52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06675 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06675  hypothetical protein  100 
 
 		 374 aa  764    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1348  hypothetical protein  59.24 
 
 		 408 aa  458  9.999999999999999e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0431  hypothetical protein  52.7 
 
 		 374 aa  376  1e-103  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.94677  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1095  hypothetical protein  43.6 
 
 		 386 aa  298  2e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00901887 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0207  hypothetical protein  41.08 
 
 		 378 aa  290  3e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0792797 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4040  outer membrane protein  41.48 
 
 		 379 aa  280  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4057  outer membrane protein  41.19 
 
 		 379 aa  279  5e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2510  putative outer membrane protein  38.92 
 
 		 376 aa  231  1e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.854029  normal  0.567275 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0320  hypothetical protein  33.15 
 
 		 416 aa  210  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0660  hypothetical protein  34.07 
 
 		 388 aa  190  2.9999999999999997e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000211177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3666  hypothetical protein  35.28 
 
 		 388 aa  190  4e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0482  hypothetical protein  34.99 
 
 		 388 aa  187  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000379744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0541  hypothetical protein  34.99 
 
 		 388 aa  183  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0408675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2138  hypothetical protein  31.73 
 
 		 382 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0268  hypothetical protein  32.29 
 
 		 383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2446  surface antigen (D15)  30.53 
 
 		 359 aa  125  1e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4198  hypothetical protein  28.05 
 
 		 425 aa  123  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3252  outer membrane protein  26.36 
 
 		 378 aa  121  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5327  hypothetical protein  28.21 
 
 		 358 aa  119  7e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5722  hypothetical protein  27.59 
 
 		 364 aa  110  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3342  Outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  24.57 
 
 		 358 aa  95.9  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.501978  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0737  hypothetical protein  25.66 
 
 		 430 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.000826338  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0774  hypothetical protein  25.66 
 
 		 408 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0774  hypothetical protein  25.37 
 
 		 407 aa  87.8  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3971  hypothetical protein  25.95 
 
 		 412 aa  87.4  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.42637  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0286  hypothetical protein  25.77 
 
 		 376 aa  87  4e-16  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.809571  normal  0.0827061 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1767  hypothetical protein  25.07 
 
 		 411 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00449343  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1599  surface antigen (D15)  23.98 
 
 		 367 aa  72.4  0.00000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3402  surface antigen (D15)  24.94 
 
 		 444 aa  70.9  0.00000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00692048  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3793  hypothetical protein  25.87 
 
 		 379 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3279  hypothetical protein  22.92 
 
 		 407 aa  69.3  0.00000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.710367  normal  0.0331702 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1096  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  27.33 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0234043 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1799  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  26.16 
 
 		 395 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1602  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  27.91 
 
 		 425 aa  68.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2423  hypothetical protein  21.63 
 
 		 432 aa  68.6  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3729  hypothetical protein  25.86 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1476  hypothetical protein  28.5 
 
 		 421 aa  63.5  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.197197  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3224  hypothetical protein  26.32 
 
 		 444 aa  62.4  0.00000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.050475  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4078  outer membrane protein/protective antigen OMA87-like protein  22.69 
 
 		 390 aa  57.8  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.47886  normal  0.117623 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6656  hypothetical protein  24.06 
 
 		 448 aa  57.4  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0781  hypothetical protein  25 
 
 		 394 aa  56.6  0.0000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.585384  normal  0.217138 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4112  surface antigen (D15)  21.93 
 
 		 414 aa  56.6  0.0000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000116065  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3162  surface antigen (D15)  20.23 
 
 		 414 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.153148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4990  hypothetical protein  21.58 
 
 		 378 aa  54.3  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3029  glyceraldehyde 3-phosphate dehydrogenase  23.66 
 
 		 421 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3731  hypothetical protein  23.46 
 
 		 886 aa  46.2  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0419  hypothetical protein  23.83 
 
 		 395 aa  45.8  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3409  surface antigen (D15)  23.62 
 
 		 430 aa  45.8  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4688  hypothetical protein  21.64 
 
 		 855 aa  45.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169817 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3353  surface antigen (D15)  20.45 
 
 		 427 aa  45.8  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1149  hypothetical protein  21.81 
 
 		 395 aa  45.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0368  putative lipoprotein  19.65 
 
 		 416 aa  44.3  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>