More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_1368 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  44.87 
 
 		 920 aa  754    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  48.35 
 
 		 895 aa  823    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  46.7 
 
 		 892 aa  816    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  100 
 
 		 893 aa  1806    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  56.92 
 
 		 895 aa  1034    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  56.54 
 
 		 896 aa  993    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  35.7 
 
 		 752 aa  444  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  31.5 
 
 		 913 aa  427  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  32.71 
 
 		 765 aa  413  1e-114  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  29.56 
 
 		 888 aa  414  1e-114  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.02 
 
 		 808 aa  403  1e-111  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.55 
 
 		 802 aa  401  9.999999999999999e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.8 
 
 		 752 aa  378  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  30.18 
 
 		 769 aa  375  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  31.01 
 
 		 820 aa  372  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  29.79 
 
 		 763 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  29.9 
 
 		 751 aa  346  1e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  28.92 
 
 		 806 aa  346  1e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.66 
 
 		 793 aa  345  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.5 
 
 		 793 aa  344  5e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.73 
 
 		 848 aa  334  5e-90  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  28.48 
 
 		 767 aa  305  2.0000000000000002e-81  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  27.57 
 
 		 785 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.79 
 
 		 769 aa  285  3.0000000000000004e-75  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  26.61 
 
 		 767 aa  281  3e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  28.03 
 
 		 770 aa  281  5e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  26.53 
 
 		 768 aa  280  7e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  26.53 
 
 		 769 aa  278  2e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  26.39 
 
 		 769 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  26.39 
 
 		 769 aa  278  3e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  26.39 
 
 		 768 aa  278  4e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  26.33 
 
 		 768 aa  278  4e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  26.39 
 
 		 769 aa  277  5e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  26.33 
 
 		 768 aa  277  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  26.33 
 
 		 768 aa  277  6e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  26.33 
 
 		 768 aa  277  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.39 
 
 		 768 aa  277  6e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  26.26 
 
 		 769 aa  277  7e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  26.26 
 
 		 769 aa  277  7e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  28.46 
 
 		 763 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.26 
 
 		 769 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.33 
 
 		 770 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1686  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.92 
 
 		 749 aa  272  2e-71  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.998639  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0942  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.22 
 
 		 751 aa  272  2.9999999999999997e-71  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000918625  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.41 
 
 		 770 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.31 
 
 		 769 aa  272  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1501  OMP85 family outer membrane protein  28.02 
 
 		 757 aa  271  4e-71  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.76 
 
 		 769 aa  266  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.94 
 
 		 821 aa  265  4e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  28.52 
 
 		 784 aa  263  1e-68  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2334  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.79 
 
 		 763 aa  263  1e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117402 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0142  OMP85 family outer membrane protein  27.24 
 
 		 739 aa  262  2e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0561822  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0164  OMP85 family outer membrane protein  26.97 
 
 		 739 aa  262  2e-68  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00465042  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.04 
 
 		 855 aa  262  2e-68  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0124  OMP85 family outer membrane protein  26.84 
 
 		 739 aa  261  3e-68  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1750  surface antigen (D15):surface antigen variable number  26.41 
 
 		 761 aa  258  3e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.330816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  24.68 
 
 		 794 aa  258  4e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  28.05 
 
 		 791 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  27.78 
 
 		 765 aa  253  9.000000000000001e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0215  conserved hypothetical protein, putative outer membrane protein  28.46 
 
 		 738 aa  252  2e-65  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0238562  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  26.28 
 
 		 772 aa  251  3e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.27 
 
 		 750 aa  251  4e-65  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.67 
 
 		 781 aa  251  6e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  26.36 
 
 		 760 aa  250  7e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.73 
 
 		 765 aa  250  7e-65  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.34 
 
 		 854 aa  249  1e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.12 
 
 		 800 aa  248  3e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  26.42 
 
 		 790 aa  248  3e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  26.34 
 
 		 790 aa  248  4e-64  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1757  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.23 
 
 		 759 aa  248  4.9999999999999997e-64  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000442418  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  26.36 
 
 		 778 aa  247  6e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  25.98 
 
 		 798 aa  247  6.999999999999999e-64  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  24.59 
 
 		 852 aa  247  9e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  25.73 
 
 		 785 aa  246  9.999999999999999e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1574  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.89 
 
 		 786 aa  246  9.999999999999999e-64  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.02 
 
 		 784 aa  246  9.999999999999999e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  25.74 
 
 		 758 aa  246  9.999999999999999e-64  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.17 
 
 		 854 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.55 
 
 		 784 aa  245  3e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.17 
 
 		 864 aa  245  3e-63  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  24.24 
 
 		 791 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  26.12 
 
 		 905 aa  244  5e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1053  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.13 
 
 		 807 aa  244  7e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.61 
 
 		 857 aa  243  7.999999999999999e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  26.07 
 
 		 788 aa  243  1e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.6 
 
 		 829 aa  243  1e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  24.29 
 
 		 794 aa  243  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.46 
 
 		 787 aa  243  1e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.32 
 
 		 797 aa  242  2e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  26.05 
 
 		 766 aa  242  2e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.53 
 
 		 765 aa  242  2e-62  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  23.97 
 
 		 795 aa  241  4e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.81 
 
 		 844 aa  240  6.999999999999999e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  24.7 
 
 		 841 aa  240  8e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.87 
 
 		 787 aa  240  8e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  24.08 
 
 		 786 aa  238  2e-61  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  24.08 
 
 		 786 aa  239  2e-61  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1446  surface antigen (D15)  26.51 
 
 		 765 aa  238  3e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.332057 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  24.53 
 
 		 786 aa  238  4e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2146  surface antigen (D15)  26.38 
 
 		 792 aa  237  6e-61  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.766596  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>