64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2446 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2446  surface antigen (D15)  100 
 
 		 359 aa  727    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4040  outer membrane protein  31.01 
 
 		 379 aa  144  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2510  putative outer membrane protein  30.23 
 
 		 376 aa  144  2e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854029  normal  0.567275 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4057  outer membrane protein  30.72 
 
 		 379 aa  143  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1599  surface antigen (D15)  30.06 
 
 		 367 aa  139  7e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5327  hypothetical protein  33.07 
 
 		 358 aa  135  9.999999999999999e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3252  outer membrane protein  28.45 
 
 		 378 aa  129  6e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0774  hypothetical protein  32.5 
 
 		 408 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5722  hypothetical protein  29.43 
 
 		 364 aa  125  8.000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0737  hypothetical protein  32.14 
 
 		 430 aa  125  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000826338  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06675  hypothetical protein  30.53 
 
 		 374 aa  125  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0774  hypothetical protein  32.5 
 
 		 407 aa  124  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0431  hypothetical protein  29.33 
 
 		 374 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94677  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4078  outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  25.95 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.47886  normal  0.117623 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0207  hypothetical protein  27.76 
 
 		 378 aa  115  1.0000000000000001e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0792797 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1095  hypothetical protein  27.93 
 
 		 386 aa  112  7.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901887 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0320  hypothetical protein  26.36 
 
 		 416 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0781  hypothetical protein  28.57 
 
 		 394 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.585384  normal  0.217138 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1348  hypothetical protein  28.08 
 
 		 408 aa  103  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3666  hypothetical protein  27.14 
 
 		 388 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1767  hypothetical protein  27.74 
 
 		 411 aa  102  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00449343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0482  hypothetical protein  27.76 
 
 		 388 aa  101  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000379744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0660  hypothetical protein  26.39 
 
 		 388 aa  100  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000211177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4198  hypothetical protein  36.9 
 
 		 425 aa  97.8  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3402  surface antigen (D15)  25.95 
 
 		 444 aa  97.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00692048  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1476  hypothetical protein  26.69 
 
 		 421 aa  92.8  8e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  33.14 
 
 		 553 aa  91.3  3e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3342  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  24.65 
 
 		 358 aa  89.4  9e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501978  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0541  hypothetical protein  33.33 
 
 		 388 aa  89  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0408675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3971  hypothetical protein  26.03 
 
 		 412 aa  88.6  1e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3279  hypothetical protein  27.9 
 
 		 407 aa  86.7  6e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710367  normal  0.0331702 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4990  hypothetical protein  25.46 
 
 		 378 aa  86.3  7e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3729  hypothetical protein  23.78 
 
 		 414 aa  86.3  8e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0268  hypothetical protein  33.69 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2138  hypothetical protein  23.77 
 
 		 382 aa  82.8  0.000000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0286  hypothetical protein  25.29 
 
 		 376 aa  81.3  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal  0.0827061 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1799  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  27.32 
 
 		 395 aa  73.9  0.000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1602  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  27.17 
 
 		 425 aa  72.4  0.00000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6656  hypothetical protein  28.43 
 
 		 448 aa  68.6  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1096  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  28.14 
 
 		 383 aa  65.9  0.000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0234043 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  26.39 
 
 		 560 aa  62.8  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1149  hypothetical protein  25.33 
 
 		 395 aa  60.8  0.00000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3029  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  27.5 
 
 		 421 aa  59.7  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0419  hypothetical protein  28.65 
 
 		 395 aa  59.3  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  24.14 
 
 		 683 aa  57.8  0.0000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2423  hypothetical protein  23.95 
 
 		 432 aa  57  0.0000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0172  surface antigen (D15)  29.05 
 
 		 677 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.133005  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4112  surface antigen (D15)  21.36 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3162  surface antigen (D15)  19.58 
 
 		 414 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.153148  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3741  surface antigen (D15)  27.03 
 
 		 821 aa  51.2  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0815  surface antigen (D15)  26 
 
 		 961 aa  50.4  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0183  surface antigen (D15)  28.38 
 
 		 677 aa  50.4  0.00005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.195082  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0928  surface antigen (D15)  28.02 
 
 		 668 aa  49.7  0.00008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0368  putative lipoprotein  20.53 
 
 		 416 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0164  surface antigen variable number  27.03 
 
 		 657 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.335906  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3409  surface antigen (D15)  20.77 
 
 		 430 aa  47  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0758  surface antigen (D15)  23.48 
 
 		 610 aa  47  0.0005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.419664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3793  hypothetical protein  24.51 
 
 		 379 aa  46.2  0.0009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0362  surface antigen (D15)  31.44 
 
 		 752 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0355  surface antigen (D15)  31.44 
 
 		 752 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3353  surface antigen (D15)  21.88 
 
 		 427 aa  45.4  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.16 
 
 		 1107 aa  45.4  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00015  hypothetical protein  21.84 
 
 		 336 aa  44.3  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0928  outer envelope membrane protein  28.66 
 
 		 721 aa  43.1  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>