113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_0086 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_4076  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  97.12 
 
 
556 aa  1118    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0086  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 
587 aa  1214    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0509  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  35.94 
 
 
562 aa  360  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1518  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  35.07 
 
 
562 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1084  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  35.76 
 
 
562 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0571  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.76 
 
 
562 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1621  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.07 
 
 
562 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2328  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  36.06 
 
 
580 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.398356  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0432  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  36.98 
 
 
592 aa  356  6.999999999999999e-97  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.975087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4055  hemolysin activator protein  99.42 
 
 
180 aa  352  8.999999999999999e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6356  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  34.69 
 
 
563 aa  302  1e-80  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4522  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  34.69 
 
 
582 aa  296  9e-79  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02577  activation/secretion protein  31.4 
 
 
578 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02975  outer membrane hemolysin activator protein  32.71 
 
 
570 aa  268  2e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0371  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  32.5 
 
 
585 aa  263  6e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0112  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  30.56 
 
 
574 aa  260  4e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.034369 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2040  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.65 
 
 
581 aa  254  4.0000000000000004e-66  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.354299  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0484  hemolysin activator HlyB  31.78 
 
 
572 aa  252  1e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2120  outer membrane hemolysin activator protein  29.65 
 
 
581 aa  250  4e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4730  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  31.24 
 
 
550 aa  246  9.999999999999999e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.370373  normal  0.925288 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2721  outer membrane hemolysin activator protein  29.89 
 
 
578 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3644  putative activator/secretion protein  32.67 
 
 
584 aa  240  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1125  hemolysin activation/secretion protein  31.49 
 
 
585 aa  239  9e-62  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000467799  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1132  hemolysin activation/secretion protein  31.32 
 
 
568 aa  239  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.330921  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0888  activation/secretion protein  32.73 
 
 
590 aa  238  2e-61  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.60277 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1278  outer membrane hemolysin activator protein  31.32 
 
 
585 aa  238  2e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2070  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.26 
 
 
584 aa  238  3e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2842  putative activation/secretion signal peptide protein, HlyB like  32.72 
 
 
584 aa  237  4e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0483717  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3879  outer membrane hemolysin activator protein  31.55 
 
 
561 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3782  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.44 
 
 
586 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.627469  normal  0.463538 
 
 
-
 
NC_003296  RS03929  activation/secretion signal peptide protein  32.19 
 
 
590 aa  231  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.217288 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1169  outer membrane hemolysin activator protein  29.74 
 
 
586 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.640849  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2800  outer membrane hemolysin activator protein  28.95 
 
 
586 aa  229  1e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5729  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.12 
 
 
594 aa  226  7e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.503116  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4292  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.58 
 
 
593 aa  225  1e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.185481  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5340  hemolysin activator translocator  30.56 
 
 
588 aa  225  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4078  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.95 
 
 
581 aa  223  8e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7312  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.73 
 
 
595 aa  222  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.027625  normal  0.0739719 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0375  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.28 
 
 
568 aa  206  1e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.716878 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  30.19 
 
 
563 aa  204  3e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1779  activation/secretion signal peptide protein  28.81 
 
 
564 aa  194  3e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.00000346081  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1282  hemolysin activator-related protein  26.69 
 
 
539 aa  194  3e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.395972 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0419  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.21 
 
 
570 aa  191  2e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.390658 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0094  hemolysin activator HlyB  27.53 
 
 
574 aa  188  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5132  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.59 
 
 
566 aa  171  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.506347 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3716  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.61 
 
 
593 aa  168  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.6234 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0608  ATP phosphoribosyltransferase (ATP-PRTase; ATP-PRT)  23.64 
 
 
590 aa  140  8.999999999999999e-32  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009795  CCC13826_1681  putative periplasmic protein  23.43 
 
 
590 aa  139  1e-31  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  27.66 
 
 
562 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  27.89 
 
 
565 aa  136  9.999999999999999e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0300  hemolysin activator protein  25.66 
 
 
562 aa  135  1.9999999999999998e-30  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00625551  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  27.4 
 
 
562 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  27.17 
 
 
562 aa  126  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1537  putative hemolysin activation protein HecB  21.48 
 
 
566 aa  125  2e-27  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.395998  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.89 
 
 
585 aa  124  6e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0072  HlyB family hemolysin activator protein  34.8 
 
 
294 aa  123  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.569784  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4481  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  25.54 
 
 
558 aa  122  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.359281  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  25.74 
 
 
570 aa  121  3e-26  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3792  hemolysin activator HlyB  25.29 
 
 
575 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.609243  normal  0.421617 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  24.49 
 
 
569 aa  120  6e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.21 
 
 
554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.1 
 
 
557 aa  112  2.0000000000000002e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.38 
 
 
573 aa  108  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.27 
 
 
560 aa  107  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2045  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  22.83 
 
 
513 aa  107  7e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.102664  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.93 
 
 
554 aa  107  8e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.42 
 
 
558 aa  106  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.44 
 
 
549 aa  106  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2439  ShlB/FhaC/HecB family haemolysin secretion/activation protein  22.2 
 
 
553 aa  104  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00155436  decreased coverage  0.0000110124 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2157  hemolysin activator HlyB domain-containing protein  22.2 
 
 
553 aa  103  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.62 
 
 
568 aa  101  5e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  23.24 
 
 
582 aa  100  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25 
 
 
580 aa  96.7  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013518  Sterm_4182  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.5 
 
 
592 aa  94.7  4e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0159904  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4641  hemolysin activator protein  23.55 
 
 
570 aa  94.4  5e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.52 
 
 
575 aa  92.8  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  22.84 
 
 
583 aa  92  3e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  22.84 
 
 
583 aa  90.1  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4169  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23 
 
 
559 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.987649 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4271  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.61 
 
 
560 aa  89.4  2e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.214751  normal 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.35 
 
 
597 aa  89  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2610  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.11 
 
 
591 aa  89  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000294226  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4029  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  20.61 
 
 
591 aa  88.6  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000138882  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1450  TPS family activation/secretion protein  22.95 
 
 
565 aa  88.2  4e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.548227  normal  0.440482 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.1 
 
 
591 aa  88.2  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1381  potra domain, shlb-type family  38.33 
 
 
354 aa  85.1  0.000000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.163797 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.22 
 
 
608 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.07 
 
 
610 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1421  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.03 
 
 
565 aa  79.7  0.0000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.161335  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0154  hypothetical protein  40.18 
 
 
121 aa  77.8  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.614633  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2481  HlyB family hemolysin activator protein  23.06 
 
 
554 aa  73.9  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.179079  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1757  HlyB family hemolysin activator protein  22.86 
 
 
520 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.598538  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0802  HlyB family hemolysin activator protein  22.34 
 
 
551 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.761952  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1613  HlyB family hemolysin activator protein  22.34 
 
 
558 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1821  HlyB family hemolysin activator protein  22.34 
 
 
554 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0491  HlyB family hemolysin activator protein  22.34 
 
 
558 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  21.39 
 
 
602 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2342  HlyB family hemolysin activator protein  21.12 
 
 
554 aa  68.6  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0745  haemolysin secretion/activation protein ShlB/FhaC/HecB  21.62 
 
 
547 aa  63.5  0.000000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  22.37 
 
 
607 aa  56.6  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>