101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2383 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2383  hemolysin activation/secretion protein-like  100 
 
 		 624 aa  1253    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.418836  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0351  hemolysin activation/secretion protein-like protein  50.8 
 
 		 607 aa  540  9.999999999999999e-153  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.410508  normal  0.212759 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1989  hemolysin activation/secretion protein-like  44.15 
 
 		 587 aa  441  9.999999999999999e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0548358  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3190  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  40.59 
 
 		 589 aa  417  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.376319  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4655  hemolysin activation/secretion protein  24.47 
 
 		 561 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.55265  normal  0.152827 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61190  hypothetical protein  28.01 
 
 		 568 aa  122  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.324339  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5270  hypothetical protein  28.04 
 
 		 568 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1490  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.63 
 
 		 561 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00938115  hitchhiker  0.0000615286 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2550  hypothetical protein  25.09 
 
 		 597 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0719761  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1034  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  24.61 
 
 		 561 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.278848  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1514  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.61 
 
 		 561 aa  119  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6061  hypothetical protein  26.16 
 
 		 599 aa  118  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1044  hypothetical protein  25.45 
 
 		 559 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0938674  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1491  hypothetical protein  25.45 
 
 		 551 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0159  hypothetical protein  25.45 
 
 		 551 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1007  hypothetical protein  25.45 
 
 		 551 aa  117  5e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1931  putative exported heme utilisation related protein  25.45 
 
 		 559 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.560959  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1780  hypothetical protein  25.45 
 
 		 551 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0068  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.08 
 
 		 559 aa  116  1.0000000000000001e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.503427 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1739  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.22 
 
 		 561 aa  116  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.484199  hitchhiker  0.0000499827 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1759  hypothetical protein  25.45 
 
 		 551 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.301432  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1248  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.29 
 
 		 560 aa  109  2e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.000540972  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1436  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.08 
 
 		 561 aa  103  8e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0737479  normal  0.0360186 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1396  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.88 
 
 		 561 aa  103  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.304051  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2095  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.51 
 
 		 592 aa  100  8e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2107  activation/secretion signal peptide protein  26.98 
 
 		 548 aa  94.7  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.385271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2806  putative hemolysin activation/secretion signal peptide protein, FhaC/HxuB  22.69 
 
 		 569 aa  90.5  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.142644 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5402  activation/secretion signal peptide protein  22.87 
 
 		 555 aa  90.1  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3648  putative activation/secretion signal peptide protein  23.46 
 
 		 558 aa  90.1  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1646  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.69 
 
 		 569 aa  88.6  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37880  hypothetical protein  26.2 
 
 		 550 aa  88.6  3e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.335494  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5860  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.65 
 
 		 576 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.680877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4591  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.39 
 
 		 552 aa  85.9  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0179388 
 
 
-
 
NC_003296  RS02601  activation/secretion signal peptide protein  24.59 
 
 		 557 aa  84.3  0.000000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.591465  normal  0.415625 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1285  hypothetical protein  23.84 
 
 		 565 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000102142  hitchhiker  0.0000179621 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3502  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.21 
 
 		 553 aa  84.3  0.000000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.898931  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1288  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.34 
 
 		 583 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0488096  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3523  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.3 
 
 		 548 aa  81.3  0.00000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12270  hypothetical protein  25 
 
 		 553 aa  80.1  0.0000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0300367  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_58890  putative hemolysin activation/secretion protein  26.6 
 
 		 545 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0280329 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2460  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.9 
 
 		 587 aa  76.6  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.118018  normal  0.349655 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0482  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.45 
 
 		 579 aa  76.6  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0164401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3431  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.95 
 
 		 567 aa  77  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00052486 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1126  hypothetical protein  23.2 
 
 		 531 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5786  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.91 
 
 		 592 aa  73.6  0.00000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.564372  normal  0.0223321 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1143  surface antigen (D15)  22.22 
 
 		 584 aa  72.8  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0908627  decreased coverage  0.00528068 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3283  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.39 
 
 		 585 aa  72  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.86575 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2861  hemolysin activation/secretion protein-like  25.11 
 
 		 607 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4241  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.05 
 
 		 581 aa  71.2  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.398994  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4351  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.05 
 
 		 581 aa  71.2  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.891663 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0612  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  28.36 
 
 		 554 aa  70.1  0.0000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.331915  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0503  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  24.84 
 
