54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0055 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0055  hemolysin activation/secretion protein-like  100 
 
 		 533 aa  1096    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193341  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.71 
 
 		 572 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  28.42 
 
 		 607 aa  87.8  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  26.93 
 
 		 550 aa  87.8  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.11 
 
 		 592 aa  87  8e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  26.79 
 
 		 556 aa  84  0.000000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  27.69 
 
 		 442 aa  83.2  0.00000000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  26.28 
 
 		 553 aa  76.6  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0530  putative outer-membrane protein  25.83 
 
 		 551 aa  76.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1744  hypothetical protein  25.83 
 
 		 551 aa  76.6  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  26.35 
 
 		 558 aa  72.4  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.01 
 
 		 561 aa  70.5  0.00000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  26.23 
 
 		 545 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  22.96 
 
 		 548 aa  67.4  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.41 
 
 		 571 aa  66.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.38 
 
 		 578 aa  66.6  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  23.81 
 
 		 585 aa  66.6  0.000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.7 
 
 		 747 aa  65.1  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.17 
 
 		 583 aa  63.9  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.91 
 
 		 590 aa  63.9  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  24.41 
 
 		 588 aa  62  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.94 
 
 		 554 aa  61.6  0.00000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  23.97 
 
 		 576 aa  60.5  0.00000008  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.06 
 
 		 595 aa  59.7  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  22.71 
 
 		 692 aa  59.3  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28 
 
 		 567 aa  59.3  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  24.53 
 
 		 595 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0764  putative outer-membrane protein  24.26 
 
 		 508 aa  58.5  0.0000003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.408754  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.45 
 
 		 585 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.97 
 
 		 586 aa  57.4  0.0000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.36 
 
 		 574 aa  57.4  0.0000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.44 
 
 		 692 aa  57  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  22.54 
 
 		 596 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.54 
 
 		 596 aa  56.2  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.59 
 
 		 546 aa  56.2  0.000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  24 
 
 		 608 aa  56.6  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0482  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.05 
 
 		 579 aa  56.2  0.000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  22.97 
 
 		 567 aa  55.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  22.97 
 
 		 567 aa  55.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  22.58 
 
 		 567 aa  54.3  0.000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  22.54 
 
 		 596 aa  53.9  0.000008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  21.85 
 
 		 554 aa  53.5  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1531  hypothetical protein  23.34 
 
 		 597 aa  51.2  0.00005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  24.6 
 
 		 568 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  23.86 
 
 		 584 aa  48.5  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  23.81 
 
 		 575 aa  48.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.09 
 
 		 567 aa  46.6  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.25 
 
 		 554 aa  46.6  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.44 
 
 		 554 aa  46.2  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0014  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.46 
 
 		 563 aa  45.1  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  24.9 
 
 		 568 aa  45.4  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  24.9 
 
 		 568 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0087  hypothetical protein  23.1 
 
 		 581 aa  43.9  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00223104  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2497  surface antigen (D15)  24.44 
 
 		 531 aa  43.9  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.889807 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>