More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_0928 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_0928  outer envelope membrane protein  100 
 
 		 721 aa  1434    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4653  surface antigen (D15)  46.12 
 
 		 999 aa  575  1.0000000000000001e-163  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0482957 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3741  surface antigen (D15)  44.35 
 
 		 821 aa  562  1.0000000000000001e-159  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0094  surface antigen variable number  45.66 
 
 		 838 aa  547  1e-154  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39497  normal  0.155801 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2608  surface antigen (D15)  46.68 
 
 		 843 aa  545  1e-154  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0362  surface antigen (D15)  45.15 
 
 		 752 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0355  surface antigen (D15)  45.01 
 
 		 752 aa  540  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4497  surface antigen (D15)  47.62 
 
 		 688 aa  535  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05491  outer envelope membrane protein  38.71 
 
 		 762 aa  480  1e-134  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.445832 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0554  chloroplast outer envelope membrane protein-like  35.51 
 
 		 739 aa  443  1e-123  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2119  outer envelope membrane protein-like  36.8 
 
 		 736 aa  439  1e-121  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13921  membrane protein-like protein  35.88 
 
 		 743 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.802793 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14991  outer envelope membrane protein-like protein  36.26 
 
 		 714 aa  429  1e-118  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1436  outer envelope membrane protein-like  35.74 
 
 		 712 aa  418  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15241  outer envelope membrane protein-like protein  36.38 
 
 		 712 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15381  outer envelope membrane protein-like protein  35.26 
 
 		 712 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.613394  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0928  surface antigen (D15)  34.51 
 
 		 668 aa  361  3e-98  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1450  surface antigen (D15)  33.96 
 
 		 491 aa  258  2e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.490099  normal  0.0216399 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0909  import-associated channel, putative chloroplast protein IAP75  37.05 
 
 		 767 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17651  outer envelope membrane protein-like protein  36.14 
 
 		 767 aa  233  8.000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.773387 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1555  surface antigen (D15)  38.69 
 
 		 488 aa  177  7e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00258915  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  25.41 
 
 		 553 aa  175  2.9999999999999996e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50834  predicted protein  27.24 
 
 		 580 aa  167  5e-40  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0624274 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  23 
 
 		 560 aa  152  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  23.74 
 
 		 683 aa  129  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0815  surface antigen (D15)  23.01 
 
 		 961 aa  125  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36376  predicted protein  25.55 
 
 		 519 aa  124  5e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.09 
 
 		 772 aa  115  4.0000000000000004e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  24.94 
 
 		 888 aa  111  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.44 
 
 		 895 aa  105  4e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.35 
 
 		 770 aa  103  8e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  25.94 
 
 		 765 aa  102  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  24.44 
 
 		 767 aa  101  6e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  24.16 
 
 		 778 aa  100  9e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.27 
 
 		 829 aa  99.4  2e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.83 
 
 		 765 aa  99.4  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.83 
 
 		 750 aa  99.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  23.55 
 
 		 777 aa  99  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.32 
 
 		 770 aa  98.2  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  27.17 
 
 		 785 aa  97.8  6e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.32 
 
 		 857 aa  97.1  9e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  23.74 
 
 		 913 aa  97.1  1e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.27 
 
 		 793 aa  97.1  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.88 
 
 		 793 aa  95.9  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  22.37 
 
 		 806 aa  95.5  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  22.52 
 
 		 790 aa  95.5  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  23.33 
 
 		 784 aa  95.1  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.17 
 
 		 844 aa  95.1  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.5 
 
 		 821 aa  93.2  1e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.46 
 
 		 892 aa  94  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  21.9 
 
 		 802 aa  93.2  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1082  surface antigen (D15)  25.56 
 
 		 767 aa  93.6  1e-17  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23 
 
 		 769 aa  92.4  3e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.22 
 
 		 854 aa  91.7  4e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.22 
 
 		 864 aa  91.3  5e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.44 
 
 		 769 aa  90.9  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  21.99 
 
 		 791 aa  90.9  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  22.85 
 
 		 765 aa  90.9  8e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.49 
 
 		 855 aa  90.5  9e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  26.16 
 
 		 852 aa  90.5  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  26.03 
 
 		 758 aa  90.5  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.69 
 
 		 769 aa  89.7  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.16 
 
 		 768 aa  89.7  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.19 
 
 		 854 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.42 
 
 		 848 aa  88.6  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  21.77 
 
 		 752 aa  89  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  24.12 
 
 		 779 aa  88.6  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  23.46 
 
 		 768 aa  89  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.19 
 
 		 781 aa  88.6  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.46 
 
 		 769 aa  88.6  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  26.67 
 
 		 834 aa  88.2  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  25.11 
 
 		 768 aa  87.8  6e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  25.11 
 
 		 768 aa  87.8  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  25.11 
 
 		 768 aa  87.8  6e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  25.11 
 
 		 768 aa  87.8  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1971  putative outer membrane signal peptide protein  24.83 
 
 		 781 aa  87.8  6e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.208049  normal  0.130084 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  24.84 
 
 		 785 aa  87.8  7e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  25.11 
 
 		 769 aa  87.8  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  25.11 
 
 		 769 aa  87.8  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  25.11 
 
 		 769 aa  87.8  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  25.11 
 
 		 768 aa  87.4  8e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  24.05 
 
 		 765 aa  87.4  9e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  23.26 
 
 		 769 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.47 
 
 		 752 aa  87  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  23.29 
 
 		 769 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  23.29 
 
 		 769 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  23.68 
 
 		 767 aa  87  0.000000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  27.03 
 
 		 834 aa  86.7  0.000000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  22.6 
 
 		 820 aa  86.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0636  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.95 
 
 		 775 aa  86.3  0.000000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0791016  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.18 
 
 		 856 aa  84.7  0.000000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  23.94 
 
 		 844 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.09 
 
 		 841 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  24.48 
 
 		 896 aa  82.8  0.00000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.22 
 
 		 784 aa  81.6  0.00000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  24.11 
 
 		 781 aa  81.6  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.11 
 
 		 803 aa  81.6  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2607  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.71 
 
 		 811 aa  81.3  0.00000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.745531  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  23.79 
 
 		 845 aa  81.3  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  19.97 
 
 		 751 aa  80.5  0.0000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>