More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_1138 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  44.78 
 
 		 798 aa  691    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  67.94 
 
 		 779 aa  1032    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  53.49 
 
 		 785 aa  820    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  54.37 
 
 		 781 aa  823    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  100 
 
 		 777 aa  1562    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  54.16 
 
 		 788 aa  799    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  67.82 
 
 		 780 aa  1033    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  54.37 
 
 		 803 aa  823    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  66.67 
 
 		 778 aa  1046    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  41.4 
 
 		 834 aa  608  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  40.21 
 
 		 855 aa  593  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.07 
 
 		 821 aa  583  1.0000000000000001e-165  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  40.16 
 
 		 841 aa  579  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.75 
 
 		 829 aa  574  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  40.05 
 
 		 844 aa  567  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.59 
 
 		 857 aa  567  1e-160  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  38.72 
 
 		 841 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  38.98 
 
 		 843 aa  561  1e-158  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.79 
 
 		 856 aa  556  1e-157  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  38.21 
 
 		 843 aa  558  1e-157  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  38.02 
 
 		 852 aa  557  1e-157  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  39.28 
 
 		 845 aa  554  1e-156  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.24 
 
 		 854 aa  547  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.12 
 
 		 864 aa  548  1e-154  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  39.05 
 
 		 840 aa  547  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  39.08 
 
 		 844 aa  548  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.12 
 
 		 854 aa  547  1e-154  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  38.61 
 
 		 834 aa  543  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  38.65 
 
 		 794 aa  508  9.999999999999999e-143  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  36.68 
 
 		 785 aa  499  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5827  putative protective surface antigen precursor (Outer membrane protein D15)  37.13 
 
 		 782 aa  499  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1388  surface antigen (D15)  36.02 
 
 		 795 aa  481  1e-134  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0577653  normal  0.0157833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.65 
 
 		 785 aa  471  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  35.87 
 
 		 785 aa  458  1e-127  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2146  surface antigen (D15)  35.6 
 
 		 792 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.766596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3999  surface antigen (D15)  36.21 
 
 		 782 aa  441  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54012  normal  0.826111 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.44 
 
 		 804 aa  437  1e-121  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847749 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2711  putative outer membrane protein  34.09 
 
 		 799 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.902664  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  32.23 
 
 		 905 aa  429  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  34.58 
 
 		 910 aa  428  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1369  surface antigen (D15)  34.09 
 
 		 799 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.747321  decreased coverage  0.00880921 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  31.79 
 
 		 767 aa  412  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2453  surface antigen (D15)  33.03 
 
 		 772 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0002154 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1407  surface antigen (D15)  33.46 
 
 		 796 aa  397  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  33.05 
 
 		 887 aa  393  1e-108  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1499  hypothetical protein  33.24 
 
 		 748 aa  387  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696254  normal  0.873913 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  31.08 
 
 		 751 aa  359  9.999999999999999e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0863  surface antigen (D15):surface antigen variable number  30.03 
 
 		 769 aa  354  2.9999999999999997e-96  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  29.63 
 
 		 790 aa  350  5e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.74 
 
 		 758 aa  348  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  31.03 
 
 		 760 aa  346  1e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  29.59 
 
 		 770 aa  339  9.999999999999999e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  30.1 
 
 		 752 aa  337  3.9999999999999995e-91  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  29.53 
 
 		 769 aa  335  2e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1071  OMP85 family outer membrane protein  29.1 
 
 		 773 aa  333  1e-89  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0702133  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.9 
 
 		 781 aa  331  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  27.9 
 
 		 781 aa  331  2e-89  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.53 
 
 		 808 aa  327  4.0000000000000003e-88  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1085  surface antigen  30.39 
 
 		 778 aa  327  6e-88  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.06 
 
 		 768 aa  327  6e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  29.72 
 
 		 765 aa  326  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.61 
 
 		 769 aa  326  1e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  29.06 
 
 		 768 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.06 
 
 		 769 aa  325  3e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  28.91 
 
 		 763 aa  325  3e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  31.18 
 
 		 763 aa  323  6e-87  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  28.93 
 
 		 769 aa  323  7e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  28.93 
 
 		 769 aa  323  7e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.78 
 
 		 802 aa  323  9.000000000000001e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  29.06 
 
 		 769 aa  322  9.999999999999999e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  29.72 
 
 		 769 aa  322  1.9999999999999998e-86  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.52 
 
 		 752 aa  321  3e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  29.72 
 
 		 768 aa  321  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  29.72 
 
 		 768 aa  321  3e-86  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  29.72 
 
 		 768 aa  321  3e-86  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  29.72 
 
 		 768 aa  321  3e-86  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  29.76 
 
 		 888 aa  321  3e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.93 
 
 		 769 aa  320  9e-86  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29 
 
 		 769 aa  319  1e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  29.72 
 
 		 768 aa  318  2e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.01 
 
 		 799 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  28.81 
 
 		 792 aa  318  3e-85  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  29.59 
 
 		 769 aa  318  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  29.21 
 
 		 767 aa  318  3e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  29.59 
 
 		 769 aa  318  3e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0949  outer membrane protein assembly factor YaeT  30.1 
 
 		 809 aa  316  9e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00135315  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.43 
 
 		 770 aa  316  9.999999999999999e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.29 
 
 		 770 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  29.23 
 
 		 794 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1458  surface antigen (D15)  31.23 
 
 		 780 aa  313  5.999999999999999e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.26 
 
 		 797 aa  313  1e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  28.72 
 
 		 787 aa  312  2e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  28.72 
 
 		 787 aa  312  2e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.48 
 
 		 765 aa  312  2e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  30.48 
 
 		 765 aa  312  2e-83  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.4 
 
 		 787 aa  309  1.0000000000000001e-82  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  30.03 
 
 		 790 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  30.09 
 
 		 779 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.17 
 
 		 784 aa  308  2.0000000000000002e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  28.3 
 
 		 766 aa  309  2.0000000000000002e-82  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>