162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_4641 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007492  Pfl01_3792  hemolysin activator HlyB  67.93 
 
 
575 aa  730    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.609243  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4641  hemolysin activator protein  100 
 
 
570 aa  1124    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4271  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  45.74 
 
 
560 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214751  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1450  TPS family activation/secretion protein  45.55 
 
 
565 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4169  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  44.08 
 
 
559 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.987649 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0300  hemolysin activator protein  35.66 
 
 
562 aa  281  3e-74  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00625551  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4481  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  36.36 
 
 
558 aa  248  3e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359281  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  32.46 
 
 
565 aa  233  8.000000000000001e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  32.43 
 
 
562 aa  232  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  32.32 
 
 
562 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  32.43 
 
 
562 aa  231  3e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  32.67 
 
 
585 aa  217  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2157  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  32.24 
 
 
553 aa  214  3.9999999999999995e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2439  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  32.91 
 
 
553 aa  214  3.9999999999999995e-54  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00155436  decreased coverage  0.0000110124 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2045  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  33.33 
 
 
513 aa  214  4.9999999999999996e-54  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102664  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  30.93 
 
 
569 aa  203  7e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  30.3 
 
 
570 aa  196  8.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.76 
 
 
560 aa  195  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.52 
 
 
549 aa  183  6e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.36 
 
 
573 aa  183  7e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2800  outer membrane hemolysin activator protein  29.58 
 
 
586 aa  182  1e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1169  outer membrane hemolysin activator protein  29.58 
 
 
586 aa  182  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.91 
 
 
554 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.91 
 
 
557 aa  177  5e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  30.21 
 
 
558 aa  176  7e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.16 
 
 
554 aa  175  1.9999999999999998e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3782  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.91 
 
 
586 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.627469  normal  0.463538 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2070  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.73 
 
 
584 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3879  outer membrane hemolysin activator protein  31.2 
 
 
561 aa  171  3e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2721  outer membrane hemolysin activator protein  31.62 
 
 
578 aa  168  2e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7312  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.85 
 
 
595 aa  168  2e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027625  normal  0.0739719 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  29.41 
 
 
582 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5729  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.32 
 
 
594 aa  168  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503116  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1132  hemolysin activation/secretion protein  29.44 
 
 
568 aa  167  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.330921  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1125  hemolysin activation/secretion protein  29.34 
 
 
585 aa  166  9e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000467799  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1278  outer membrane hemolysin activator protein  29.79 
 
 
585 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4292  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.48 
 
 
593 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185481  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.95 
 
 
591 aa  164  5.0000000000000005e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.06 
 
 
565 aa  163  7e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2610  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.12 
 
 
591 aa  162  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000294226  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4029  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.79 
 
 
591 aa  159  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000138882  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.75 
 
 
608 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4730  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  28.38 
 
 
550 aa  157  6e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.370373  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2842  putative activation/secretion signal peptide protein, HlyB like  28.43 
 
 
584 aa  153  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0483717  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3644  putative activator/secretion protein  29.61 
 
 
584 aa  153  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.9 
 
 
568 aa  150  6e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.44 
 
 
610 aa  150  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4182  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.31 
 
 
592 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0159904  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5340  hemolysin activator translocator  27.68 
 
 
588 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03929  activation/secretion signal peptide protein  26.83 
 
 
590 aa  147  5e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0888  activation/secretion protein  26.74 
 
 
590 aa  147  6e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1621  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.48 
 
 
562 aa  140  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1518  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  26.48 
 
 
562 aa  140  7e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  28.28 
 
 
583 aa  139  1e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.83 
 
 
575 aa  139  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  27.39 
 
 
583 aa  137  4e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  27.89 
 
 
602 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0432  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.2 
 
 
592 aa  135  1.9999999999999998e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0371  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.14 
 
 
585 aa  135  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2328  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.54 
 
 
580 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  25.93 
 
 
562 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1084  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  26.45 
 
 
562 aa  131  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.6 
 
 
562 aa  130  7.000000000000001e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1282  hemolysin activator-related protein  24.12 
 
 
539 aa  130  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.395972 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4078  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.18 
 
 
581 aa  125  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.14 
 
 
580 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02577  activation/secretion protein  26.42 
 
 
578 aa  124  6e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0802  HlyB family hemolysin activator protein  27.76 
 
 
551 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1821  HlyB family hemolysin activator protein  27.76 
 
 
554 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1613  HlyB family hemolysin activator protein  27.76 
 
 
558 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0491  HlyB family hemolysin activator protein  27.76 
 
 
558 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.03 
 
 
597 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1757  HlyB family hemolysin activator protein  27.8 
 
 
520 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.598538  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6356  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.42 
 
 
563 aa  120  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2040  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.79 
 
 
581 aa  120  7e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.354299  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4522  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.31 
 
 
582 aa  119  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2342  HlyB family hemolysin activator protein  27.85 
 
 
554 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02975  outer membrane hemolysin activator protein  26.68 
 
 
570 aa  118  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2481  HlyB family hemolysin activator protein  26.45 
 
 
554 aa  117  5e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2120  outer membrane hemolysin activator protein  25.25 
 
 
581 aa  117  6e-25  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0112  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.04 
 
 
574 aa  113  9e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.034369 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0094  hemolysin activator HlyB  23.92 
 
 
574 aa  108  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4076  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  23.97 
 
 
556 aa  103  6e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0086  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.76 
 
 
587 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0375  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.65 
 
 
568 aa  102  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1779  activation/secretion signal peptide protein  25.14 
 
 
564 aa  100  6e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000346081  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0608  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase; ATP-PRT)  24.1 
 
 
590 aa  100  7e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1681  putative periplasmic protein  23.89 
 
 
590 aa  99.4  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0745  haemolysin secretion/activation protein ShlB/FhaC/HecB  22.3 
 
 
547 aa  96.7  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0484  hemolysin activator HlyB  25.43 
 
 
572 aa  95.5  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.26 
 
 
563 aa  95.5  3e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1537  putative hemolysin activation protein HecB  23.24 
 
 
566 aa  94.7  4e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.395998  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3716  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.26 
 
 
593 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0419  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.38 
 
 
570 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.41 
 
 
567 aa  78.6  0.0000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5132  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.11 
 
 
566 aa  78.6  0.0000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.3 
 
 
583 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.03 
 
 
567 aa  68.2  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  24.89 
 
 
607 aa  67.4  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0153  outer membrane hemolysin activator protein  38.18 
 
 
118 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620325  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>