156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0888 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0888  activation/secretion protein  100 
 
 		 590 aa  1204    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_003296  RS03929  activation/secretion signal peptide protein  94.41 
 
 		 590 aa  1105    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1278  outer membrane hemolysin activator protein  66.92 
 
 		 585 aa  758    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1169  outer membrane hemolysin activator protein  63.71 
 
 		 586 aa  729    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4292  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  62.04 
 
 		 593 aa  730    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2721  outer membrane hemolysin activator protein  68.62 
 
 		 578 aa  800    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2842  putative activation/secretion signal peptide protein, HlyB like  67.67 
 
 		 584 aa  739    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0483717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3644  putative activator/secretion protein  65.03 
 
 		 584 aa  714    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5340  hemolysin activator translocator  73.26 
 
 		 588 aa  859    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3782  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  67.49 
 
 		 586 aa  768    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.627469  normal  0.463538 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7312  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  65.53 
 
 		 595 aa  750    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027625  normal  0.0739719 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1125  hemolysin activation/secretion protein  67.11 
 
 		 585 aa  759    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000467799  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1132  hemolysin activation/secretion protein  67.3 
 
 		 568 aa  759    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.330921  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3879  outer membrane hemolysin activator protein  69.17 
 
 		 561 aa  809    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2800  outer membrane hemolysin activator protein  63.08 
 
 		 586 aa  736    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5729  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  64.56 
 
 		 594 aa  709    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503116  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2070  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  68.81 
 
 		 584 aa  775    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02577  activation/secretion protein  42.58 
 
 		 578 aa  403  1e-111  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6356  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  42.57 
 
 		 563 aa  400  9.999999999999999e-111  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4522  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  40.94 
 
 		 582 aa  382  1e-105  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0072  HlyB family hemolysin activator protein  66.79 
 
 		 294 aa  380  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.569784  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2040  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  40.74 
 
 		 581 aa  369  1e-101  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.354299  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0112  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  40.57 
 
 		 574 aa  366  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.034369 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2120  outer membrane hemolysin activator protein  40.85 
 
 		 581 aa  368  1e-100  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2328  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  38.9 
 
 		 580 aa  363  4e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1518  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  36.64 
 
 		 562 aa  354  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1621  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.64 
 
 		 562 aa  354  2e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0432  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  37.75 
 
 		 592 aa  354  2e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02975  outer membrane hemolysin activator protein  40.03 
 
 		 570 aa  352  8e-96  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  36.68 
 
 		 562 aa  352  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.68 
 
 		 562 aa  350  3e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1084  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  36.68 
 
 		 562 aa  349  6e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0484  hemolysin activator HlyB  38.18 
 
 		 572 aa  334  3e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4078  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  36.74 
 
 		 581 aa  328  2.0000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  35.87 
 
 		 563 aa  327  4.0000000000000003e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1779  activation/secretion signal peptide protein  36.92 
 
 		 564 aa  325  2e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000346081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0371  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  37.87 
 
 		 585 aa  313  4.999999999999999e-84  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0094  hemolysin activator HlyB  33.8 
 
 		 574 aa  286  7e-76  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0375  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.83 
 
 		 568 aa  261  3e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0419  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.21 
 
 		 570 aa  251  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4730  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  30.81 
 
 		 550 aa  251  3e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.370373  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4076  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  32.07 
 
 		 556 aa  242  2e-62  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0608  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase; ATP-PRT)  30.09 
 
 		 590 aa  241  2.9999999999999997e-62  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0086  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.5 
 
 		 587 aa  239  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1681  putative periplasmic protein  29.48 
 
 		 590 aa  237  6e-61  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1537  putative hemolysin activation protein HecB  28.01 
 
 		 566 aa  232  2e-59  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.395998  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  31.4 
 
 		 562 aa  224  4e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  31.61 
 
 		 565 aa  220  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3716  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.5 
 
 		 593 aa  216  8e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  31.21 
 
 		 562 aa  213  7e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  31.21 
 
 		 562 aa  213  7.999999999999999e-54  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.9 
 
 		 557 aa  213  7.999999999999999e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.4 
 
 		 560 aa  211  4e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  30.43 
 
 		 569 aa  209  1e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5132  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.34 
 
 		 566 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  30.44 
 
 		 549 aa  206  1e-51  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.73 
 
 		 585 aa  198  2.0000000000000003e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  30.55 
 
 		 570 aa  196  8.000000000000001e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.32 
 
 		 558 aa  195  2e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.52 
 
 		 554 aa  192  1e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  30.55 
 
 		 554 aa  189  9e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1282  hemolysin activator-related protein  28.08 
 
 		 539 aa  189  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.395972 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.76 
 
 		 573 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.1 
 
 		 568 aa  183  8.000000000000001e-45  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0153  outer membrane hemolysin activator protein  67.83 
 
 		 118 aa  179  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.620325  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0154  hypothetical protein  66.95 
 
 		 121 aa  163  6e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3792  hemolysin activator HlyB  27.8 
 
 		 575 aa  160  4e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.609243  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.81 
 
 		 610 aa  160  7e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  27.39 
 
 		 582 aa  159  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.28 
 
 		 591 aa  154  5.9999999999999996e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.23 
 
 		 580 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0300  hemolysin activator protein  24.42 
 
 		 562 aa  151  3e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00625551  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1986  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  63.64 
 
 		 166 aa  151  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2610  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.72 
 
 		 591 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000294226  n/a   
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4182  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.16 
 
 		 592 aa  147  5e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0159904  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.11 
 
 		 565 aa  147  5e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4029  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.53 
 
 		 591 aa  147  7.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000138882  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.69 
 
 		 597 aa  145  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.46 
 
 		 608 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  26.83 
 
 		 602 aa  143  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1450  TPS family activation/secretion protein  27.72 
 
 		 565 aa  140  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2481  HlyB family hemolysin activator protein  26.82 
 
 		 554 aa  139  1e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4641  hemolysin activator protein  26.52 
 
 		 570 aa  139  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0802  HlyB family hemolysin activator protein  26.42 
 
 		 551 aa  139  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1613  HlyB family hemolysin activator protein  26.42 
 
 		 558 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1821  HlyB family hemolysin activator protein  26.42 
 
 		 554 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0491  HlyB family hemolysin activator protein  26.42 
 
 		 558 aa  139  2e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4271  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.99 
 
 		 560 aa  139  2e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2342  HlyB family hemolysin activator protein  25.87 
 
 		 554 aa  136  9e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1757  HlyB family hemolysin activator protein  27.9 
 
 		 520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.598538  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2439  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  25.37 
 
 		 553 aa  132  3e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00155436  decreased coverage  0.0000110124 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2045  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  25.37 
 
 		 513 aa  130  5.0000000000000004e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102664  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4481  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  24.95 
 
 		 558 aa  128  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359281  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2157  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  25.12 
 
 		 553 aa  127  4.0000000000000003e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4169  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.61 
 
 		 559 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.987649 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.56 
 
 		 575 aa  110  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  24.51 
 
 		 583 aa  109  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0745  haemolysin secretion/activation protein ShlB/FhaC/HecB  23.62 
 
 		 547 aa  108  3e-22  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1381  potra domain, shlb-type family  38.24 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.163797 
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  24.78 
 
 		 583 aa  104  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>