39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnec_0771 on replicon NC_010531
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010531  Pnec_0771  polypeptide-transport-associated domain protein, ShlB-type  100 
 
 		 310 aa  618  1e-176  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.891277 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  57.19 
 
 		 571 aa  348  9e-95  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  30.89 
 
 		 553 aa  127  3e-28  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  30.12 
 
 		 550 aa  123  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.39 
 
 		 572 aa  115  8.999999999999998e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.39 
 
 		 567 aa  114  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  31.43 
 
 		 548 aa  113  5e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  30.38 
 
 		 554 aa  112  7.000000000000001e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.03 
 
 		 554 aa  101  2e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1056  hemolysin activation/secretion protein-like  28.66 
 
 		 576 aa  99.8  5e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000536803  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  31.02 
 
 		 583 aa  97.1  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.53 
 
 		 554 aa  94.7  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.02 
 
 		 578 aa  92.8  6e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.94 
 
 		 592 aa  90.1  4e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  30.29 
 
 		 585 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  28.48 
 
 		 607 aa  87  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.66 
 
 		 586 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  28.25 
 
 		 545 aa  86.7  4e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  27.67 
 
 		 576 aa  83.6  0.000000000000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  25.75 
 
 		 561 aa  73.2  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  25.44 
 
 		 596 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.44 
 
 		 596 aa  68.9  0.0000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  25.44 
 
 		 596 aa  68.6  0.0000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.25 
 
 		 569 aa  67.4  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  26.33 
 
 		 567 aa  65.5  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.66 
 
 		 595 aa  64.3  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  25.98 
 
 		 567 aa  63.2  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  25.98 
 
 		 567 aa  63.2  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  27.64 
 
 		 556 aa  62  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  26.3 
 
 		 442 aa  60.1  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.53 
 
 		 692 aa  59.3  0.00000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0087  hypothetical protein  31.13 
 
 		 581 aa  58.2  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00223104  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.88 
 
 		 553 aa  55.8  0.0000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.69 
 
 		 574 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.41 
 
 		 545 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000416346 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  24.71 
 
 		 575 aa  48.5  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.07 
 
 		 590 aa  48.9  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0764  putative outer-membrane protein  23.57 
 
 		 508 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.408754  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.26 
 
 		 546 aa  44.7  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>