More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0330 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_0400  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  64.2 
 
 		 827 aa  1087    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000108596  unclonable  0.0000045929 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1751  surface antigen family protein  67.3 
 
 		 820 aa  1129    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0463  surface antigen family protein  66.88 
 
 		 858 aa  1121    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0397  surface antigen (D15)  73.92 
 
 		 830 aa  1297    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00277353  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  100 
 
 		 831 aa  1693    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000452148  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0432  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  71.41 
 
 		 834 aa  1206    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  62.5 
 
 		 821 aa  1073    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000592139  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.59 
 
 		 865 aa  474  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.518377  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3412  outer membrane protein; surface antigen  33.87 
 
 		 848 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4388  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.71 
 
 		 865 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1959  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.77 
 
 		 836 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.364204  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1357  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.7 
 
 		 844 aa  429  1e-119  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0741004  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0986  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.98 
 
 		 838 aa  431  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1052  surface antigen variable number repeat protein  31.99 
 
 		 914 aa  432  1e-119  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000329593  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04315  putative outer membrane protein  34.2 
 
 		 860 aa  409  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0191  outer membrane protein, putative  30.8 
 
 		 891 aa  386  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.796772 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0782  hypothetical protein  31.49 
 
 		 895 aa  381  1e-104  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1690  surface antigen (D15)  33.76 
 
 		 900 aa  306  1.0000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  27.4 
 
 		 752 aa  249  2e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  27.48 
 
 		 913 aa  243  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.42 
 
 		 892 aa  241  4e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  25.99 
 
 		 888 aa  241  4e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  26.51 
 
 		 769 aa  237  5.0000000000000005e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  27.17 
 
 		 765 aa  236  1.0000000000000001e-60  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.77 
 
 		 808 aa  229  1e-58  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  25.71 
 
 		 772 aa  227  5.0000000000000005e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.66 
 
 		 895 aa  228  5.0000000000000005e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  26.35 
 
 		 751 aa  221  5e-56  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.47 
 
 		 802 aa  218  4e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1356  surface antigen (D15)  27.38 
 
 		 826 aa  217  5.9999999999999996e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000205975  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2807  surface antigen (D15)  27.34 
 
 		 826 aa  217  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000285002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2633  surface antigen (D15)  27.34 
 
 		 826 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000445373  normal  0.203506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2700  surface antigen (D15)  27.34 
 
 		 826 aa  215  2.9999999999999995e-54  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000360043  hitchhiker  0.00504138 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2894  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.51 
 
 		 826 aa  215  3.9999999999999995e-54  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172199  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1489  surface antigen (D15)  27.51 
 
 		 826 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1453  surface antigen (D15)  27.51 
 
 		 826 aa  214  4.9999999999999996e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000244779  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3273  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.64 
 
 		 827 aa  213  1e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1458  surface antigen (D15)  27.23 
 
 		 827 aa  213  1e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000234879  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1637  surface antigen  27.09 
 
 		 826 aa  211  6e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.11 
 
 		 758 aa  210  7e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1053  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.12 
 
 		 807 aa  209  1e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2877  surface antigen (D15)  27.39 
 
 		 827 aa  209  2e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000948  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  26.18 
 
 		 763 aa  209  2e-52  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.7 
 
 		 752 aa  208  3e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1147  surface antigen  26.62 
 
 		 844 aa  207  5e-52  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003885  normal  0.883859 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  25.71 
 
 		 790 aa  207  5e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.46 
 
 		 895 aa  206  1e-51  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  24.48 
 
 		 786 aa  206  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1278  surface antigen (D15)  27.16 
 
 		 827 aa  204  4e-51  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00357264  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  24.36 
 
 		 786 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.66 
 
 		 799 aa  204  5e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.75 
 
 		 787 aa  204  7e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2627  surface antigen (D15)  25.33 
 
 		 827 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0218715  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.61 
 
 		 784 aa  203  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.65 
 
 		 772 aa  202  1.9999999999999998e-50  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  24.6 
 
 		 787 aa  201  5e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  23.98 
 
 		 792 aa  200  9e-50  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0265  outer membrane protein assembly factor YaeT  26 
 
 		 803 aa  199  1.0000000000000001e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000300024  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  24.47 
 
 		 787 aa  199  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  26.7 
 
 		 777 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  25.46 
 
 		 910 aa  199  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.64 
 
 		 801 aa  199  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000907033  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  25.42 
 
 		 785 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  23.53 
 
 		 763 aa  198  3e-49  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  23.98 
 
 		 791 aa  198  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.97 
 
 		 804 aa  197  6e-49  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25845  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  24.01 
 
 		 786 aa  197  6e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3153  surface antigen (D15)  26.08 
 
 		 827 aa  197  7e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000352533  normal  0.0112151 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0262  outer membrane protein assembly factor YaeT  26 
 
 		 803 aa  196  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0949  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.84 
 
 		 809 aa  196  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00135315  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2334  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.78 
 
 		 763 aa  195  2e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117402 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0724  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.21 
 
 		 803 aa  193  9e-48  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.000000000000238666  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0623  outer membrane protein assembly factor  24.21 
 
 		 803 aa  193  9e-48  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000661464  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0250  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.84 
 
 		 810 aa  193  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.609554  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1368  OMP85 family outer membrane protein  24.12 
 
 		 893 aa  193  1e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.84 
 
 		 810 aa  193  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  0.197895 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.78 
 
 		 848 aa  192  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  24.94 
 
 		 794 aa  192  2e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1708  surface antigen (D15)  25.48 
 
 		 807 aa  191  4e-47  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0930875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0715  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.63 
 
 		 805 aa  191  5e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000733739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1562  surface antigen (D15)  26.71 
 
 		 827 aa  191  7e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000380588  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.74 
 
 		 803 aa  190  8e-47  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0188  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.72 
 
 		 810 aa  190  1e-46  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000418762  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  25.55 
 
 		 781 aa  189  1e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  24.32 
 
 		 770 aa  190  1e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.87 
 
 		 770 aa  189  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00175  hypothetical protein  25.39 
 
 		 810 aa  189  2e-46  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000980871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3426  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.39 
 
 		 810 aa  189  2e-46  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480767  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  22.73 
 
 		 796 aa  189  2e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0170  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.39 
 
 		 810 aa  189  2e-46  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000513305  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  25.74 
 
 		 767 aa  189  2e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00174  hypothetical protein  25.39 
 
 		 810 aa  189  2e-46  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00018653  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0179  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.39 
 
 		 810 aa  189  2e-46  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000266992  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0187  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.39 
 
 		 810 aa  189  2e-46  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00010789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3483  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.39 
 
 		 810 aa  189  2e-46  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000802072  normal  0.102232 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0181  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.39 
 
 		 810 aa  189  2e-46  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000194171  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1529  putative surface antigen (D15)  25.03 
 
 		 803 aa  188  3e-46  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000190996  normal  0.0121061 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.95 
 
 		 797 aa  188  3e-46  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  22.82 
 
 		 795 aa  188  4e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  24.5 
 
 		 781 aa  187  5e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>