More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1783 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  70.38 
 
 
778 aa  1096    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  100 
 
 
780 aa  1575    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  53.31 
 
 
781 aa  828    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  53.31 
 
 
803 aa  828    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  95.38 
 
 
779 aa  1442    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  53.44 
 
 
785 aa  833    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  52.77 
 
 
788 aa  776    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  44.99 
 
 
798 aa  695    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  68.08 
 
 
777 aa  1078    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  41.82 
 
 
834 aa  609  1e-173  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.99 
 
 
855 aa  566  1e-160  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.68 
 
 
829 aa  559  1e-158  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  40.08 
 
 
857 aa  557  1e-157  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.22 
 
 
844 aa  543  1e-153  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.53 
 
 
841 aa  545  1e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.3 
 
 
854 aa  542  1e-153  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.61 
 
 
821 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.6 
 
 
856 aa  539  9.999999999999999e-153  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  37.5 
 
 
843 aa  538  1e-151  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.44 
 
 
864 aa  538  1e-151  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.44 
 
 
854 aa  538  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  37.57 
 
 
844 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  38.43 
 
 
843 aa  532  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  38.46 
 
 
845 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  36.69 
 
 
841 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  37.11 
 
 
852 aa  527  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  36.49 
 
 
840 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  37.94 
 
 
834 aa  522  1e-146  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5827  putative protective surface antigen precursor (Outer membrane protein D15)  37.74 
 
 
782 aa  486  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  35.85 
 
 
785 aa  473  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1388  surface antigen (D15)  35.83 
 
 
795 aa  464  1e-129  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0577653  normal  0.0157833 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  36.57 
 
 
794 aa  464  1e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.67 
 
 
785 aa  458  1e-127  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  33.71 
 
 
785 aa  422  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  33.91 
 
 
767 aa  415  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2146  surface antigen (D15)  34.58 
 
 
792 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.766596  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.78 
 
 
804 aa  404  1e-111  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0847749 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  30.71 
 
 
905 aa  404  1e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1407  surface antigen (D15)  32.7 
 
 
796 aa  402  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  30.07 
 
 
887 aa  396  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3999  surface antigen (D15)  32.99 
 
 
782 aa  399  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54012  normal  0.826111 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  32.51 
 
 
910 aa  395  1e-108  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2711  putative outer membrane protein  32.98 
 
 
799 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.902664  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1369  surface antigen (D15)  32.62 
 
 
799 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.747321  decreased coverage  0.00880921 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2453  surface antigen (D15)  32.55 
 
 
772 aa  381  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0002154 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  31.25 
 
 
790 aa  355  2e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  30.78 
 
 
751 aa  353  8e-96  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1499  hypothetical protein  30.9 
 
 
748 aa  347  7e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696254  normal  0.873913 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.19 
 
 
769 aa  333  6e-90  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  30.08 
 
 
752 aa  331  3e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  30.5 
 
 
768 aa  330  8e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  31 
 
 
770 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  30.37 
 
 
769 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.82 
 
 
768 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  30.37 
 
 
769 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  29.68 
 
 
768 aa  328  2.0000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  30.24 
 
 
768 aa  328  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  30.24 
 
 
769 aa  328  3e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  30.24 
 
 
768 aa  328  3e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  30.24 
 
 
768 aa  328  3e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  30.24 
 
 
768 aa  328  3e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.71 
 
 
769 aa  328  3e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  29.68 
 
 
769 aa  326  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.71 
 
 
769 aa  326  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  29.44 
 
 
769 aa  326  1e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  29.44 
 
 
769 aa  326  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.19 
 
 
770 aa  325  3e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0863  surface antigen (D15):surface antigen variable number  27.85 
 
 
769 aa  321  3.9999999999999996e-86  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.67 
 
 
769 aa  320  6e-86  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  29.68 
 
 
767 aa  320  7.999999999999999e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.45 
 
 
752 aa  320  7.999999999999999e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.55 
 
 
781 aa  319  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  28.55 
 
 
781 aa  319  1e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.55 
 
 
770 aa  317  5e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  30.73 
 
 
779 aa  316  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  28.54 
 
 
765 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  30.59 
 
 
792 aa  315  2.9999999999999996e-84  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1766  surface antigen (D15)  28.92 
 
 
766 aa  315  2.9999999999999996e-84  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0726033  normal  0.0207518 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  28.66 
 
 
763 aa  311  2e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.49 
 
 
765 aa  311  2.9999999999999997e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  29.77 
 
 
765 aa  311  4e-83  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  29.72 
 
 
760 aa  311  4e-83  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.3 
 
 
799 aa  310  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.53 
 
 
750 aa  309  2.0000000000000002e-82  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  29.46 
 
 
794 aa  308  2.0000000000000002e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.27 
 
 
765 aa  308  3e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  28.02 
 
 
769 aa  307  5.0000000000000004e-82  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.22 
 
 
797 aa  306  8.000000000000001e-82  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  30.29 
 
 
787 aa  306  9.000000000000001e-82  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  30.29 
 
 
787 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  28.27 
 
 
791 aa  305  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  28.16 
 
 
784 aa  304  3.0000000000000004e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2687  surface antigen (D15)  29.07 
 
 
784 aa  304  3.0000000000000004e-81  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.379638  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.48 
 
 
800 aa  304  4.0000000000000003e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.81 
 
 
765 aa  304  4.0000000000000003e-81  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  29.57 
 
 
763 aa  304  5.000000000000001e-81  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  29.81 
 
 
765 aa  304  5.000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.2 
 
 
808 aa  303  6.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  29.36 
 
 
758 aa  302  1e-80  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  30.61 
 
 
765 aa  301  3e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>