272 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_2119 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_17651  outer envelope membrane protein-like protein  52.31 
 
 
767 aa  749    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.773387 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0909  import-associated channel, putative chloroplast protein IAP75  53.32 
 
 
767 aa  758    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0554  chloroplast outer envelope membrane protein-like  74.36 
 
 
739 aa  1163    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2119  outer envelope membrane protein-like  100 
 
 
736 aa  1508    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1436  outer envelope membrane protein-like  47.05 
 
 
712 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05491  outer envelope membrane protein  65.95 
 
 
762 aa  964    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.445832 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13921  membrane protein-like protein  55.77 
 
 
743 aa  794    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.802793 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14991  outer envelope membrane protein-like protein  45.58 
 
 
714 aa  640    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15241  outer envelope membrane protein-like protein  47.55 
 
 
712 aa  625  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15381  outer envelope membrane protein-like protein  46.46 
 
 
712 aa  616  1e-175  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.613394  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0928  outer envelope membrane protein  36.81 
 
 
721 aa  419  9.999999999999999e-116  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3741  surface antigen (D15)  34.18 
 
 
821 aa  410  1e-113  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0094  surface antigen variable number  35.49 
 
 
838 aa  398  1e-109  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.39497  normal  0.155801 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4653  surface antigen (D15)  34.08 
 
 
999 aa  388  1e-106  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0482957 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2608  surface antigen (D15)  34.86 
 
 
843 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0355  surface antigen (D15)  32.53 
 
 
752 aa  363  6e-99  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4497  surface antigen (D15)  33.73 
 
 
688 aa  363  8e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0537472  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0362  surface antigen (D15)  32.53 
 
 
752 aa  362  1e-98  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0928  surface antigen (D15)  25.04 
 
 
668 aa  216  9.999999999999999e-55  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1450  surface antigen (D15)  27.78 
 
 
491 aa  168  4e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.490099  normal  0.0216399 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17680  surface antigen (D15)  24.25 
 
 
553 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_50834  predicted protein  24.77 
 
 
580 aa  108  2e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0624274 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  27.08 
 
 
834 aa  99  3e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1555  surface antigen (D15)  31.78 
 
 
488 aa  97.8  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00258915  normal  0.176351 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  27.08 
 
 
852 aa  95.9  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0815  surface antigen (D15)  22.19 
 
 
961 aa  91.7  4e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.61 
 
 
821 aa  90.9  8e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  28.12 
 
 
840 aa  89.4  3e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  25.68 
 
 
843 aa  88.2  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.64 
 
 
855 aa  86.7  0.000000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.75 
 
 
829 aa  87  0.000000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  24.53 
 
 
844 aa  87  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0254  surface antigen (D15)  20.73 
 
 
683 aa  87  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0103892  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.17 
 
 
857 aa  86.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  25.77 
 
 
845 aa  86.3  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1295  surface antigen (D15)  28.41 
 
 
560 aa  86.3  0.000000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000151502  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  24.82 
 
 
843 aa  85.1  0.000000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.56 
 
 
841 aa  84.3  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  26.94 
 
 
785 aa  83.2  0.00000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  27.03 
 
 
841 aa  82.8  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.73 
 
 
856 aa  83.2  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.64 
 
 
844 aa  81.3  0.00000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  27.67 
 
 
834 aa  81.3  0.00000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.64 
 
 
854 aa  81.3  0.00000000000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.64 
 
 
854 aa  80.9  0.00000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  28.91 
 
 
777 aa  80.9  0.00000000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.64 
 
 
864 aa  80.9  0.00000000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.62 
 
 
772 aa  80.5  0.00000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  26.74 
 
 
781 aa  79.3  0.0000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.74 
 
 
803 aa  79.7  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  29.44 
 
 
785 aa  77.8  0.0000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  32.52 
 
 
888 aa  77.8  0.0000000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  28.9 
 
 
778 aa  77  0.000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1082  surface antigen (D15)  25.19 
 
 
767 aa  75.1  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0611  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.05 
 
 
920 aa  75.5  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.310998  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  29.29 
 
 
794 aa  73.9  0.000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5827  putative protective surface antigen precursor (Outer membrane protein D15)  26.14 
 
 
782 aa  73.9  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  24.7 
 
 
790 aa  73.2  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1446  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.84 
 
 
800 aa  69.7  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0164  OMP85 family outer membrane protein  27.01 
 
 
739 aa  67.4  0.0000000009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00465042  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00175  hypothetical protein  25.7 
 
 
810 aa  67  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000980871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3426  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.7 
 
 
810 aa  67  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480767  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0187  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.7 
 
 
810 aa  67  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00010789  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0124  OMP85 family outer membrane protein  27.01 
 
 
739 aa  66.6  0.000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3483  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.7 
 
 
810 aa  67  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000802072  normal  0.102232 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2711  putative outer membrane protein  32.81 
 
 
799 aa  67  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.902664  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00174  hypothetical protein  25.7 
 
 
810 aa  67  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00018653  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1369  surface antigen (D15)  32.81 
 
 
799 aa  67  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.747321  decreased coverage  0.00880921 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0188  outer membrane protein assembly factor YaeT  25 
 
 
810 aa  67  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000418762  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  24.3 
 
 
785 aa  67.4  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0170  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.7 
 
 
810 aa  67  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000513305  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0179  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.7 
 
 
810 aa  67  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000266992  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0181  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.7 
 
 
810 aa  67  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000194171  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30 
 
 
892 aa  66.2  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.91 
 
 
895 aa  66.6  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0290  hypothetical protein  24.83 
 
 
981 aa  66.6  0.000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  22.48 
 
 
788 aa  66.2  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3999  surface antigen (D15)  28.29 
 
 
782 aa  66.2  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54012  normal  0.826111 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.13 
 
 
804 aa  65.5  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0847749 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.17 
 
 
804 aa  64.7  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25845  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0142  OMP85 family outer membrane protein  26.47 
 
 
739 aa  64.7  0.000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0561822  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0250  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.17 
 
 
810 aa  64.7  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.609554  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.17 
 
 
810 aa  64.7  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  0.197895 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  30.53 
 
 
910 aa  64.7  0.000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0265  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.5 
 
 
803 aa  64.3  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000300024  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2607  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.15 
 
 
811 aa  64.3  0.000000008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.745531  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  25.44 
 
 
893 aa  64.3  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.66 
 
 
831 aa  63.9  0.000000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000452148  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.34 
 
 
895 aa  63.9  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0636  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.66 
 
 
775 aa  63.5  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0791016  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2146  surface antigen (D15)  31.54 
 
 
792 aa  63.5  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.766596  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0891  surface antigen (D15)  29.95 
 
 
896 aa  63.5  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  22.55 
 
 
766 aa  63.2  0.00000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1458  surface antigen (D15)  23.72 
 
 
780 aa  63.2  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.46 
 
 
781 aa  63.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  24.11 
 
 
820 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1684  surface antigen (D15)  22.2 
 
 
862 aa  63.2  0.00000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.434922  normal  0.438103 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  28.46 
 
 
781 aa  63.2  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  22.03 
 
 
765 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  22.28 
 
 
765 aa  62.8  0.00000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>