81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3162 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0368  putative lipoprotein  84.62 
 
 		 416 aa  706    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3162  surface antigen (D15)  100 
 
 		 414 aa  843    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.153148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4112  surface antigen (D15)  70.28 
 
 		 414 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116065  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3353  surface antigen (D15)  63.77 
 
 		 427 aa  566  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3409  surface antigen (D15)  59.47 
 
 		 430 aa  494  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2510  putative outer membrane protein  27.24 
 
 		 376 aa  76.3  0.000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854029  normal  0.567275 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3224  hypothetical protein  27.1 
 
 		 444 aa  71.2  0.00000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.050475  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2477  surface antigen (D15)  25.14 
 
 		 870 aa  65.5  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.932221 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0246  hypothetical protein  26.29 
 
 		 913 aa  62.4  0.00000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0230435  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3752  outer membrane protein  26.7 
 
 		 1222 aa  58.9  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.196365  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2814  hypothetical protein  26.72 
 
 		 1224 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.28132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1411  metallophosphoesterase  27.17 
 
 		 1223 aa  58.2  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1348  hypothetical protein  21.86 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5722  hypothetical protein  24.31 
 
 		 364 aa  56.6  0.0000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3731  hypothetical protein  24.91 
 
 		 886 aa  56.2  0.0000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  23.67 
 
 		 553 aa  55.8  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3252  outer membrane protein  22.65 
 
 		 378 aa  55.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0431  hypothetical protein  21.72 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94677  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06675  hypothetical protein  20.23 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0933  hypothetical protein  26.01 
 
 		 913 aa  54.3  0.000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.643456  normal  0.129132 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0482  hypothetical protein  26.55 
 
 		 388 aa  53.9  0.000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000379744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0541  hypothetical protein  22.04 
 
 		 388 aa  53.9  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0408675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1202  hypothetical protein  27.54 
 
 		 913 aa  53.5  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.101967  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1599  surface antigen (D15)  26.54 
 
 		 367 aa  52.8  0.00001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2138  hypothetical protein  24.75 
 
 		 382 aa  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2446  surface antigen (D15)  19.58 
 
 		 359 aa  52  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4224  surface antigen (D15)  27.78 
 
 		 653 aa  50.8  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.534945  normal  0.496095 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4040  outer membrane protein  25.14 
 
 		 379 aa  50.4  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1095  hypothetical protein  27.73 
 
 		 386 aa  50.1  0.00007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901887 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  26.54 
 
 		 683 aa  50.1  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4057  outer membrane protein  25.14 
 
 		 379 aa  50.1  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0820  hypothetical protein  29.55 
 
 		 917 aa  49.7  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  28.11 
 
 		 560 aa  48.9  0.0001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4688  hypothetical protein  28.93 
 
 		 855 aa  49.7  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169817 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  28.57 
 
 		 801 aa  48.9  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000907033  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1021  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.75 
 
 		 795 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000998639  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2887  surface antigen (D15)  27.37 
 
 		 637 aa  48.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3666  hypothetical protein  24.51 
 
 		 388 aa  48.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1074  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.75 
 
 		 795 aa  48.1  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000979052  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3427  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.75 
 
 		 795 aa  48.1  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000902719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5370  hypothetical protein  25 
 
 		 474 aa  47.8  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.861933  normal  0.7814 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  33.7 
 
 		 913 aa  47.4  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1217  surface antigen (D15)  32.95 
 
 		 925 aa  47  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.12 
 
 		 804 aa  46.6  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25845  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  28.19 
 
 		 772 aa  45.8  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2972  outer membrane protein assembly factor YaeT  33.33 
 
 		 807 aa  45.8  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0353111  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1096  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  24.86 
 
 		 383 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0234043 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0660  hypothetical protein  22.77 
 
 		 388 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000211177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3153  surface antigen (D15)  25.41 
 
 		 827 aa  46.2  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000352533  normal  0.0112151 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6386  surface antigen (D15)  27.54 
 
 		 663 aa  46.2  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.130426  normal  0.710466 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0320  hypothetical protein  27.6 
 
 		 416 aa  46.2  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4078  outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  17.91 
 
 		 390 aa  45.4  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.47886  normal  0.117623 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0262  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.97 
 
 		 803 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0265  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.97 
 
 		 803 aa  45.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000300024  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6779  surface antigen (D15)  25.76 
 
 		 665 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0846738  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.59 
 
 		 920 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0207  hypothetical protein  23.91 
 
 		 378 aa  44.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0792797 
 
 
-
 
NC_002620  TC0512  outer membrane protein, putative  27.71 
 
 		 792 aa  44.7  0.003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  35.96 
 
 		 751 aa  44.7  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  27.45 
 
 		 769 aa  45.1  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2419  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.33 
 
 		 806 aa  45.1  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0333898  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  27.18 
 
 		 888 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5265  surface antigen (D15)  35.96 
 
 		 835 aa  44.3  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1843  outer membrane protein assembly factor YaeT  34 
 
 		 803 aa  44.3  0.004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000194278  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0250  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.23 
 
 		 810 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.609554  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.23 
 
 		 810 aa  44.3  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  0.197895 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1064  surface antigen (D15)  34.04 
 
 		 587 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.459737 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  33.33 
 
 		 752 aa  43.9  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0268  hypothetical protein  27.74 
 
 		 383 aa  43.5  0.006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1147  surface antigen  23.68 
 
 		 844 aa  43.9  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003885  normal  0.883859 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0875  surface antigen (D15)  26.13 
 
 		 677 aa  43.5  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.509764  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00175  hypothetical protein  26.23 
 
 		 810 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000980871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3426  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.23 
 
 		 810 aa  43.5  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480767  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2627  surface antigen (D15)  23.78 
 
 		 827 aa  43.5  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0218715  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00174  hypothetical protein  26.23 
 
 		 810 aa  43.5  0.007  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00018653  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0187  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.23 
 
 		 810 aa  43.5  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00010789  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0179  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.23 
 
 		 810 aa  43.5  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000266992  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0181  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.23 
 
 		 810 aa  43.5  0.007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000194171  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0170  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.23 
 
 		 810 aa  43.5  0.007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000513305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3483  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.23 
 
 		 810 aa  43.5  0.007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000802072  normal  0.102232 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0715  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.01 
 
 		 805 aa  42.7  0.01  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000733739  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>