145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_4271 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_1450  TPS family activation/secretion protein  95.71 
 
 
565 aa  1069    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4271  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 
560 aa  1117    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214751  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4169  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  68.93 
 
 
559 aa  763    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.987649 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4641  hemolysin activator protein  47.4 
 
 
570 aa  400  9.999999999999999e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3792  hemolysin activator HlyB  45.09 
 
 
575 aa  396  1e-109  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.609243  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4481  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  34.54 
 
 
558 aa  215  9.999999999999999e-55  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359281  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0300  hemolysin activator protein  31.09 
 
 
562 aa  211  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00625551  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  31.58 
 
 
562 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  31.58 
 
 
565 aa  182  1e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  30.69 
 
 
585 aa  179  2e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  31.2 
 
 
562 aa  178  2e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  31.2 
 
 
562 aa  177  4e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.34 
 
 
573 aa  172  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  31.54 
 
 
570 aa  171  3e-41  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  30.19 
 
 
569 aa  169  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.07 
 
 
560 aa  168  2e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.25 
 
 
565 aa  150  5e-35  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7312  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.5 
 
 
595 aa  148  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027625  normal  0.0739719 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1132  hemolysin activation/secretion protein  29.82 
 
 
568 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.330921  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3879  outer membrane hemolysin activator protein  30.25 
 
 
561 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1125  hemolysin activation/secretion protein  29.82 
 
 
585 aa  147  6e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000467799  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1278  outer membrane hemolysin activator protein  29.59 
 
 
585 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2070  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.98 
 
 
584 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2721  outer membrane hemolysin activator protein  28.71 
 
 
578 aa  145  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2439  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  26.08 
 
 
553 aa  143  8e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00155436  decreased coverage  0.0000110124 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3782  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.17 
 
 
586 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.627469  normal  0.463538 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2800  outer membrane hemolysin activator protein  27.36 
 
 
586 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1169  outer membrane hemolysin activator protein  27.36 
 
 
586 aa  140  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4292  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.47 
 
 
593 aa  138  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185481  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5729  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.71 
 
 
594 aa  137  5e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503116  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2157  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  25.67 
 
 
553 aa  137  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5340  hemolysin activator translocator  29.09 
 
 
588 aa  137  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.39 
 
 
557 aa  136  8e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03929  activation/secretion signal peptide protein  29.14 
 
 
590 aa  136  9e-31  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.37 
 
 
549 aa  136  9e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.7 
 
 
608 aa  136  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2045  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  26.24 
 
 
513 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102664  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0888  activation/secretion protein  29.13 
 
 
590 aa  134  3e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.21 
 
 
575 aa  132  2.0000000000000002e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  27.65 
 
 
582 aa  131  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2842  putative activation/secretion signal peptide protein, HlyB like  28.42 
 
 
584 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0483717  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.25 
 
 
554 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.8 
 
 
554 aa  128  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3644  putative activator/secretion protein  28.54 
 
 
584 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.32 
 
 
558 aa  126  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  25.54 
 
 
583 aa  121  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1282  hemolysin activator-related protein  23.08 
 
 
539 aa  121  3.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.395972 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4730  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  23.98 
 
 
550 aa  119  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.370373  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  26.36 
 
 
583 aa  118  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  27.1 
 
 
602 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1518  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  26.52 
 
 
562 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1621  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.52 
 
 
562 aa  112  2.0000000000000002e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.06 
 
 
568 aa  109  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0371  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.6 
 
 
585 aa  108  2e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1757  HlyB family hemolysin activator protein  28.86 
 
 
520 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.598538  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0802  HlyB family hemolysin activator protein  28.86 
 
 
551 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1613  HlyB family hemolysin activator protein  28.86 
 
 
558 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1821  HlyB family hemolysin activator protein  28.86 
 
 
554 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0491  HlyB family hemolysin activator protein  28.86 
 
 
558 aa  106  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2328  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.63 
 
 
580 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.71 
 
 
580 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  26.42 
 
 
562 aa  103  9e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2342  HlyB family hemolysin activator protein  28.99 
 
 
554 aa  102  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1084  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  25.8 
 
 
562 aa  102  2e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.89 
 
 
562 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.11 
 
 
610 aa  102  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.63 
 
 
567 aa  99.8  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2481  HlyB family hemolysin activator protein  28.25 
 
 
554 aa  99.8  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02975  outer membrane hemolysin activator protein  23.7 
 
 
570 aa  98.6  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0432  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.52 
 
 
592 aa  99.4  2e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4029  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.04 
 
 
591 aa  99  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000138882  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4522  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.69 
 
 
582 aa  99.4  2e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2610  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.75 
 
 
591 aa  97.8  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000294226  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2040  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.16 
 
 
581 aa  96.7  9e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.354299  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.75 
 
 
591 aa  96.7  9e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4182  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.43 
 
 
592 aa  96.3  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0159904  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6356  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.75 
 
 
563 aa  95.9  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4076  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  23.05 
 
 
556 aa  93.2  1e-17  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0745  haemolysin secretion/activation protein ShlB/FhaC/HecB  22.93 
 
 
547 aa  92.4  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.47 
 
 
597 aa  92.4  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2120  outer membrane hemolysin activator protein  24.51 
 
 
581 aa  89.7  1e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0086  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.61 
 
 
587 aa  89.4  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4078  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.03 
 
 
581 aa  89.4  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0375  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.41 
 
 
568 aa  88.6  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1537  putative hemolysin activation protein HecB  22.26 
 
 
566 aa  88.6  3e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.395998  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0112  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.72 
 
 
574 aa  88.2  3e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.034369 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0094  hemolysin activator HlyB  24.07 
 
 
574 aa  88.2  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02577  activation/secretion protein  23.9 
 
 
578 aa  86.3  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0419  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.41 
 
 
570 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0608  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase; ATP-PRT)  22.34 
 
 
590 aa  82.8  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3716  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.95 
 
 
593 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1681  putative periplasmic protein  21.71 
 
 
590 aa  79.3  0.0000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1779  activation/secretion signal peptide protein  24.09 
 
 
564 aa  77.4  0.0000000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000346081  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5132  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.81 
 
 
566 aa  77  0.0000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.86 
 
 
563 aa  74.7  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.21 
 
 
583 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.14 
 
 
585 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0484  hemolysin activator HlyB  23.77 
 
 
572 aa  68.2  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  26.09 
 
 
553 aa  68.2  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.43 
 
 
572 aa  67.4  0.0000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>