More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0665 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  45.34 
 
 
758 aa  684    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  52.36 
 
 
768 aa  791    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  49.07 
 
 
769 aa  743    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  43.2 
 
 
786 aa  656    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  42.36 
 
 
787 aa  637    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  52.74 
 
 
750 aa  791    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2447  OMP85 family outer membrane protein  49.54 
 
 
796 aa  729    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.019137  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2842  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  47.42 
 
 
770 aa  714    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  51.98 
 
 
765 aa  791    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  44.01 
 
 
787 aa  645    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  43.18 
 
 
784 aa  660    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  43.04 
 
 
795 aa  667    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  52.36 
 
 
769 aa  791    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  43.63 
 
 
791 aa  669    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  41.37 
 
 
790 aa  639    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1766  surface antigen (D15)  48.29 
 
 
766 aa  750    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0726033  normal  0.0207518 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1750  surface antigen (D15):surface antigen variable number  58.3 
 
 
761 aa  908    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.330816  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  51.44 
 
 
784 aa  791    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  42.48 
 
 
797 aa  657    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  61.02 
 
 
770 aa  958    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1971  putative outer membrane signal peptide protein  47.64 
 
 
781 aa  670    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.208049  normal  0.130084 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  52.23 
 
 
769 aa  790    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  49.93 
 
 
766 aa  746    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  42.14 
 
 
796 aa  644    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  48.09 
 
 
765 aa  734    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  42.36 
 
 
787 aa  637    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  51.69 
 
 
769 aa  780    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  51.69 
 
 
769 aa  782    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  47.42 
 
 
758 aa  719    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  50.92 
 
 
770 aa  776    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  42.69 
 
 
786 aa  654    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  48.63 
 
 
765 aa  745    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  100 
 
 
760 aa  1544    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  47.4 
 
 
781 aa  724    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  52.09 
 
 
768 aa  790    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1446  surface antigen (D15)  47.21 
 
 
765 aa  720    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.332057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2607  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  45.59 
 
 
811 aa  675    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.745531  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  43.02 
 
 
787 aa  658    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  56.69 
 
 
784 aa  862    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  47.51 
 
 
779 aa  719    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  54.37 
 
 
790 aa  882    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2687  surface antigen (D15)  47.38 
 
 
784 aa  736    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.379638  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  50.93 
 
 
767 aa  773    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  48.45 
 
 
765 aa  727    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  52.65 
 
 
765 aa  795    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  51.38 
 
 
791 aa  784    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  51.28 
 
 
768 aa  772    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  52.36 
 
 
768 aa  791    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  51.69 
 
 
769 aa  780    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  48.5 
 
 
765 aa  744    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  52.36 
 
 
768 aa  791    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  52.36 
 
 
768 aa  793    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  50.33 
 
 
770 aa  757    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  51.55 
 
 
768 aa  779    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  42.52 
 
 
794 aa  658    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  51.69 
 
 
769 aa  780    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  52.23 
 
 
769 aa  790    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  51.82 
 
 
769 aa  781    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  48.4 
 
 
769 aa  751    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  43.2 
 
 
786 aa  656    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  43.95 
 
 
800 aa  688    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  42.11 
 
 
799 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  42.97 
 
 
788 aa  630  1e-179  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  43.26 
 
 
772 aa  627  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1489  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  41.24 
 
 
780 aa  626  1e-178  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  40.53 
 
 
792 aa  627  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  42.91 
 
 
784 aa  627  1e-178  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0322  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  43.06 
 
 
784 aa  622  1e-177  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1458  surface antigen (D15)  41.62 
 
 
780 aa  612  1e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  40.34 
 
 
781 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  40.34 
 
 
781 aa  605  9.999999999999999e-173  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1855  surface antigen (D15)  43.59 
 
 
799 aa  606  9.999999999999999e-173  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  39.42 
 
 
790 aa  584  1.0000000000000001e-165  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0569  hypothetical protein  40.44 
 
 
770 aa  568  1e-160  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0545  hypothetical protein  40.44 
 
 
770 aa  568  1e-160  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  37.5 
 
 
781 aa  548  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1843  outer membrane protein assembly factor YaeT  37.08 
 
 
803 aa  530  1e-149  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000194278  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1278  surface antigen (D15)  36.15 
 
 
827 aa  529  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00357264  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  38.55 
 
 
763 aa  528  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1356  surface antigen (D15)  36 
 
 
826 aa  526  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000205975  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  37.84 
 
 
801 aa  528  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000907033  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2633  surface antigen (D15)  36.13 
 
 
826 aa  527  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000445373  normal  0.203506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2700  surface antigen (D15)  36.13 
 
 
826 aa  527  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000360043  hitchhiker  0.00504138 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2807  surface antigen (D15)  36.25 
 
 
826 aa  528  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000285002  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2894  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.13 
 
 
826 aa  525  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172199  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1637  surface antigen  35.88 
 
 
826 aa  523  1e-147  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002754  outer membrane protein assembly factor YaeT precursor  36.82 
 
 
804 aa  524  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604223  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1489  surface antigen (D15)  36.13 
 
 
826 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390259  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3153  surface antigen (D15)  35.31 
 
 
827 aa  524  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000352533  normal  0.0112151 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1453  surface antigen (D15)  36.13 
 
 
826 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000244779  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2627  surface antigen (D15)  34.98 
 
 
827 aa  520  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0218715  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1021  outer membrane protein assembly factor YaeT  37.75 
 
 
795 aa  521  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000998639  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3427  outer membrane protein assembly factor YaeT  37.75 
 
 
795 aa  521  1e-146  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000902719  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3157  outer membrane protein assembly factor YaeT  37.61 
 
 
805 aa  520  1e-146  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0017892  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3273  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.71 
 
 
827 aa  522  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1074  outer membrane protein assembly factor YaeT  37.75 
 
 
795 aa  521  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000979052  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0949  outer membrane protein assembly factor YaeT  37.24 
 
 
809 aa  519  1e-146  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00135315  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03229  outer membrane protein assembly factor YaeT  36.57 
 
 
804 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2968  surface antigen (D15)  36.47 
 
 
802 aa  516  1.0000000000000001e-145  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.270101  normal  0.279532 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2972  outer membrane protein assembly factor YaeT  37.81 
 
 
807 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0353111  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>