More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2842 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  51.31 
 
 		 784 aa  752    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  66.89 
 
 		 765 aa  1044    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  52.36 
 
 		 769 aa  798    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1766  surface antigen (D15)  64.2 
 
 		 766 aa  1026    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0726033  normal  0.0207518 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  47.51 
 
 		 758 aa  742    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  51.64 
 
 		 765 aa  791    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  51.41 
 
 		 750 aa  784    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  52.36 
 
 		 768 aa  797    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  52.23 
 
 		 769 aa  794    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1750  surface antigen (D15):surface antigen variable number  48.62 
 
 		 761 aa  741    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.330816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  51.04 
 
 		 784 aa  778    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  49.87 
 
 		 769 aa  768    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  47.83 
 
 		 770 aa  710    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  66.76 
 
 		 765 aa  1043    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  46.71 
 
 		 781 aa  741    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  52.36 
 
 		 769 aa  798    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  52.63 
 
 		 769 aa  801    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  51.96 
 
 		 769 aa  796    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  65.21 
 
 		 765 aa  1029    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2842  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  100 
 
 		 770 aa  1547    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  47.05 
 
 		 760 aa  693    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  52.5 
 
 		 768 aa  799    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  52.23 
 
 		 768 aa  795    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  52.23 
 
 		 768 aa  795    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  51.96 
 
 		 770 aa  791    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  61.02 
 
 		 779 aa  955    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  50.92 
 
 		 765 aa  787    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  52.09 
 
 		 769 aa  795    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  44.78 
 
 		 790 aa  677    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2687  surface antigen (D15)  65.13 
 
 		 784 aa  1026    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.379638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  52.15 
 
 		 767 aa  791    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  56.8 
 
 		 800 aa  925    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  50.78 
 
 		 791 aa  775    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1971  putative outer membrane signal peptide protein  70.63 
 
 		 781 aa  1068    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.208049  normal  0.130084 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  63.8 
 
 		 765 aa  991    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  52.63 
 
 		 769 aa  801    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  52.23 
 
 		 768 aa  795    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  51.18 
 
 		 769 aa  795    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1446  surface antigen (D15)  62.78 
 
 		 765 aa  992    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.332057 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  52.36 
 
 		 768 aa  798    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  52.63 
 
 		 769 aa  801    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  52.36 
 
 		 768 aa  797    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  52.21 
 
 		 770 aa  805    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2607  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  57.22 
 
 		 811 aa  904    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.745531  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  40.21 
 
 		 766 aa  564  1.0000000000000001e-159  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2447  OMP85 family outer membrane protein  40.11 
 
 		 796 aa  550  1e-155  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.019137  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.45 
 
 		 787 aa  516  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  37.4 
 
 		 788 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1489  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.78 
 
 		 780 aa  515  1e-144  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.79 
 
 		 758 aa  506  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  37.32 
 
 		 790 aa  504  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0322  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.09 
 
 		 784 aa  500  1e-140  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  36.09 
 
 		 784 aa  500  1e-140  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  35.41 
 
 		 786 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  35.41 
 
 		 786 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  35.19 
 
 		 791 aa  496  1e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.5 
 
 		 784 aa  497  1e-139  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  35.77 
 
 		 787 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  35.77 
 
 		 787 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  35.26 
 
 		 795 aa  495  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.37 
 
 		 787 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  35.82 
 
 		 796 aa  492  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.52 
 
 		 797 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.58 
 
 		 781 aa  490  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.64 
 
 		 799 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  34.58 
 
 		 781 aa  490  1e-137  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  35.66 
 
 		 794 aa  491  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  34.19 
 
 		 790 aa  483  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  34.14 
 
 		 786 aa  480  1e-134  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  33.97 
 
 		 792 aa  477  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3153  surface antigen (D15)  34.58 
 
 		 827 aa  478  1e-133  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000352533  normal  0.0112151 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2807  surface antigen (D15)  34.34 
 
 		 826 aa  473  1e-132  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000285002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1356  surface antigen (D15)  34.46 
 
 		 826 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000205975  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0545  hypothetical protein  35.96 
 
 		 770 aa  469  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2627  surface antigen (D15)  33.41 
 
 		 827 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0218715  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2633  surface antigen (D15)  34.1 
 
 		 826 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000445373  normal  0.203506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2700  surface antigen (D15)  34.1 
 
 		 826 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000360043  hitchhiker  0.00504138 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2877  surface antigen (D15)  33.78 
 
 		 827 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000948  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2540  surface antigen (D15)  35.5 
 
 		 772 aa  471  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1489  surface antigen (D15)  34.78 
 
 		 826 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390259  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0569  hypothetical protein  35.96 
 
 		 770 aa  468  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1453  surface antigen (D15)  34.78 
 
 		 826 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000244779  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2894  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.78 
 
 		 826 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172199  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  35.57 
 
 		 801 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000907033  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1458  surface antigen (D15)  37.35 
 
 		 780 aa  469  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1458  surface antigen (D15)  34.38 
 
 		 827 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000234879  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1637  surface antigen  33.98 
 
 		 826 aa  463  1e-129  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3273  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.66 
 
 		 827 aa  465  1e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1843  outer membrane protein assembly factor YaeT  34.91 
 
 		 803 aa  464  1e-129  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000194278  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3157  outer membrane protein assembly factor YaeT  35.11 
 
 		 805 aa  465  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0017892  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1147  surface antigen  34.26 
 
 		 844 aa  459  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003885  normal  0.883859 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2419  outer membrane protein assembly factor YaeT  33.71 
 
 		 806 aa  459  9.999999999999999e-129  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0333898  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1278  surface antigen (D15)  33.98 
 
 		 827 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00357264  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1446  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.14 
 
 		 800 aa  457  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0949  outer membrane protein assembly factor YaeT  34.27 
 
 		 809 aa  457  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00135315  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0262  outer membrane protein assembly factor YaeT  34.12 
 
 		 803 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  35.51 
 
 		 763 aa  454  1.0000000000000001e-126  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2972  outer membrane protein assembly factor YaeT  34.24 
 
 		 807 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0353111  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1855  surface antigen (D15)  36.42 
 
 		 799 aa  455  1.0000000000000001e-126  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.8894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3427  outer membrane protein assembly factor YaeT  34.42 
 
 		 795 aa  456  1.0000000000000001e-126  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000902719  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>