More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_1388 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004310  BR1154  surface antigen  60.4 
 
 		 781 aa  968    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  51.76 
 
 		 779 aa  765    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  51.32 
 
 		 778 aa  793    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  54.28 
 
 		 777 aa  831    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  60.55 
 
 		 785 aa  976    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  51.23 
 
 		 798 aa  815    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  100 
 
 		 788 aa  1587    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  60.4 
 
 		 803 aa  965    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  42.14 
 
 		 834 aa  637    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  52.27 
 
 		 780 aa  770    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  42.1 
 
 		 855 aa  628  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  40.75 
 
 		 821 aa  604  1.0000000000000001e-171  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.82 
 
 		 864 aa  582  1.0000000000000001e-165  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  39.3 
 
 		 841 aa  583  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  39.52 
 
 		 852 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.82 
 
 		 854 aa  582  1e-164  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.67 
 
 		 841 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.55 
 
 		 854 aa  582  1e-164  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.32 
 
 		 856 aa  580  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  40.37 
 
 		 829 aa  576  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  40.7 
 
 		 843 aa  570  1e-161  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  39.9 
 
 		 845 aa  568  1e-160  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  40.41 
 
 		 843 aa  568  1e-160  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.86 
 
 		 844 aa  568  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  39.53 
 
 		 844 aa  564  1.0000000000000001e-159  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  40 
 
 		 857 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  39.53 
 
 		 840 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  39.61 
 
 		 834 aa  560  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1388  surface antigen (D15)  37.53 
 
 		 795 aa  508  9.999999999999999e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0577653  normal  0.0157833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.97 
 
 		 785 aa  499  1e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5827  putative protective surface antigen precursor (Outer membrane protein D15)  36.86 
 
 		 782 aa  483  1e-135  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  37.3 
 
 		 785 aa  474  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  37.52 
 
 		 794 aa  474  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  34.41 
 
 		 785 aa  451  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  34.65 
 
 		 905 aa  446  1.0000000000000001e-124  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2146  surface antigen (D15)  35.35 
 
 		 792 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.766596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3999  surface antigen (D15)  35.02 
 
 		 782 aa  431  1e-119  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54012  normal  0.826111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2711  putative outer membrane protein  34.25 
 
 		 799 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.902664  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  35.44 
 
 		 910 aa  428  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1369  surface antigen (D15)  34.21 
 
 		 799 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.747321  decreased coverage  0.00880921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.77 
 
 		 804 aa  418  9.999999999999999e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847749 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  31.37 
 
 		 887 aa  410  1e-113  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  34.11 
 
 		 767 aa  409  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2453  surface antigen (D15)  33.42 
 
 		 772 aa  400  9.999999999999999e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0002154 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1407  surface antigen (D15)  33.63 
 
 		 796 aa  400  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1499  hypothetical protein  34.35 
 
 		 748 aa  376  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696254  normal  0.873913 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  31.83 
 
 		 763 aa  356  1e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  31.68 
 
 		 751 aa  353  1e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.68 
 
 		 808 aa  342  1e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.37 
 
 		 752 aa  337  5.999999999999999e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  30.38 
 
 		 769 aa  333  5e-90  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  30.08 
 
 		 790 aa  333  7.000000000000001e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  30.91 
 
 		 752 aa  333  8e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.25 
 
 		 802 aa  330  6e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  29.54 
 
 		 765 aa  320  5e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.01 
 
 		 765 aa  317  4e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  30.92 
 
 		 765 aa  314  2.9999999999999996e-84  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  30.19 
 
 		 770 aa  314  3.9999999999999997e-84  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.92 
 
 		 765 aa  314  3.9999999999999997e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0863  surface antigen (D15):surface antigen variable number  28.83 
 
 		 769 aa  310  6.999999999999999e-83  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.03 
 
 		 769 aa  307  5.0000000000000004e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  27.44 
 
 		 781 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.44 
 
 		 781 aa  305  2.0000000000000002e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  30.03 
 
 		 790 aa  305  2.0000000000000002e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1085  surface antigen  30.35 
 
 		 778 aa  304  4.0000000000000003e-81  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.69 
 
 		 800 aa  304  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  28.37 
 
 		 913 aa  303  8.000000000000001e-81  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  30.66 
 
 		 766 aa  301  3e-80  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  28.68 
 
 		 781 aa  299  1e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.21 
 
 		 784 aa  298  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1446  surface antigen (D15)  30.41 
 
 		 765 aa  298  2e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.332057 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.39 
 
 		 895 aa  298  3e-79  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  28.59 
 
 		 784 aa  298  3e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.09 
 
 		 892 aa  297  7e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  28.37 
 
 		 791 aa  295  2e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  30.58 
 
 		 765 aa  295  3e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0718  OMP85 family outer membrane protein  28.65 
 
 		 744 aa  294  5e-78  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1071  OMP85 family outer membrane protein  28.48 
 
 		 773 aa  294  5e-78  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0702133  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  30.3 
 
 		 779 aa  291  2e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.03 
 
 		 758 aa  291  3e-77  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  28.29 
 
 		 792 aa  290  1e-76  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  28.68 
 
 		 888 aa  288  2.9999999999999996e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.7 
 
 		 799 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.77 
 
 		 848 aa  285  2.0000000000000002e-75  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  28.68 
 
 		 786 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  28.42 
 
 		 768 aa  285  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.96 
 
 		 784 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2687  surface antigen (D15)  30.26 
 
 		 784 aa  284  4.0000000000000003e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.379638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  28.55 
 
 		 769 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  28.55 
 
 		 769 aa  284  4.0000000000000003e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  29.04 
 
 		 787 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  27.45 
 
 		 767 aa  284  5.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  29.04 
 
 		 787 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  28.29 
 
 		 760 aa  283  7.000000000000001e-75  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.55 
 
 		 769 aa  283  7.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.16 
 
 		 768 aa  283  8.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.28 
 
 		 769 aa  283  1e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.57 
 
 		 770 aa  282  2e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.87 
 
 		 770 aa  282  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  28.16 
 
 		 768 aa  281  2e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>