173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_5358 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  89.97 
 
 
597 aa  1044    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 
580 aa  1175    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  74.56 
 
 
610 aa  894    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  52.46 
 
 
608 aa  570  1e-161  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  50.34 
 
 
602 aa  545  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  49.05 
 
 
582 aa  536  1e-151  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  48.37 
 
 
583 aa  533  1e-150  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  48.32 
 
 
583 aa  525  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  50.09 
 
 
575 aa  522  1e-147  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  37.27 
 
 
565 aa  324  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  30.65 
 
 
549 aa  194  5e-48  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.11 
 
 
557 aa  191  4e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.38 
 
 
554 aa  189  9e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.74 
 
 
554 aa  182  1e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.79 
 
 
558 aa  179  1e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0300  hemolysin activator protein  28.45 
 
 
562 aa  173  1e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00625551  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.77 
 
 
560 aa  170  6e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  29.59 
 
 
570 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.79 
 
 
568 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.77 
 
 
585 aa  160  6e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  28.8 
 
 
569 aa  159  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4029  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.11 
 
 
591 aa  156  9e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000138882  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2721  outer membrane hemolysin activator protein  28.57 
 
 
578 aa  156  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.48 
 
 
573 aa  156  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2610  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.11 
 
 
591 aa  155  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000294226  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4182  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.15 
 
 
592 aa  155  2.9999999999999998e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0159904  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4292  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.3 
 
 
593 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185481  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.74 
 
 
591 aa  152  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0888  activation/secretion protein  28.86 
 
 
590 aa  152  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2070  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.51 
 
 
584 aa  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03929  activation/secretion signal peptide protein  28.81 
 
 
590 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3644  putative activator/secretion protein  28.52 
 
 
584 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1278  outer membrane hemolysin activator protein  29.85 
 
 
585 aa  148  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5340  hemolysin activator translocator  28.44 
 
 
588 aa  148  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1125  hemolysin activation/secretion protein  29.63 
 
 
585 aa  148  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000467799  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1132  hemolysin activation/secretion protein  29.63 
 
 
568 aa  148  3e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.330921  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5729  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.44 
 
 
594 aa  148  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503116  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  26.89 
 
 
562 aa  147  5e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  26.69 
 
 
562 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3879  outer membrane hemolysin activator protein  28.44 
 
 
561 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2800  outer membrane hemolysin activator protein  27.2 
 
 
586 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1169  outer membrane hemolysin activator protein  27.2 
 
 
586 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4481  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  28.48 
 
 
558 aa  141  3.9999999999999997e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359281  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  26.8 
 
 
565 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7312  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.19 
 
 
595 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027625  normal  0.0739719 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  26.4 
 
 
562 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2842  putative activation/secretion signal peptide protein, HlyB like  28.25 
 
 
584 aa  135  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0483717  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6356  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.26 
 
 
563 aa  134  6e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02975  outer membrane hemolysin activator protein  26.15 
 
 
570 aa  133  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1621  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.96 
 
 
562 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0112  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.12 
 
 
574 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.034369 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1518  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  25.96 
 
 
562 aa  132  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2045  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  25.79 
 
 
513 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102664  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2328  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.5 
 
 
580 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2120  outer membrane hemolysin activator protein  27.23 
 
 
581 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2439  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  26.59 
 
 
553 aa  129  2.0000000000000002e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00155436  decreased coverage  0.0000110124 
 
 
-
 
NC_003296  RS02577  activation/secretion protein  26.97 
 
 
578 aa  128  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0432  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.62 
 
 
592 aa  128  3e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4730  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  24.95 
 
 
550 aa  127  6e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.370373  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3782  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.45 
 
 
586 aa  127  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.627469  normal  0.463538 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2157  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  26.37 
 
 
553 aa  126  1e-27  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2040  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.78 
 
 
581 aa  123  8e-27  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.354299  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3792  hemolysin activator HlyB  28.6 
 
 
575 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.609243  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4641  hemolysin activator protein  27.14 
 
 
570 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  26.36 
 
 
562 aa  122  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1084  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  26.36 
 
 
562 aa  121  3.9999999999999996e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4522  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.31 
 
 
582 aa  121  4.9999999999999996e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.98 
 
 
562 aa  120  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.48 
 
 
563 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0094  hemolysin activator HlyB  26.15 
 
 
574 aa  114  6e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0484  hemolysin activator HlyB  24.87 
 
 
572 aa  111  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1779  activation/secretion signal peptide protein  25.15 
 
 
564 aa  106  1e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000346081  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2342  HlyB family hemolysin activator protein  24.22 
 
 
554 aa  106  1e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3716  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.52 
 
 
593 aa  104  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1450  TPS family activation/secretion protein  25.71 
 
 
565 aa  104  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0371  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.86 
 
 
585 aa  104  5e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1821  HlyB family hemolysin activator protein  23.73 
 
 
554 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4271  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.71 
 
 
560 aa  103  7e-21  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214751  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1613  HlyB family hemolysin activator protein  23.73 
 
 
558 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0491  HlyB family hemolysin activator protein  23.73 
 
 
558 aa  103  8e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0802  HlyB family hemolysin activator protein  23.85 
 
 
551 aa  103  9e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4076  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  25.35 
 
 
556 aa  102  2e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2481  HlyB family hemolysin activator protein  23.2 
 
 
554 aa  101  3e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1537  putative hemolysin activation protein HecB  22.72 
 
 
566 aa  100  1e-19  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.395998  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0608  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase; ATP-PRT)  24.54 
 
 
590 aa  97.1  8e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1681  putative periplasmic protein  24.54 
 
 
590 aa  97.1  9e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4169  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.21 
 
 
559 aa  96.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.987649 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1757  HlyB family hemolysin activator protein  23.68 
 
 
520 aa  95.9  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.598538  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0375  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.37 
 
 
568 aa  95.5  2e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0086  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25 
 
 
587 aa  96.3  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  23.83 
 
 
558 aa  92.8  1e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0745  haemolysin secretion/activation protein ShlB/FhaC/HecB  21.52 
 
 
547 aa  89  2e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  23.99 
 
 
588 aa  88.6  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.23 
 
 
747 aa  86.7  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4078  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.77 
 
 
581 aa  87  0.000000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  23.5 
 
 
553 aa  85.5  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5132  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.54 
 
 
566 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.3 
 
 
578 aa  82.4  0.00000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2104  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.35 
 
 
538 aa  80.9  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.770543 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.25 
 
 
592 aa  78.6  0.0000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.763446 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>