146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3175 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  100 
 
 
596 aa  1229    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  99.83 
 
 
596 aa  1226    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  100 
 
 
596 aa  1229    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0087  hypothetical protein  31.8 
 
 
581 aa  300  7e-80  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00223104  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.28 
 
 
567 aa  201  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0939  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  27.23 
 
 
561 aa  188  2e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.247088  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  29.81 
 
 
572 aa  188  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  27.95 
 
 
607 aa  187  6e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  27.52 
 
 
554 aa  186  1.0000000000000001e-45  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.98 
 
 
554 aa  185  3e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.9 
 
 
583 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2696  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.27 
 
 
592 aa  176  9.999999999999999e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.763446 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  26.84 
 
 
550 aa  175  1.9999999999999998e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  29.23 
 
 
585 aa  167  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  29.72 
 
 
567 aa  166  8e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  29.72 
 
 
567 aa  166  8e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  29.49 
 
 
567 aa  164  3e-39  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.21 
 
 
590 aa  162  2e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.38 
 
 
578 aa  159  2e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  27.8 
 
 
545 aa  157  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  25.17 
 
 
576 aa  155  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1056  hemolysin activation/secretion protein-like  26.25 
 
 
576 aa  153  1e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000536803  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  26.74 
 
 
556 aa  152  2e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.05 
 
 
586 aa  152  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.06 
 
 
569 aa  151  3e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  26.53 
 
 
553 aa  151  4e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.84 
 
 
554 aa  148  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2665  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  28.16 
 
 
574 aa  146  1e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  26.8 
 
 
548 aa  142  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  26.04 
 
 
442 aa  142  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0727  hemolysin activation/secretion protein-like  25.36 
 
 
575 aa  137  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.494827  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.47 
 
 
571 aa  131  3e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.97 
 
 
595 aa  131  4.0000000000000003e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.08 
 
 
747 aa  130  7.000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.17 
 
 
692 aa  113  9e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  25.39 
 
 
558 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0764  putative outer-membrane protein  23.11 
 
 
508 aa  107  8e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.408754  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0530  putative outer-membrane protein  23.12 
 
 
551 aa  106  9e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1744  hypothetical protein  23.12 
 
 
551 aa  106  9e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.222058  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3489  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.02 
 
 
1391 aa  105  2e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3266  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  23.8 
 
 
1349 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3487  filamentous haemagglutinin outer membrane protein  24.02 
 
 
1570 aa  101  5e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0654  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  26.15 
 
 
546 aa  99.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.745868  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1531  hypothetical protein  24.01 
 
 
597 aa  99  2e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  24.28 
 
 
692 aa  98.2  4e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3763  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.96 
 
 
567 aa  97.8  5e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  21.79 
 
 
585 aa  93.6  8e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  23.2 
 
 
584 aa  89.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  24.6 
 
 
608 aa  89.7  1e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.24 
 
 
585 aa  89.7  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2178  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.33 
 
 
554 aa  89.4  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.4 
 
 
545 aa  88.2  4e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000416346 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  23.25 
 
 
588 aa  86.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3443  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.66 
 
 
639 aa  83.2  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2673  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.66 
 
 
584 aa  82.4  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.784893  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1912  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.91 
 
 
558 aa  82  0.00000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.02 
 
 
559 aa  80.5  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3230  hemolysin activator protein, HlyB family  24.95 
 
 
569 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2523  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.12 
 
 
554 aa  79.3  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1048  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.29 
 
 
561 aa  77.8  0.0000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0850333 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  22.22 
 
 
595 aa  75.9  0.000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0281  surface antigen (D15)  21.88 
 
 
568 aa  75.9  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.71 
 
 
575 aa  75.1  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2002  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.27 
 
 
549 aa  74.3  0.000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00490  putative hemolysin activation/secretion protein  24.74 
 
 
562 aa  74.3  0.000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.612794 
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  22.94 
 
 
583 aa  73.2  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3152  hemolysin activator HlyB  22.63 
 
 
570 aa  73.2  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0575639  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.97 
 
 
580 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.203664 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  22.25 
 
 
583 aa  72  0.00000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  21.22 
 
 
568 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2776  hypothetical protein  24.12 
 
 
562 aa  72  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.816054  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0281  surface antigen (D15)  21.88 
 
 
568 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  21.55 
 
 
568 aa  71.6  0.00000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.98 
 
 
597 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0042  hypothetical protein  24.12 
 
 
562 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32780  hypothetical protein  24.65 
 
 
565 aa  70.5  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.917181  hitchhiker  0.00000323092 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  24.29 
 
 
599 aa  70.5  0.00000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1064  surface antigen (D15)  26.09 
 
 
587 aa  68.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459737 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0052  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.47 
 
 
568 aa  68.2  0.0000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.148517  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0771  polypeptide-transport-associated domain protein, ShlB-type  24.83 
 
 
310 aa  67.4  0.0000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.891277 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2932  hemolysin activator HlyB  20.93 
 
 
582 aa  65.9  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  20.43 
 
 
608 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5773  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.42 
 
 
573 aa  65.5  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.105583  normal  0.539774 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1646  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.81 
 
 
569 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.39 
 
 
553 aa  63.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0066  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  19.82 
 
 
560 aa  63.2  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  23.79 
 
 
574 aa  62.8  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0282  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.79 
 
 
591 aa  62.8  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00122083  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0378  surface antigen (D15)  22.44 
 
 
595 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.799835  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0612  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.96 
 
 
554 aa  62  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331915  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3523  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.19 
 
 
548 aa  62  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1248  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.87 
 
 
560 aa  59.7  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000540972  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5358  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  21.46 
 
 
580 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  25 
 
 
558 aa  58.2  0.0000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2806  putative hemolysin activation/secretion signal peptide protein, FhaC/HxuB  22.71 
 
 
569 aa  58.2  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0618  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.44 
 
 
554 aa  57.4  0.0000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.135926 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4029  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.1 
 
 
591 aa  57.4  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000138882  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2610  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  21.1 
 
 
591 aa  57.4  0.0000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000294226  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0153  putative activation/secretion protein  22.67 
 
 
602 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1635  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.73 
 
 
585 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.309745 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>