More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_1848 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  100 
 
 
767 aa  1566    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  36.52 
 
 
785 aa  475  1e-132  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.11 
 
 
785 aa  470  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  35.12 
 
 
794 aa  468  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1388  surface antigen (D15)  36.41 
 
 
795 aa  455  1.0000000000000001e-126  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0577653  normal  0.0157833 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  32.87 
 
 
834 aa  432  1e-120  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  30.85 
 
 
905 aa  429  1e-119  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  31.96 
 
 
785 aa  423  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  31.79 
 
 
777 aa  416  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  33.16 
 
 
785 aa  416  9.999999999999999e-116  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.27 
 
 
804 aa  414  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0847749 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  33.24 
 
 
778 aa  412  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  32.98 
 
 
781 aa  404  1e-111  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  33.97 
 
 
770 aa  405  1e-111  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.98 
 
 
803 aa  405  1e-111  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  33.98 
 
 
788 aa  405  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.5 
 
 
841 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.02 
 
 
770 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  30.92 
 
 
843 aa  396  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.73 
 
 
780 aa  398  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  30.72 
 
 
887 aa  398  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  30.3 
 
 
852 aa  396  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  33.46 
 
 
766 aa  393  1e-108  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.11 
 
 
779 aa  395  1e-108  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  32.41 
 
 
752 aa  394  1e-108  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  30.06 
 
 
841 aa  395  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  31.71 
 
 
790 aa  395  1e-108  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  31.41 
 
 
834 aa  393  1e-108  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.66 
 
 
855 aa  390  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  32.85 
 
 
760 aa  389  1e-107  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  31.1 
 
 
845 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  30.81 
 
 
844 aa  390  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.95 
 
 
768 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  31.95 
 
 
768 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.81 
 
 
769 aa  386  1e-106  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.81 
 
 
769 aa  387  1e-106  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.06 
 
 
781 aa  386  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  31.81 
 
 
769 aa  387  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.59 
 
 
808 aa  388  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  32.06 
 
 
781 aa  386  1e-106  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  30.76 
 
 
843 aa  388  1e-106  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.11 
 
 
821 aa  389  1e-106  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  31.81 
 
 
769 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  31.81 
 
 
769 aa  386  1e-106  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2711  putative outer membrane protein  31.56 
 
 
799 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.902664  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  30.97 
 
 
751 aa  385  1e-105  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  31.54 
 
 
765 aa  380  1e-104  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.68 
 
 
784 aa  382  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  30.87 
 
 
769 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  31.01 
 
 
768 aa  381  1e-104  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  30.87 
 
 
769 aa  381  1e-104  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  30.94 
 
 
910 aa  382  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.33 
 
 
769 aa  382  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  30.74 
 
 
768 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2146  surface antigen (D15)  31.51 
 
 
792 aa  381  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.766596  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  30.74 
 
 
768 aa  379  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  30.74 
 
 
769 aa  379  1e-103  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  30.74 
 
 
768 aa  379  1e-103  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2453  surface antigen (D15)  31.09 
 
 
772 aa  379  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0002154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5827  putative protective surface antigen precursor (Outer membrane protein D15)  31.1 
 
 
782 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  30.74 
 
 
768 aa  379  1e-103  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  32.78 
 
 
763 aa  375  1e-102  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1369  surface antigen (D15)  31.42 
 
 
799 aa  374  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.747321  decreased coverage  0.00880921 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  29.75 
 
 
840 aa  374  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  32.09 
 
 
767 aa  376  1e-102  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.51 
 
 
802 aa  374  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.33 
 
 
770 aa  373  1e-102  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  31.83 
 
 
763 aa  375  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  32.86 
 
 
765 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  30.96 
 
 
769 aa  372  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  31.66 
 
 
787 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  31.66 
 
 
787 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.92 
 
 
799 aa  367  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  29.22 
 
 
798 aa  367  1e-100  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.07 
 
 
752 aa  368  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.17 
 
 
856 aa  363  7.0000000000000005e-99  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  32.46 
 
 
784 aa  362  2e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.43 
 
 
765 aa  360  5e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1750  surface antigen (D15):surface antigen variable number  31.55 
 
 
761 aa  360  7e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.330816  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.42 
 
 
750 aa  359  8e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  31.03 
 
 
786 aa  359  9e-98  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  31.03 
 
 
786 aa  359  9.999999999999999e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.87 
 
 
787 aa  355  1e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  31.71 
 
 
791 aa  355  2e-96  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  31.19 
 
 
786 aa  354  4e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  30.61 
 
 
794 aa  353  5e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.5 
 
 
797 aa  353  7e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.41 
 
 
784 aa  353  8.999999999999999e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  30.33 
 
 
790 aa  352  2e-95  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.64 
 
 
829 aa  350  5e-95  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.57 
 
 
765 aa  350  8e-95  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.56 
 
 
769 aa  349  9e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.6 
 
 
781 aa  349  1e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1489  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.81 
 
 
780 aa  349  1e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  32.57 
 
 
765 aa  349  1e-94  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.16 
 
 
758 aa  348  2e-94  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  31.18 
 
 
758 aa  347  5e-94  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  30.58 
 
 
820 aa  347  6e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3999  surface antigen (D15)  30.26 
 
 
782 aa  346  8.999999999999999e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54012  normal  0.826111 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.14 
 
 
787 aa  345  2e-93  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>