More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_1443 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  56.31 
 
 		 768 aa  877    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  54.72 
 
 		 769 aa  882    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  58.47 
 
 		 750 aa  912    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  100 
 
 		 758 aa  1534    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  59.66 
 
 		 765 aa  923    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  46.37 
 
 		 800 aa  743    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  56.31 
 
 		 769 aa  876    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  48.1 
 
 		 784 aa  733    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1750  surface antigen (D15):surface antigen variable number  46.01 
 
 		 761 aa  699    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.330816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  59.71 
 
 		 784 aa  930    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  46.09 
 
 		 770 aa  709    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  56.31 
 
 		 769 aa  879    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  56.18 
 
 		 768 aa  871    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  56.18 
 
 		 769 aa  872    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  56.31 
 
 		 768 aa  876    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  49.74 
 
 		 765 aa  774    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1971  putative outer membrane signal peptide protein  49.34 
 
 		 781 aa  729    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.208049  normal  0.130084 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1446  surface antigen (D15)  48.09 
 
 		 765 aa  749    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.332057 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  47.18 
 
 		 760 aa  690    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  56.31 
 
 		 768 aa  878    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  56.31 
 
 		 768 aa  876    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  88.9 
 
 		 781 aa  1383    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  55.53 
 
 		 770 aa  880    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  56.31 
 
 		 769 aa  875    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  48.48 
 
 		 779 aa  746    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  44.81 
 
 		 790 aa  704    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2687  surface antigen (D15)  50.26 
 
 		 784 aa  784    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.379638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  55.88 
 
 		 767 aa  885    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  56.84 
 
 		 769 aa  882    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  49.6 
 
 		 765 aa  773    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  58.33 
 
 		 765 aa  913    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  60.92 
 
 		 791 aa  934    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  56.11 
 
 		 770 aa  891    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  49.74 
 
 		 765 aa  772    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  56.31 
 
 		 769 aa  879    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  56.18 
 
 		 769 aa  874    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  56.31 
 
 		 768 aa  876    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  53.24 
 
 		 769 aa  833    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1766  surface antigen (D15)  48.95 
 
 		 766 aa  776    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0726033  normal  0.0207518 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2842  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  47.51 
 
 		 770 aa  732    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  56.18 
 
 		 768 aa  871    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  49.74 
 
 		 765 aa  775    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  56.18 
 
 		 769 aa  874    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2607  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  49.43 
 
 		 811 aa  755    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.745531  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  43.81 
 
 		 766 aa  632  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2447  OMP85 family outer membrane protein  41.42 
 
 		 796 aa  572  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.019137  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1489  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.08 
 
 		 780 aa  549  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.07 
 
 		 758 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  37.92 
 
 		 788 aa  533  1e-150  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  37.25 
 
 		 790 aa  535  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  37.66 
 
 		 794 aa  529  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.39 
 
 		 797 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  37.07 
 
 		 787 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.07 
 
 		 787 aa  525  1e-147  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.36 
 
 		 787 aa  525  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  38.17 
 
 		 784 aa  523  1e-147  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.23 
 
 		 799 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  37.02 
 
 		 787 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.98 
 
 		 784 aa  524  1e-147  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  37.15 
 
 		 786 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  37.15 
 
 		 786 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0322  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.05 
 
 		 784 aa  521  1e-146  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  36.5 
 
 		 786 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  36.38 
 
 		 795 aa  516  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  35.69 
 
 		 781 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  36.77 
 
 		 791 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.69 
 
 		 781 aa  517  1.0000000000000001e-145  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  36.99 
 
 		 790 aa  514  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  36.36 
 
 		 792 aa  515  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1855  surface antigen (D15)  36.93 
 
 		 799 aa  512  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  35.41 
 
 		 796 aa  511  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  37.43 
 
 		 772 aa  502  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002754  outer membrane protein assembly factor YaeT precursor  35.29 
 
 		 804 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0604223  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1446  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.36 
 
 		 800 aa  489  1e-137  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03229  outer membrane protein assembly factor YaeT  35.12 
 
 		 804 aa  489  1e-137  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1458  surface antigen (D15)  35.28 
 
 		 780 aa  492  1e-137  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1074  outer membrane protein assembly factor YaeT  35.82 
 
 		 795 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000979052  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1021  outer membrane protein assembly factor YaeT  35.82 
 
 		 795 aa  483  1e-135  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000998639  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3427  outer membrane protein assembly factor YaeT  35.82 
 
 		 795 aa  483  1e-135  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000902719  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2419  outer membrane protein assembly factor YaeT  34.67 
 
 		 806 aa  484  1e-135  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0333898  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1843  outer membrane protein assembly factor YaeT  34.34 
 
 		 803 aa  481  1e-134  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000194278  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  35.23 
 
 		 810 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  0.197895 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0250  outer membrane protein assembly factor YaeT  35.23 
 
 		 810 aa  477  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.609554  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  35.33 
 
 		 804 aa  476  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25845  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  35.55 
 
 		 801 aa  476  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000907033  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00175  hypothetical protein  35.06 
 
 		 810 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000980871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3426  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.06 
 
 		 810 aa  473  1e-132  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480767  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0265  outer membrane protein assembly factor YaeT  35.38 
 
 		 803 aa  475  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000300024  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0170  outer membrane protein assembly factor YaeT  35.06 
 
 		 810 aa  473  1e-132  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000513305  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0715  outer membrane protein assembly factor YaeT  36.02 
 
 		 805 aa  473  1e-132  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000733739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0179  outer membrane protein assembly factor YaeT  35.06 
 
 		 810 aa  473  1e-132  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000266992  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3483  outer membrane protein assembly factor YaeT  35.06 
 
 		 810 aa  473  1e-132  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000802072  normal  0.102232 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0181  outer membrane protein assembly factor YaeT  35.06 
 
 		 810 aa  473  1e-132  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000194171  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0187  outer membrane protein assembly factor YaeT  35.06 
 
 		 810 aa  473  1e-132  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00010789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00174  hypothetical protein  35.06 
 
 		 810 aa  473  1e-132  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00018653  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2877  surface antigen (D15)  33.66 
 
 		 827 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000948  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0188  outer membrane protein assembly factor YaeT  35.06 
 
 		 810 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000418762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3273  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.15 
 
 		 827 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1147  surface antigen  33.87 
 
 		 844 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003885  normal  0.883859 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2807  surface antigen (D15)  33.94 
 
 		 826 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000285002  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>