More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0397 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1751  surface antigen family protein  66.08 
 
 		 820 aa  1107    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0463  surface antigen family protein  62.5 
 
 		 858 aa  1113    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  60.84 
 
 		 821 aa  1008    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000592139  normal  0.27128 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0432  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  69.65 
 
 		 834 aa  1192    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0400  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  61.2 
 
 		 827 aa  1029    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.00000108596  unclonable  0.0000045929 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  73.92 
 
 		 831 aa  1297    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000452148  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0397  surface antigen (D15)  100 
 
 		 830 aa  1693    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00277353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4434  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.99 
 
 		 865 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.518377  normal  0.315744 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3412  outer membrane protein; surface antigen  33.02 
 
 		 848 aa  445  1e-123  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1959  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.34 
 
 		 836 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.364204  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1052  surface antigen variable number repeat protein  31.49 
 
 		 914 aa  437  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000329593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4388  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.79 
 
 		 865 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.21265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0986  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.3 
 
 		 838 aa  422  1e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1357  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.1 
 
 		 844 aa  415  1e-114  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0741004  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0191  outer membrane protein, putative  30.59 
 
 		 891 aa  382  1e-104  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.796772 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04315  putative outer membrane protein  33.45 
 
 		 860 aa  378  1e-103  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0782  hypothetical protein  31.06 
 
 		 895 aa  358  2.9999999999999997e-97  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1690  surface antigen (D15)  33.81 
 
 		 900 aa  311  2e-83  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  28.24 
 
 		 752 aa  260  6e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  26.56 
 
 		 769 aa  248  2e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  26.21 
 
 		 765 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.14 
 
 		 808 aa  241  5e-62  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  26.82 
 
 		 913 aa  241  5e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  26.33 
 
 		 888 aa  240  8e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.73 
 
 		 892 aa  234  4.0000000000000004e-60  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  27.72 
 
 		 751 aa  234  7.000000000000001e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.25 
 
 		 802 aa  229  1e-58  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.43 
 
 		 895 aa  229  2e-58  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.55 
 
 		 758 aa  219  2e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  25.71 
 
 		 772 aa  217  8e-55  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  27.16 
 
 		 763 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.72 
 
 		 752 aa  211  6e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2633  surface antigen (D15)  26.35 
 
 		 826 aa  205  3e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000445373  normal  0.203506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2700  surface antigen (D15)  26.35 
 
 		 826 aa  205  3e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000360043  hitchhiker  0.00504138 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1147  surface antigen  26.38 
 
 		 844 aa  204  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003885  normal  0.883859 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  24.1 
 
 		 905 aa  204  5e-51  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1356  surface antigen (D15)  25.93 
 
 		 826 aa  204  7e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000205975  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.43 
 
 		 769 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2807  surface antigen (D15)  26.5 
 
 		 826 aa  203  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000285002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1453  surface antigen (D15)  26.21 
 
 		 826 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000244779  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1458  surface antigen (D15)  26.64 
 
 		 827 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000234879  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1489  surface antigen (D15)  26.21 
 
 		 826 aa  202  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390259  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2894  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.21 
 
 		 826 aa  201  3e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172199  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1278  surface antigen (D15)  26.48 
 
 		 827 aa  202  3e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00357264  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1574  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.69 
 
 		 786 aa  201  6e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  26.12 
 
 		 767 aa  199  2.0000000000000003e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  26 
 
 		 777 aa  198  4.0000000000000005e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  25.09 
 
 		 790 aa  198  4.0000000000000005e-49  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1637  surface antigen  26.07 
 
 		 826 aa  197  5.000000000000001e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0073  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  23.29 
 
 		 772 aa  197  6e-49  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00110643  hitchhiker  5.06207e-17 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2996  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.05 
 
 		 895 aa  197  8.000000000000001e-49  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.79 
 
 		 801 aa  196  1e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000907033  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3273  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.26 
 
 		 827 aa  196  1e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.02 
 
 		 769 aa  196  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.03 
 
 		 770 aa  196  1e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2877  surface antigen (D15)  27.32 
 
 		 827 aa  196  1e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000948  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.88 
 
 		 780 aa  196  2e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0949  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.52 
 
 		 809 aa  196  2e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00135315  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1562  surface antigen (D15)  26.25 
 
 		 827 aa  194  4e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000380588  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.02 
 
 		 770 aa  194  6e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3352  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.15 
 
 		 815 aa  194  6e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346772  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2627  surface antigen (D15)  25.75 
 
 		 827 aa  194  8e-48  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0218715  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0623  outer membrane protein assembly factor  24.34 
 
 		 803 aa  193  1e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000661464  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0724  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.34 
 
 		 803 aa  193  1e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.000000000000238666  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2334  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.56 
 
 		 763 aa  193  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0117402 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  25.35 
 
 		 786 aa  193  1e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  23.64 
 
 		 770 aa  192  2e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.97 
 
 		 768 aa  192  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3157  outer membrane protein assembly factor YaeT  25.03 
 
 		 805 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0017892  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  24.88 
 
 		 785 aa  191  5e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3153  surface antigen (D15)  25.11 
 
 		 827 aa  189  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000352533  normal  0.0112151 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  23.87 
 
 		 766 aa  189  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  24.84 
 
 		 768 aa  189  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  24.03 
 
 		 791 aa  188  3e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.9 
 
 		 793 aa  188  4e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.13 
 
 		 848 aa  188  5e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1053  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.78 
 
 		 807 aa  187  5e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2419  outer membrane protein assembly factor YaeT  24.58 
 
 		 806 aa  188  5e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0333898  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.62 
 
 		 787 aa  187  5e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  25.07 
 
 		 887 aa  187  7e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  24.07 
 
 		 784 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  23.12 
 
 		 763 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  26.67 
 
 		 806 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  25.21 
 
 		 820 aa  185  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  24.71 
 
 		 792 aa  185  3e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.88 
 
 		 769 aa  185  3e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.61 
 
 		 804 aa  185  3e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25845  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  23.65 
 
 		 910 aa  185  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  24.81 
 
 		 760 aa  184  4.0000000000000006e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.19 
 
 		 793 aa  185  4.0000000000000006e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  23.47 
 
 		 796 aa  184  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  24.75 
 
 		 769 aa  184  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  24.75 
 
 		 769 aa  184  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  25.24 
 
 		 781 aa  183  9.000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  23.93 
 
 		 786 aa  183  1e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  24.47 
 
 		 769 aa  183  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  24.72 
 
 		 768 aa  183  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1021  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.84 
 
 		 795 aa  183  1e-44  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000998639  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3427  outer membrane protein assembly factor YaeT  23.84 
 
 		 795 aa  183  1e-44  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000902719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1446  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  24.64 
 
 		 800 aa  183  1e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>