More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2453 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008687  Pden_3999  surface antigen (D15)  50.07 
 
 
782 aa  708    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54012  normal  0.826111 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1369  surface antigen (D15)  50.39 
 
 
799 aa  741    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.747321  decreased coverage  0.00880921 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1499  hypothetical protein  57.41 
 
 
748 aa  809    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696254  normal  0.873913 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2711  putative outer membrane protein  51.03 
 
 
799 aa  758    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.902664  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2146  surface antigen (D15)  51.36 
 
 
792 aa  771    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.766596  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2453  surface antigen (D15)  100 
 
 
772 aa  1526    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0002154 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1407  surface antigen (D15)  51.17 
 
 
796 aa  752    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  35.53 
 
 
794 aa  443  1e-123  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1388  surface antigen (D15)  36.1 
 
 
795 aa  443  1e-123  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0577653  normal  0.0157833 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  35.01 
 
 
785 aa  431  1e-119  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.23 
 
 
785 aa  419  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  33.03 
 
 
777 aa  406  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  31.93 
 
 
852 aa  402  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  31.52 
 
 
843 aa  389  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  31.33 
 
 
841 aa  383  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  32.3 
 
 
778 aa  385  1e-105  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  33.17 
 
 
788 aa  383  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  31.55 
 
 
834 aa  380  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.9 
 
 
841 aa  376  1e-103  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  30.66 
 
 
843 aa  374  1e-102  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  31.86 
 
 
844 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  31.03 
 
 
767 aa  374  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.63 
 
 
855 aa  372  1e-101  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  31.53 
 
 
834 aa  372  1e-101  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  30.38 
 
 
785 aa  368  1e-100  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  30.21 
 
 
840 aa  369  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  31.23 
 
 
845 aa  368  1e-100  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  31.39 
 
 
785 aa  369  1e-100  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  28.88 
 
 
905 aa  361  2e-98  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.75 
 
 
804 aa  358  1.9999999999999998e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0847749 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.07 
 
 
779 aa  357  5.999999999999999e-97  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  30.09 
 
 
798 aa  355  1e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.94 
 
 
821 aa  355  2e-96  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.87 
 
 
803 aa  355  2e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.42 
 
 
780 aa  355  2e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  30.87 
 
 
781 aa  353  5.9999999999999994e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  29.75 
 
 
887 aa  350  8e-95  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  30.22 
 
 
910 aa  342  1e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.85 
 
 
854 aa  332  1e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.86 
 
 
829 aa  331  3e-89  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.5 
 
 
857 aa  328  3e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5827  putative protective surface antigen precursor (Outer membrane protein D15)  29.73 
 
 
782 aa  323  6e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.35 
 
 
854 aa  323  8e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.35 
 
 
864 aa  323  9.000000000000001e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.03 
 
 
856 aa  322  9.999999999999999e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.48 
 
 
844 aa  307  6e-82  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  30.01 
 
 
790 aa  289  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0863  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.67 
 
 
769 aa  286  1.0000000000000001e-75  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1071  OMP85 family outer membrane protein  25.86 
 
 
773 aa  277  4e-73  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0702133  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1085  surface antigen  26.03 
 
 
778 aa  268  2e-70  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  27.73 
 
 
791 aa  266  8e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  27.09 
 
 
786 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  27.09 
 
 
786 aa  265  2e-69  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.02 
 
 
787 aa  262  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  26.66 
 
 
794 aa  262  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  27.38 
 
 
795 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.56 
 
 
797 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  27.45 
 
 
781 aa  260  6e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.27 
 
 
784 aa  260  7e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0718  OMP85 family outer membrane protein  26.27 
 
 
744 aa  260  7e-68  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.55 
 
 
801 aa  259  1e-67  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000907033  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  25.95 
 
 
888 aa  259  1e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  26.76 
 
 
786 aa  259  2e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.56 
 
 
799 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  26.54 
 
 
787 aa  258  4e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0265  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.82 
 
 
803 aa  258  4e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000300024  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  26.54 
 
 
787 aa  258  4e-67  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.12 
 
 
804 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25845  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  26.41 
 
 
766 aa  255  2.0000000000000002e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.54 
 
 
769 aa  256  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  26.49 
 
 
770 aa  254  3e-66  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  27.65 
 
 
763 aa  254  4.0000000000000004e-66  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0262  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.69 
 
 
803 aa  254  5.000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3273  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.35 
 
 
827 aa  253  9.000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.42 
 
 
752 aa  253  1e-65  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.93 
 
 
784 aa  252  2e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2877  surface antigen (D15)  27.14 
 
 
827 aa  251  4e-65  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000948  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0250  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.74 
 
 
810 aa  251  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.609554  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.74 
 
 
810 aa  251  5e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  0.197895 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  26.54 
 
 
752 aa  250  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.57 
 
 
768 aa  250  6e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3153  surface antigen (D15)  27.47 
 
 
827 aa  250  7e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000352533  normal  0.0112151 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3427  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.04 
 
 
795 aa  249  1e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000902719  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1021  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.04 
 
 
795 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000998639  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  27.4 
 
 
790 aa  249  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  26.1 
 
 
796 aa  249  1e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1074  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.04 
 
 
795 aa  249  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000979052  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2627  surface antigen (D15)  27.23 
 
 
827 aa  249  1e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0218715  normal  0.613387 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  25.5 
 
 
792 aa  249  1e-64  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3157  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.87 
 
 
805 aa  249  1e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0017892  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.55 
 
 
770 aa  249  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0623  outer membrane protein assembly factor  25.43 
 
 
803 aa  248  4e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000661464  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0724  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.43 
 
 
803 aa  248  4e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.000000000000238666  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.58 
 
 
808 aa  248  4e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2894  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.53 
 
 
826 aa  247  6e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172199  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2807  surface antigen (D15)  26.65 
 
 
826 aa  247  6e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000285002  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1489  surface antigen (D15)  26.53 
 
 
826 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390259  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1453  surface antigen (D15)  26.53 
 
 
826 aa  247  6.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000244779  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0715  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.19 
 
 
805 aa  246  9.999999999999999e-64  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000733739  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  25.43 
 
 
769 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>