More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_0295 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  54.3 
 
 		 854 aa  894    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  51.86 
 
 		 844 aa  852    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  49.44 
 
 		 841 aa  768    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  53.54 
 
 		 864 aa  887    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  56.21 
 
 		 857 aa  901    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  48.22 
 
 		 834 aa  766    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  53.54 
 
 		 854 aa  886    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  49.57 
 
 		 843 aa  784    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  54.09 
 
 		 856 aa  898    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  55.57 
 
 		 829 aa  896    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  49.13 
 
 		 840 aa  776    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  48.64 
 
 		 845 aa  767    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  49.53 
 
 		 841 aa  804    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  48.88 
 
 		 844 aa  768    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  50 
 
 		 843 aa  782    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  49.42 
 
 		 852 aa  796    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  71.41 
 
 		 821 aa  1203    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  52.56 
 
 		 834 aa  834    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  100 
 
 		 855 aa  1737    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  41.75 
 
 		 788 aa  607  9.999999999999999e-173  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  40.21 
 
 		 777 aa  593  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5827  putative protective surface antigen precursor (Outer membrane protein D15)  38.16 
 
 		 782 aa  588  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  40.24 
 
 		 785 aa  584  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.84 
 
 		 803 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  40 
 
 		 781 aa  575  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  38.64 
 
 		 778 aa  569  1e-161  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  38.71 
 
 		 798 aa  556  1e-157  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.47 
 
 		 785 aa  541  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.8 
 
 		 779 aa  538  1e-151  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.87 
 
 		 780 aa  535  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  37.63 
 
 		 794 aa  520  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1388  surface antigen (D15)  36.75 
 
 		 795 aa  502  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0577653  normal  0.0157833 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  35.78 
 
 		 905 aa  498  1e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  35.72 
 
 		 785 aa  484  1e-135  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  34.35 
 
 		 887 aa  481  1e-134  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  33.07 
 
 		 910 aa  469  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.69 
 
 		 804 aa  434  1e-120  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847749 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2146  surface antigen (D15)  33.98 
 
 		 792 aa  429  1e-119  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.766596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2711  putative outer membrane protein  33.5 
 
 		 799 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.902664  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  33.09 
 
 		 785 aa  426  1e-118  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3999  surface antigen (D15)  34.99 
 
 		 782 aa  423  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54012  normal  0.826111 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1369  surface antigen (D15)  33.37 
 
 		 799 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.747321  decreased coverage  0.00880921 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1407  surface antigen (D15)  32.03 
 
 		 796 aa  401  9.999999999999999e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  31.66 
 
 		 767 aa  389  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2453  surface antigen (D15)  31.63 
 
 		 772 aa  372  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0002154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1499  hypothetical protein  30.6 
 
 		 748 aa  341  2.9999999999999998e-92  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696254  normal  0.873913 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  29.79 
 
 		 751 aa  323  8e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  27.81 
 
 		 767 aa  313  1e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.26 
 
 		 770 aa  309  1.0000000000000001e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.47 
 
 		 768 aa  306  8.000000000000001e-82  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.09 
 
 		 770 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  27.59 
 
 		 768 aa  305  2.0000000000000002e-81  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  27.36 
 
 		 790 aa  304  5.000000000000001e-81  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  27.06 
 
 		 781 aa  302  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  27.34 
 
 		 769 aa  302  2e-80  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.06 
 
 		 781 aa  302  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  27.34 
 
 		 769 aa  302  2e-80  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  27.34 
 
 		 769 aa  302  2e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.22 
 
 		 769 aa  302  2e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  28.1 
 
 		 770 aa  301  3e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.54 
 
 		 765 aa  301  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.78 
 
 		 769 aa  301  3e-80  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  28.55 
 
 		 765 aa  301  4e-80  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0863  surface antigen (D15):surface antigen variable number  26.37 
 
 		 769 aa  301  5e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.59 
 
 		 769 aa  300  6e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  27.53 
 
 		 768 aa  300  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  27.53 
 
 		 768 aa  300  8e-80  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  27.53 
 
 		 768 aa  300  8e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  27.53 
 
 		 768 aa  300  8e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  27.53 
 
 		 769 aa  300  1e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  27.53 
 
 		 768 aa  298  3e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  27.41 
 
 		 769 aa  298  4e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  29.72 
 
 		 765 aa  298  4e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  27.41 
 
 		 769 aa  298  4e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.84 
 
 		 752 aa  295  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  28.45 
 
 		 820 aa  295  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  29.28 
 
 		 765 aa  293  8e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  29.26 
 
 		 752 aa  292  1e-77  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.28 
 
 		 765 aa  293  1e-77  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.1 
 
 		 769 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  28.64 
 
 		 763 aa  286  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.52 
 
 		 787 aa  284  6.000000000000001e-75  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.37 
 
 		 808 aa  283  9e-75  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.53 
 
 		 799 aa  283  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  28.74 
 
 		 779 aa  282  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  28.42 
 
 		 913 aa  281  5e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  26.84 
 
 		 806 aa  280  7e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0515  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.48 
 
 		 781 aa  280  7e-74  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.404864 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  27.57 
 
 		 787 aa  280  1e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.59 
 
 		 793 aa  280  1e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  27.33 
 
 		 790 aa  280  1e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0322  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.89 
 
 		 784 aa  278  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  26.89 
 
 		 784 aa  279  2e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  27.45 
 
 		 787 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0715  outer membrane protein assembly factor YaeT  28.57 
 
 		 805 aa  278  3e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000733739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.72 
 
 		 793 aa  278  3e-73  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  27.78 
 
 		 888 aa  277  6e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1446  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.1 
 
 		 800 aa  276  8e-73  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1446  surface antigen (D15)  28.45 
 
 		 765 aa  276  1.0000000000000001e-72  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.332057 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  26.8 
 
 		 791 aa  276  1.0000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>