159 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_0509 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  98.75 
 
 
562 aa  1135    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2328  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  62.22 
 
 
580 aa  714    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1621  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  81.46 
 
 
562 aa  956    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0432  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  62.5 
 
 
592 aa  697    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  100 
 
 
562 aa  1149    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1518  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  81.46 
 
 
562 aa  956    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1084  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  99.29 
 
 
562 aa  1142    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02577  activation/secretion protein  48.85 
 
 
578 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6356  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  46.49 
 
 
563 aa  483  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4522  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  46.58 
 
 
582 aa  480  1e-134  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0112  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  43.75 
 
 
574 aa  456  1e-127  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.034369 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2120  outer membrane hemolysin activator protein  43.21 
 
 
581 aa  443  1e-123  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2040  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  43.69 
 
 
581 aa  444  1e-123  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.354299  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0484  hemolysin activator HlyB  43.78 
 
 
572 aa  434  1e-120  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02975  outer membrane hemolysin activator protein  43.03 
 
 
570 aa  432  1e-120  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0371  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  42.91 
 
 
585 aa  423  1e-117  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4078  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  39.4 
 
 
581 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0086  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.94 
 
 
587 aa  360  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4076  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  37.36 
 
 
556 aa  357  3.9999999999999996e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3879  outer membrane hemolysin activator protein  38.03 
 
 
561 aa  355  1e-96  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4730  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  35.65 
 
 
550 aa  355  1e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.370373  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2842  putative activation/secretion signal peptide protein, HlyB like  39.22 
 
 
584 aa  351  2e-95  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0483717  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2721  outer membrane hemolysin activator protein  38.07 
 
 
578 aa  351  3e-95  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1132  hemolysin activation/secretion protein  37.62 
 
 
568 aa  345  1e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.330921  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1278  outer membrane hemolysin activator protein  37.76 
 
 
585 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2070  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.92 
 
 
584 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7312  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  38.55 
 
 
595 aa  343  4e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027625  normal  0.0739719 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1125  hemolysin activation/secretion protein  37.43 
 
 
585 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000467799  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3782  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.55 
 
 
586 aa  343  5e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.627469  normal  0.463538 
 
 
-
 
NC_003296  RS03929  activation/secretion signal peptide protein  38.23 
 
 
590 aa  339  5.9999999999999996e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0888  activation/secretion protein  37.92 
 
 
590 aa  339  8e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3644  putative activator/secretion protein  37.25 
 
 
584 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5729  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.94 
 
 
594 aa  333  4e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503116  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2800  outer membrane hemolysin activator protein  35.74 
 
 
586 aa  333  4e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4292  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.13 
 
 
593 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185481  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1779  activation/secretion signal peptide protein  36.35 
 
 
564 aa  331  2e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000346081  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1169  outer membrane hemolysin activator protein  36.33 
 
 
586 aa  331  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5340  hemolysin activator translocator  35.17 
 
 
588 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  34.69 
 
 
563 aa  311  2e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0094  hemolysin activator HlyB  35.34 
 
 
574 aa  301  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0375  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.84 
 
 
568 aa  295  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0419  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  33.14 
 
 
570 aa  278  2e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1537  putative hemolysin activation protein HecB  29.3 
 
 
566 aa  270  7e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.395998  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1282  hemolysin activator-related protein  29.03 
 
 
539 aa  249  1e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.395972 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3716  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.22 
 
 
593 aa  224  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1381  potra domain, shlb-type family  66.24 
 
 
354 aa  224  4e-57  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.163797 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0608  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase; ATP-PRT)  29.27 
 
 
590 aa  222  9.999999999999999e-57  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1681  putative periplasmic protein  27.67 
 
 
590 aa  221  1.9999999999999999e-56  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5132  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.24 
 
 
566 aa  209  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.29 
 
 
554 aa  209  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.68 
 
 
554 aa  205  1e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  31.02 
 
 
569 aa  203  6e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.24 
 
 
557 aa  202  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.95 
 
 
549 aa  201  3e-50  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  30.12 
 
 
565 aa  201  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  32.45 
 
 
562 aa  200  5e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  32.2 
 
 
562 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  31.96 
 
 
562 aa  196  6e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.36 
 
 
560 aa  195  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  30.99 
 
 
570 aa  195  2e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.72 
 
 
558 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.37 
 
 
585 aa  182  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.99 
 
 
568 aa  167  2.9999999999999998e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.87 
 
 
591 aa  161  3e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4029  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.53 
 
 
591 aa  160  4e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000138882  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2610  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.7 
 
 
591 aa  160  5e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000294226  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.02 
 
 
573 aa  160  7e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0072  HlyB family hemolysin activator protein  37.5 
 
 
294 aa  159  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.569784  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4182  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.19 
 
 
592 aa  159  1e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0159904  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0300  hemolysin activator protein  25.14 
 
 
562 aa  153  8e-36  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00625551  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  27.93 
 
 
582 aa  146  8.000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4055  hemolysin activator protein  41.38 
 
 
180 aa  142  9.999999999999999e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2157  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  24.51 
 
 
553 aa  139  1e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2439  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  24.66 
 
 
553 aa  138  2e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00155436  decreased coverage  0.0000110124 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2045  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  24.08 
 
 
513 aa  138  2e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102664  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.36 
 
 
565 aa  138  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3792  hemolysin activator HlyB  26.81 
 
 
575 aa  137  4e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.609243  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4481  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  25.86 
 
 
558 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359281  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  27.18 
 
 
583 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2481  HlyB family hemolysin activator protein  25.83 
 
 
554 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  27.77 
 
 
583 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.3 
 
 
610 aa  130  6e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.65 
 
 
575 aa  127  7e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1821  HlyB family hemolysin activator protein  25.44 
 
 
554 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1613  HlyB family hemolysin activator protein  25.43 
 
 
558 aa  126  9e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0491  HlyB family hemolysin activator protein  25.43 
 
 
558 aa  126  9e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0802  HlyB family hemolysin activator protein  25.66 
 
 
551 aa  126  1e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.21 
 
 
608 aa  125  3e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4641  hemolysin activator protein  26.73 
 
 
570 aa  124  6e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1757  HlyB family hemolysin activator protein  25.31 
 
 
520 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.598538  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2342  HlyB family hemolysin activator protein  24.85 
 
 
554 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.26 
 
 
580 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  24.86 
 
 
602 aa  111  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.67 
 
 
597 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1450  TPS family activation/secretion protein  25.57 
 
 
565 aa  107  5e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4169  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.32 
 
 
559 aa  106  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.987649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4271  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.42 
 
 
560 aa  103  9e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214751  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0745  haemolysin secretion/activation protein ShlB/FhaC/HecB  23.06 
 
 
547 aa  99.4  1e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0153  outer membrane hemolysin activator protein  43.22 
 
 
118 aa  89  2e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620325  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.89 
 
 
561 aa  82.8  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0850333 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>