212 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_37880 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  61.48 
 
 
553 aa  649    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  100 
 
 
550 aa  1109    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  51.97 
 
 
586 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  49.35 
 
 
545 aa  463  1e-129  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  44.36 
 
 
607 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  44.57 
 
 
585 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  44.78 
 
 
583 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  41.34 
 
 
554 aa  409  1e-113  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  41.07 
 
 
554 aa  397  1e-109  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  42.18 
 
 
554 aa  352  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  34.23 
 
 
569 aa  306  7e-82  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  35.93 
 
 
548 aa  305  1.0000000000000001e-81  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  36.75 
 
 
556 aa  305  2.0000000000000002e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  34.87 
 
 
572 aa  278  3e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  33.16 
 
 
561 aa  272  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  33.47 
 
 
567 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  33.47 
 
 
567 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  33.27 
 
 
567 aa  253  7e-66  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.59 
 
 
578 aa  242  1e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.97 
 
 
567 aa  220  3.9999999999999997e-56  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.64 
 
 
571 aa  219  7e-56  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  31.05 
 
 
576 aa  210  4e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  33.12 
 
 
595 aa  207  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.76 
 
 
592 aa  203  8e-51  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  31.49 
 
 
442 aa  199  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  35.49 
 
 
545 aa  193  7e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000416346 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1056  hemolysin activation/secretion protein-like  31.09 
 
 
576 aa  189  9e-47  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000536803  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30 
 
 
692 aa  188  3e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  32.16 
 
 
575 aa  184  3e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  32.59 
 
 
590 aa  179  9e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  26.84 
 
 
596 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.21 
 
 
747 aa  175  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.84 
 
 
596 aa  175  1.9999999999999998e-42  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  26.84 
 
 
596 aa  172  1e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  31.78 
 
 
558 aa  167  5e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  31.64 
 
 
574 aa  162  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0087  hypothetical protein  28.35 
 
 
581 aa  156  8e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00223104  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  26.52 
 
 
692 aa  144  4e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.86 
 
 
567 aa  136  8e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0764  putative outer-membrane protein  25.17 
 
 
508 aa  129  2.0000000000000002e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.408754  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1531  hypothetical protein  26.2 
 
 
597 aa  126  1e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  28.25 
 
 
568 aa  126  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  28.44 
 
 
568 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  28.89 
 
 
599 aa  125  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0530  putative outer-membrane protein  27.97 
 
 
551 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1744  hypothetical protein  27.97 
 
 
551 aa  124  3e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.64 
 
 
561 aa  122  1.9999999999999998e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.96 
 
 
546 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0771  polypeptide-transport-associated domain protein, ShlB-type  29.5 
 
 
310 aa  114  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.891277 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.64 
 
 
559 aa  110  6e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  24.06 
 
 
584 aa  108  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  24.77 
 
 
558 aa  103  9e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  23.43 
 
 
555 aa  100  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.84 
 
 
585 aa  97.4  5e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  25.72 
 
 
574 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5786  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28 
 
 
592 aa  95.5  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.564372  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.33 
 
 
538 aa  95.1  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1064  surface antigen (D15)  28.26 
 
 
587 aa  93.6  8e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459737 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0618  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.48 
 
 
554 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.135926 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0612  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.15 
 
 
554 aa  93.2  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331915  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1086  surface antigen (D15)  23.99 
 
 
550 aa  92.8  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0945143  normal  0.205962 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  24.57 
 
 
569 aa  92  3e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2611  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.65 
 
 
543 aa  92  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  26.01 
 
 
595 aa  91.7  3e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0482  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.72 
 
 
579 aa  91.7  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164401  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  23.64 
 
 
588 aa  91.3  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4351  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.21 
 
 
581 aa  91.3  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.891663 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4241  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.21 
 
 
581 aa  91.3  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.398994  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  23.64 
 
 
559 aa  90.1  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  24.06 
 
 
551 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  24.06 
 
 
551 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  24.06 
 
 
551 aa  89.7  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2383  hemolysin activation/secretion protein-like  26.2 
 
 
624 aa  88.6  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.418836  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0112  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.16 
 
 
574 aa  87.8  4e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.034369 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  23.45 
 
 
559 aa  88.2  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.28 
 
 
568 aa  88.2  4e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4591  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.04 
 
 
552 aa  87.8  5e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0179388 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0055  hemolysin activation/secretion protein-like  26.93 
 
 
533 aa  87.8  5e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.193341  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  23.89 
 
 
551 aa  87.4  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0378  surface antigen (D15)  26.13 
 
 
595 aa  87  7e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  23.27 
 
 
551 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.58 
 
 
584 aa  85.5  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.58 
 
 
639 aa  85.9  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  26.05 
 
 
608 aa  85.1  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  25.1 
 
 
562 aa  85.1  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2550  hypothetical protein  23.5 
 
 
597 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0719761  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  25.1 
 
 
565 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.21 
 
 
558 aa  84.3  0.000000000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2219  hemolysin activation/secretion protein  21.93 
 
 
575 aa  84.3  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0458384  normal  0.400148 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0351  hemolysin activation/secretion protein-like protein  24.62 
 
 
607 aa  84.3  0.000000000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410508  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.91 
 
 
1349 aa  84.3  0.000000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  22.78 
 
 
568 aa  83.6  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4403  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.65 
 
 
557 aa  83.6  0.000000000000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1436  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.12 
 
 
561 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0737479  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  24.26 
 
 
562 aa  83.2  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.38 
 
 
560 aa  83.2  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.12 
 
 
561 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.64 
 
 
1570 aa  82.8  0.00000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.75 
 
 
561 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  0.0000615286 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  24.26 
 
 
562 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>