More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1388 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  52.58 
 
 
785 aa  787    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  46.77 
 
 
794 aa  719    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1388  surface antigen (D15)  100 
 
 
795 aa  1570    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0577653  normal  0.0157833 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  42.23 
 
 
785 aa  616  1e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  40.74 
 
 
905 aa  598  1e-169  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  40.81 
 
 
887 aa  581  1e-164  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  43.53 
 
 
910 aa  571  1e-161  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  39.65 
 
 
834 aa  560  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  36.32 
 
 
841 aa  535  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  37.55 
 
 
843 aa  534  1e-150  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  37.28 
 
 
852 aa  529  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  38.04 
 
 
834 aa  528  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  36.84 
 
 
785 aa  522  1e-147  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.25 
 
 
821 aa  522  1e-147  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  36.57 
 
 
843 aa  520  1e-146  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.86 
 
 
841 aa  520  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  36.88 
 
 
845 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  36.88 
 
 
844 aa  512  1e-144  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.75 
 
 
855 aa  513  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.51 
 
 
804 aa  506  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0847749 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  37.41 
 
 
788 aa  508  9.999999999999999e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2146  surface antigen (D15)  38.52 
 
 
792 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.766596  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  36.56 
 
 
785 aa  505  1e-141  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  35.95 
 
 
840 aa  505  1e-141  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  37.39 
 
 
781 aa  498  1e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.49 
 
 
803 aa  497  1e-139  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.78 
 
 
857 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.4 
 
 
829 aa  495  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2711  putative outer membrane protein  36.78 
 
 
799 aa  491  1e-137  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.902664  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  36.02 
 
 
777 aa  490  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.97 
 
 
854 aa  484  1e-135  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.41 
 
 
864 aa  484  1e-135  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.41 
 
 
854 aa  484  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.04 
 
 
844 aa  483  1e-135  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.84 
 
 
856 aa  478  1e-133  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1369  surface antigen (D15)  36.65 
 
 
799 aa  479  1e-133  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.747321  decreased coverage  0.00880921 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  36.22 
 
 
778 aa  477  1e-133  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1407  surface antigen (D15)  36.52 
 
 
796 aa  473  1e-132  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  36.41 
 
 
767 aa  467  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3999  surface antigen (D15)  36.77 
 
 
782 aa  464  1e-129  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54012  normal  0.826111 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1499  hypothetical protein  36.85 
 
 
748 aa  456  1e-127  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696254  normal  0.873913 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.46 
 
 
780 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2453  surface antigen (D15)  36.1 
 
 
772 aa  455  1.0000000000000001e-126  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0002154 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5827  putative protective surface antigen precursor (Outer membrane protein D15)  34.62 
 
 
782 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.92 
 
 
779 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  31.13 
 
 
798 aa  416  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0863  surface antigen (D15):surface antigen variable number  31.55 
 
 
769 aa  409  1.0000000000000001e-112  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1071  OMP85 family outer membrane protein  31.39 
 
 
773 aa  383  1e-105  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0702133  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1085  surface antigen  31.23 
 
 
778 aa  357  5e-97  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  30.66 
 
 
790 aa  353  8.999999999999999e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.15 
 
 
799 aa  352  2e-95  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.2 
 
 
784 aa  349  9e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.14 
 
 
793 aa  349  1e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31 
 
 
793 aa  349  1e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  31.18 
 
 
806 aa  347  5e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  29.86 
 
 
787 aa  347  6e-94  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  29.86 
 
 
787 aa  347  6e-94  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.09 
 
 
784 aa  346  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.11 
 
 
787 aa  345  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  29.15 
 
 
786 aa  343  5e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  29.15 
 
 
786 aa  343  5.999999999999999e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  30.8 
 
 
770 aa  343  5.999999999999999e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.93 
 
 
770 aa  340  5e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.84 
 
 
802 aa  340  7e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  28.99 
 
 
794 aa  340  7e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.07 
 
 
808 aa  339  9.999999999999999e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  28.28 
 
 
796 aa  339  9.999999999999999e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  31.7 
 
 
820 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  28.99 
 
 
792 aa  338  2.9999999999999997e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.43 
 
 
769 aa  337  3.9999999999999995e-91  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  29.72 
 
 
791 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.63 
 
 
797 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  31.56 
 
 
760 aa  336  7.999999999999999e-91  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  29.43 
 
 
751 aa  336  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  29.9 
 
 
788 aa  335  3e-90  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  29.34 
 
 
795 aa  334  3e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.73 
 
 
770 aa  334  5e-90  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  28.44 
 
 
769 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  28.44 
 
 
769 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  29.35 
 
 
790 aa  332  1e-89  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.31 
 
 
769 aa  332  1e-89  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  29.13 
 
 
768 aa  331  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.94 
 
 
787 aa  331  3e-89  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  29.13 
 
 
769 aa  331  4e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  28.05 
 
 
769 aa  331  4e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  29.13 
 
 
769 aa  331  4e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  28.18 
 
 
768 aa  331  4e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  28.09 
 
 
786 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  29.13 
 
 
768 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  29.13 
 
 
768 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  29.69 
 
 
767 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  29.13 
 
 
768 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  29.13 
 
 
768 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  29.13 
 
 
769 aa  330  7e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.18 
 
 
768 aa  330  7e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  30.69 
 
 
766 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.95 
 
 
769 aa  328  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0718  OMP85 family outer membrane protein  30.37 
 
 
744 aa  327  6e-88  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  29.19 
 
 
913 aa  325  3e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.28 
 
 
765 aa  323  6e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>