 		 572 aa  69.7  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.376385  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03098  activation/secretion signal peptide protein  25.48 
 
 		 556 aa  68.9  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.604865  normal  0.89886 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3704  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.38 
 
 		 554 aa  65.1  0.000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.509582 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0573  hypothetical protein  27.36 
 
 		 574 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0011  hemolysin activation/secretion protein-like  23.32 
 
 		 567 aa  64.7  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.811976  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0746  hemolysin activation/secretion protein-like  23.32 
 
 		 567 aa  64.7  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.63759  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1007  hemolysin activation/secretion protein-like  23.32 
 
 		 567 aa  64.7  0.000000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0618  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.92 
 
 		 554 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475083  normal  0.135926 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0779  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.38 
 
 		 747 aa  62.8  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000230796  normal  0.181114 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55380  hypothetical protein  25.57 
 
 		 544 aa  61.6  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.11737  normal  0.0347835 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3061  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.69 
 
 		 578 aa  61.6  0.00000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0377809  decreased coverage  0.00167141 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4818  hypothetical protein  25.47 
 
 		 544 aa  61.2  0.00000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1782  putative heme-hemopexin utilization protein B  25 
 
 		 554 aa  59.7  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2395  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.56 
 
 		 569 aa  59.3  0.0000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0147  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  20.2 
 
 		 572 aa  58.9  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4426  surface antigen variable number  23.36 
 
 		 595 aa  58.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0690  Hemolysin activator HlyB domain protein  27.59 
 
 		 442 aa  58.9  0.0000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1533  polypeptide-transport-associated, ShlB-type  23.17 
 
 		 692 aa  58.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0363151  normal  0.0767157 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1529  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  22.38 
 
 		 585 aa  58.2  0.0000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0450756  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4466  surface antigen (D15)  21.36 
 
 		 585 aa  57.8  0.0000005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0764  putative outer-membrane protein  20.13 
 
 		 508 aa  57  0.0000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.408754  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5176  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.35 
 
 		 586 aa  57  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.058555  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0652  hypothetical protein  20.94 
 
 		 558 aa  53.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1094  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  22.52 
 
 		 571 aa  52.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5444  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.32 
 
 		 608 aa  52.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.910139 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2173  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  25.23 
 
 		 692 aa  52.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0036053  normal  0.421945 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1054  activation/secretion signal peptide protein  22.71 
 
 		 576 aa  51.6  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000217377  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7334  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.29 
 
 		 610 aa  51.6  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.285673 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2348  surface antigen variable number  19.83 
 
 		 588 aa  51.2  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.825907  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_5055  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  23.37 
 
 		 575 aa  51.6  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1457  surface antigen (D15)  22.47 
 
 		 555 aa  51.2  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4182  surface antigen variable number  23.14 
 
 		 608 aa  50.4  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000105717 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3182  activation/secretion signal peptide protein  25.33 
 
 		 583 aa  49.7  0.0002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1056  hemolysin activation/secretion protein-like  23.41 
 
 		 576 aa  49.7  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000536803  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0087  hypothetical protein  32.45 
 
 		 581 aa  48.9  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00223104  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3060  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.42 
 
 		 590 aa  48.5  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS04812  activation/secretion signal peptide protein  25 
 
 		 583 aa  48.1  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.191028  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3175  putative lipoprotein  20.59 
 
 		 596 aa  47.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.849554  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4107  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  26.18 
 
 		 554 aa  48.1  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.416704  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3313  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  20.59 
 
 		 596 aa  47.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4013  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  23.08 
 
 		 538 aa  47.4  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1153  OMP85 family outer membrane protein  22.97 
 
 		 558 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1086  surface antigen (D15)  20.24 
 
 		 550 aa  45.4  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0945143  normal  0.205962 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2281  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  24.29 
 
 		 595 aa  45.8  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.127506  normal  0.282599 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3325  putative lipoprotein  20.51 
 
 		 596 aa  45.4  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.112603  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02577  activation/secretion protein  23.35 
 
 		 578 aa  45.1  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0875463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6761  polypeptide-transport-associated domain-containing protein  27.24 
 
 		 597 aa  44.3  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.306562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2406  hemolysin activation/secretion protein  22.32 
 
 		 547 aa  43.9  0.008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5639  Polypeptide-transport-associated domain protein ShlB-type  33.67 
 
 		 533 aa  44.3  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000755047 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>