More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3188 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  49.27 
 
 		 785 aa  702    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  47.01 
 
 		 785 aa  674    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  100 
 
 		 794 aa  1607    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1388  surface antigen (D15)  46.77 
 
 		 795 aa  705    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0577653  normal  0.0157833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  40.5 
 
 		 834 aa  585  1.0000000000000001e-165  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  38.71 
 
 		 905 aa  570  1e-161  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  43.12 
 
 		 910 aa  567  1e-160  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  39.07 
 
 		 887 aa  560  1e-158  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  38.33 
 
 		 843 aa  548  1e-154  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  38.12 
 
 		 834 aa  544  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.47 
 
 		 841 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  38.21 
 
 		 843 aa  538  1e-151  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  37.85 
 
 		 852 aa  537  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  38 
 
 		 841 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.27 
 
 		 821 aa  530  1e-149  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  37.45 
 
 		 844 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.63 
 
 		 855 aa  520  1e-146  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  39.63 
 
 		 785 aa  522  1e-146  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  37.31 
 
 		 840 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  37.44 
 
 		 845 aa  511  1e-143  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  38.65 
 
 		 777 aa  508  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  38.32 
 
 		 785 aa  508  9.999999999999999e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5827  putative protective surface antigen precursor (Outer membrane protein D15)  39.31 
 
 		 782 aa  508  9.999999999999999e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.36 
 
 		 856 aa  504  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.4 
 
 		 854 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.09 
 
 		 804 aa  491  1e-137  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847749 
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  37.64 
 
 		 781 aa  490  1e-137  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.62 
 
 		 829 aa  490  1e-137  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.03 
 
 		 864 aa  491  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.67 
 
 		 803 aa  492  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.03 
 
 		 854 aa  492  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3999  surface antigen (D15)  38.65 
 
 		 782 aa  486  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54012  normal  0.826111 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.13 
 
 		 857 aa  484  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.22 
 
 		 844 aa  481  1e-134  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2146  surface antigen (D15)  36.49 
 
 		 792 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.766596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  37.31 
 
 		 788 aa  466  1e-129  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2711  putative outer membrane protein  35.4 
 
 		 799 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.902664  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  35.31 
 
 		 767 aa  459  9.999999999999999e-129  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  36.3 
 
 		 778 aa  454  1.0000000000000001e-126  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1369  surface antigen (D15)  35.16 
 
 		 799 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.747321  decreased coverage  0.00880921 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.04 
 
 		 779 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2453  surface antigen (D15)  35.53 
 
 		 772 aa  443  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0002154 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.45 
 
 		 780 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1499  hypothetical protein  36.27 
 
 		 748 aa  424  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696254  normal  0.873913 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  34.28 
 
 		 798 aa  423  1e-117  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1407  surface antigen (D15)  35.2 
 
 		 796 aa  421  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0863  surface antigen (D15):surface antigen variable number  32.99 
 
 		 769 aa  408  1.0000000000000001e-112  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1071  OMP85 family outer membrane protein  32.78 
 
 		 773 aa  387  1e-106  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0702133  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1085  surface antigen  30.43 
 
 		 778 aa  346  1e-93  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.13 
 
 		 752 aa  342  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.43 
 
 		 770 aa  338  1.9999999999999998e-91  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31 
 
 		 769 aa  337  5e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.7 
 
 		 799 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  29.54 
 
 		 790 aa  332  2e-89  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  30.48 
 
 		 787 aa  331  3e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  31.43 
 
 		 792 aa  331  3e-89  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  30.48 
 
 		 787 aa  331  3e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.93 
 
 		 769 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  30.93 
 
 		 769 aa  329  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  30.93 
 
 		 769 aa  329  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.8 
 
 		 769 aa  328  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.07 
 
 		 770 aa  328  3e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.67 
 
 		 768 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  29.54 
 
 		 752 aa  327  5e-88  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  30.74 
 
 		 794 aa  327  5e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  31.32 
 
 		 767 aa  327  6e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  30.93 
 
 		 768 aa  327  7e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.21 
 
 		 793 aa  327  7e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  30.8 
 
 		 769 aa  326  8.000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  31.03 
 
 		 790 aa  326  8.000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.33 
 
 		 797 aa  326  9e-88  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  30.8 
 
 		 769 aa  326  1e-87  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  30.8 
 
 		 769 aa  326  1e-87  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.17 
 
 		 793 aa  325  2e-87  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  30.67 
 
 		 768 aa  325  2e-87  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  30.67 
 
 		 768 aa  324  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  30.67 
 
 		 768 aa  324  4e-87  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  30.67 
 
 		 769 aa  324  4e-87  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  30.67 
 
 		 768 aa  324  4e-87  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  28.66 
 
 		 769 aa  324  4e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  30.06 
 
 		 791 aa  324  5e-87  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  30.54 
 
 		 768 aa  323  7e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  29.1 
 
 		 751 aa  323  8e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  29.48 
 
 		 806 aa  322  9.999999999999999e-87  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  30.1 
 
 		 770 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  29.91 
 
 		 795 aa  321  3e-86  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  30.58 
 
 		 786 aa  320  9e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.4 
 
 		 787 aa  319  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  29.52 
 
 		 786 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  29.52 
 
 		 786 aa  318  2e-85  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.96 
 
 		 784 aa  318  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  29.66 
 
 		 796 aa  317  7e-85  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  30.24 
 
 		 788 aa  316  8e-85  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  30.15 
 
 		 781 aa  316  9e-85  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.13 
 
 		 769 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  29.06 
 
 		 820 aa  313  7.999999999999999e-84  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.56 
 
 		 802 aa  312  1e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  29.15 
 
 		 791 aa  311  4e-83  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.61 
 
 		 808 aa  310  5e-83  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  30.28 
 
 		 763 aa  310  5.9999999999999995e-83  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>