83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1531 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1531  hypothetical protein  100 
 
 		 597 aa  1201    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1744  hypothetical protein  51.81 
 
 		 551 aa  536  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0530  putative outer-membrane protein  51.81 
 
 		 551 aa  536  1e-151  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0764  putative outer-membrane protein  45 
 
 		 508 aa  439  1e-121  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.408754  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  26.73 
 
 		 567 aa  143  8e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  26.73 
 
 		 567 aa  143  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  26.73 
 
 		 567 aa  143  9.999999999999999e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  25.98 
 
 		 607 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.47 
 
 		 583 aa  130  5.0000000000000004e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  27.43 
 
 		 442 aa  130  5.0000000000000004e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  26.26 
 
 		 550 aa  130  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.92 
 
 		 585 aa  130  9.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  27.19 
 
 		 554 aa  129  1.0000000000000001e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  27.49 
 
 		 553 aa  127  7e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.85 
 
 		 572 aa  126  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.48 
 
 		 554 aa  124  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  23.26 
 
 		 575 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.65 
 
 		 586 aa  113  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.68 
 
 		 567 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.58 
 
 		 595 aa  110  6e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.97 
 
 		 554 aa  107  7e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  23.54 
 
 		 596 aa  103  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.54 
 
 		 596 aa  103  7e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.05 
 
 		 574 aa  101  3e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  23.54 
 
 		 596 aa  101  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.59 
 
 		 592 aa  100  6e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.72 
 
 		 590 aa  99  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.65 
 
 		 561 aa  94.4  5e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  23.61 
 
 		 545 aa  94  8e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  22.07 
 
 		 558 aa  91.7  4e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  24.94 
 
 		 548 aa  90.1  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1056  hemolysin activation/secretion protein-like  24.88 
 
 		 576 aa  90.1  1e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000536803  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  22.54 
 
 		 576 aa  89.4  2e-16  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0843  hypothetical protein  45.78 
 
 		 84 aa  89.4  2e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.46901  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0841  hypothetical protein  56.52 
 
 		 80 aa  87.4  7e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.85048  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.84 
 
 		 578 aa  86.7  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.36 
 
 		 569 aa  85.9  0.000000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  24.14 
 
 		 556 aa  84.7  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.95 
 
 		 567 aa  84  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  20.5 
 
 		 692 aa  79.3  0.0000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0087  hypothetical protein  22.15 
 
 		 581 aa  75.5  0.000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00223104  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.3 
 
 		 692 aa  74.7  0.000000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.77 
 
 		 546 aa  65.9  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.07 
 
 		 571 aa  63.2  0.00000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.6 
 
 		 545 aa  63.5  0.00000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000416346 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0765  hypothetical protein  51.06 
 
 		 47 aa  62  0.00000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.649646  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  20.61 
 
 		 584 aa  60.8  0.00000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  20.13 
 
 		 1570 aa  60.8  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2328  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  20.23 
 
 		 580 aa  59.7  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.08 
 
 		 561 aa  59.7  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.05 
 
 		 573 aa  58.9  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  20.34 
 
 		 1391 aa  58.9  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  21.51 
 
 		 1349 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0055  hemolysin activation/secretion protein-like  23.34 
 
 		 533 aa  54.3  0.000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193341  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  22.86 
 
 		 569 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0842  hypothetical protein  42.03 
 
 		 73 aa  53.5  0.00001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.262326  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1064  surface antigen (D15)  21.66 
 
 		 587 aa  52  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459737 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  20.21 
 
 		 555 aa  51.6  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.07 
 
 		 585 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  19.92 
 
 		 585 aa  50.1  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  21.5 
 
 		 558 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  22.25 
 
 		 599 aa  49.7  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  20.93 
 
 		 558 aa  49.3  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  20.99 
 
 		 585 aa  48.5  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1285  hypothetical protein  19.41 
 
 		 565 aa  47.8  0.0005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000102142  hitchhiker  0.0000179621 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1621  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  18.7 
 
 		 562 aa  47.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1518  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  18.7 
 
 		 562 aa  47.4  0.0008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  21.94 
 
 		 588 aa  47  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.47 
 
 		 563 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  19.39 
 
 		 554 aa  46.6  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  19.85 
 
 		 538 aa  46.6  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02601  activation/secretion signal peptide protein  23.58 
 
 		 557 aa  45.8  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.415625 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.39 
 
 		 554 aa  46.2  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55380  hypothetical protein  18.32 
 
 		 544 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0347835 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2095  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.41 
 
 		 592 aa  45.8  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4818  hypothetical protein  18.56 
 
 		 544 aa  46.2  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  18.72 
 
 		 747 aa  45.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  20.27 
 
 		 562 aa  45.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0815  surface antigen (D15)  33.33 
 
 		 961 aa  45.1  0.004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.9 
 
 		 559 aa  44.3  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  18.18 
 
 		 543 aa  43.9  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  19.85 
 
 		 608 aa  43.9  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  18.55 
 
 		 562 aa  43.5  0.01  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>