  23.59 
 
 		 586 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2070  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.41 
 
 		 584 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  21.64 
 
 		 562 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  21.69 
 
 		 562 aa  58.2  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  22.69 
 
 		 582 aa  57  0.0000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  26.47 
 
 		 574 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0094  hemolysin activator HlyB  21.56 
 
 		 574 aa  56.6  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0432  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.13 
 
 		 592 aa  55.5  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3782  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  20.48 
 
 		 586 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.627469  normal  0.463538 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1613  HlyB family hemolysin activator protein  21.15 
 
 		 558 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1821  HlyB family hemolysin activator protein  21.15 
 
 		 554 aa  55.5  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2481  HlyB family hemolysin activator protein  20.77 
 
 		 554 aa  55.8  0.000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0491  HlyB family hemolysin activator protein  21.15 
 
 		 558 aa  55.8  0.000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0802  HlyB family hemolysin activator protein  21.03 
 
 		 551 aa  55.5  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0612  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.37 
 
 		 554 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2342  HlyB family hemolysin activator protein  20.94 
 
 		 554 aa  53.9  0.000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.83 
 
 		 561 aa  53.5  0.000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  21.31 
 
 		 562 aa  53.9  0.000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.612794 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>