More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BR1154 on replicon NC_004310
Organism: Brucella suis 1330



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  52.8 
 
 		 778 aa  798    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  100 
 
 		 781 aa  1580    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  91.72 
 
 		 785 aa  1477    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  52.61 
 
 		 779 aa  795    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  52.8 
 
 		 780 aa  794    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  57.14 
 
 		 798 aa  932    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  60.4 
 
 		 788 aa  939    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  43.31 
 
 		 834 aa  642    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  54.37 
 
 		 777 aa  823    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  99.87 
 
 		 803 aa  1577    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  40.85 
 
 		 841 aa  592  1e-168  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  40.56 
 
 		 843 aa  592  1e-168  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  38.99 
 
 		 841 aa  591  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  38.9 
 
 		 852 aa  587  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  40.07 
 
 		 843 aa  580  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  39.85 
 
 		 845 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  39.48 
 
 		 844 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  40 
 
 		 855 aa  575  1.0000000000000001e-162  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  40.25 
 
 		 821 aa  570  1e-161  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  39.68 
 
 		 834 aa  568  1e-160  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  39.21 
 
 		 840 aa  565  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.58 
 
 		 829 aa  557  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  40.05 
 
 		 857 aa  551  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.09 
 
 		 856 aa  546  1e-154  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.1 
 
 		 864 aa  535  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.89 
 
 		 844 aa  537  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.1 
 
 		 854 aa  535  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.98 
 
 		 854 aa  531  1e-149  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.26 
 
 		 785 aa  506  9.999999999999999e-143  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5827  putative protective surface antigen precursor (Outer membrane protein D15)  37.08 
 
 		 782 aa  494  9.999999999999999e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  37.64 
 
 		 794 aa  490  1e-137  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1388  surface antigen (D15)  37.39 
 
 		 795 aa  488  1e-136  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0577653  normal  0.0157833 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  35.8 
 
 		 785 aa  444  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.42 
 
 		 804 aa  438  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847749 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2146  surface antigen (D15)  35.61 
 
 		 792 aa  438  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.766596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  34.67 
 
 		 785 aa  438  1e-121  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3999  surface antigen (D15)  34.86 
 
 		 782 aa  424  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54012  normal  0.826111 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  33.13 
 
 		 887 aa  420  1e-116  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2711  putative outer membrane protein  35.14 
 
 		 799 aa  419  9.999999999999999e-116  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.902664  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1369  surface antigen (D15)  34.64 
 
 		 799 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.747321  decreased coverage  0.00880921 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  32.65 
 
 		 905 aa  407  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  34.1 
 
 		 910 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  32.98 
 
 		 767 aa  399  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1407  surface antigen (D15)  31.98 
 
 		 796 aa  375  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1499  hypothetical protein  33.73 
 
 		 748 aa  360  7e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696254  normal  0.873913 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2453  surface antigen (D15)  30.87 
 
 		 772 aa  353  5.9999999999999994e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0002154 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.32 
 
 		 765 aa  349  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  29.76 
 
 		 790 aa  347  4e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  31.31 
 
 		 765 aa  343  9e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.31 
 
 		 765 aa  342  1e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  29.99 
 
 		 770 aa  331  3e-89  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.37 
 
 		 800 aa  331  3e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  30.67 
 
 		 779 aa  325  2e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.22 
 
 		 752 aa  321  3e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  30.69 
 
 		 766 aa  320  7.999999999999999e-86  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  29.9 
 
 		 765 aa  319  1e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.87 
 
 		 784 aa  318  3e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.7 
 
 		 769 aa  317  4e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  28.7 
 
 		 769 aa  317  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  28.83 
 
 		 768 aa  317  5e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  28.7 
 
 		 769 aa  317  5e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.28 
 
 		 768 aa  317  6e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  28.57 
 
 		 769 aa  317  6e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  28.57 
 
 		 769 aa  317  6e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  30.26 
 
 		 763 aa  317  6e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  30.05 
 
 		 804 aa  317  7e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25845  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  28.44 
 
 		 768 aa  317  7e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  28.57 
 
 		 769 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0863  surface antigen (D15):surface antigen variable number  29.67 
 
 		 769 aa  316  9.999999999999999e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  29.86 
 
 		 769 aa  316  9.999999999999999e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  28.57 
 
 		 768 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  28.57 
 
 		 768 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  28.57 
 
 		 768 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1750  surface antigen (D15):surface antigen variable number  29.92 
 
 		 761 aa  315  1.9999999999999998e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.330816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  29.95 
 
 		 790 aa  315  1.9999999999999998e-84  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  28.57 
 
 		 768 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.33 
 
 		 769 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1446  surface antigen (D15)  29.24 
 
 		 765 aa  315  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.332057 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  28.31 
 
 		 769 aa  314  4.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  29.11 
 
 		 781 aa  313  5.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.11 
 
 		 781 aa  313  5.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.82 
 
 		 769 aa  310  5e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  28.66 
 
 		 760 aa  310  5.9999999999999995e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1766  surface antigen (D15)  30.11 
 
 		 766 aa  310  5.9999999999999995e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0726033  normal  0.0207518 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0265  outer membrane protein assembly factor YaeT  29.65 
 
 		 803 aa  310  8e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000300024  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.7 
 
 		 765 aa  309  1.0000000000000001e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  29.12 
 
 		 791 aa  309  1.0000000000000001e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.37 
 
 		 769 aa  309  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  28.88 
 
 		 752 aa  309  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.27 
 
 		 770 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2842  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.68 
 
 		 770 aa  305  2.0000000000000002e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  28.98 
 
 		 765 aa  305  3.0000000000000004e-81  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.51 
 
 		 808 aa  304  4.0000000000000003e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  28.97 
 
 		 784 aa  304  4.0000000000000003e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0262  outer membrane protein assembly factor YaeT  29.53 
 
 		 803 aa  304  5.000000000000001e-81  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.63 
 
 		 758 aa  304  5.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2687  surface antigen (D15)  29.13 
 
 		 784 aa  304  5.000000000000001e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.379638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  29.42 
 
 		 781 aa  304  5.000000000000001e-81  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  27.6 
 
 		 767 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  29.68 
 
 		 801 aa  303  9e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000907033  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>