More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0751 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  43.58 
 
 		 854 aa  692    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  43.58 
 
 		 864 aa  692    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  41.95 
 
 		 844 aa  668    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  43.81 
 
 		 829 aa  682    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5827  putative protective surface antigen precursor (Outer membrane protein D15)  44.08 
 
 		 782 aa  682    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  43.26 
 
 		 856 aa  699    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  43.51 
 
 		 857 aa  688    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  69.21 
 
 		 843 aa  1174    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  44.16 
 
 		 854 aa  699    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  100 
 
 		 840 aa  1703    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  73.21 
 
 		 845 aa  1212    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  49.03 
 
 		 855 aa  788    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  72.54 
 
 		 841 aa  1261    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  72.96 
 
 		 844 aa  1206    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  68.85 
 
 		 843 aa  1170    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  70.96 
 
 		 852 aa  1242    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  75.72 
 
 		 834 aa  1306    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  51.74 
 
 		 834 aa  843    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  71.24 
 
 		 841 aa  1208    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  47.29 
 
 		 821 aa  774    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  39.32 
 
 		 785 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.12 
 
 		 803 aa  576  1.0000000000000001e-163  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  39.08 
 
 		 781 aa  575  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  38.34 
 
 		 777 aa  555  1e-156  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  39.31 
 
 		 788 aa  552  1e-156  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.86 
 
 		 785 aa  537  1e-151  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  37.81 
 
 		 778 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  37.84 
 
 		 794 aa  530  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  36.4 
 
 		 798 aa  517  1.0000000000000001e-145  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.28 
 
 		 779 aa  515  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1388  surface antigen (D15)  35.71 
 
 		 795 aa  503  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0577653  normal  0.0157833 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.52 
 
 		 780 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  37.13 
 
 		 785 aa  499  1e-140  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  34.75 
 
 		 905 aa  499  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  34.1 
 
 		 887 aa  488  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  33.56 
 
 		 910 aa  474  1e-132  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.32 
 
 		 804 aa  471  1.0000000000000001e-131  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847749 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  34.15 
 
 		 785 aa  452  1e-125  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2146  surface antigen (D15)  34.35 
 
 		 792 aa  443  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.766596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2711  putative outer membrane protein  34.44 
 
 		 799 aa  434  1e-120  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.902664  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1369  surface antigen (D15)  34.07 
 
 		 799 aa  428  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.747321  decreased coverage  0.00880921 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3999  surface antigen (D15)  34.04 
 
 		 782 aa  423  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54012  normal  0.826111 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1407  surface antigen (D15)  32.36 
 
 		 796 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  30.07 
 
 		 767 aa  380  1e-104  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2453  surface antigen (D15)  30.21 
 
 		 772 aa  371  1e-101  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0002154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1499  hypothetical protein  32.05 
 
 		 748 aa  352  1e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696254  normal  0.873913 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0863  surface antigen (D15):surface antigen variable number  27.34 
 
 		 769 aa  328  2.0000000000000001e-88  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.48 
 
 		 808 aa  323  9.000000000000001e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  27.72 
 
 		 751 aa  322  3e-86  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  29.39 
 
 		 765 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.32 
 
 		 752 aa  313  5.999999999999999e-84  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  28.86 
 
 		 913 aa  313  1e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.41 
 
 		 802 aa  310  5e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD1085  surface antigen  30.38 
 
 		 778 aa  307  5.0000000000000004e-82  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1071  OMP85 family outer membrane protein  26.88 
 
 		 773 aa  301  5e-80  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0702133  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  28.08 
 
 		 763 aa  298  3e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  27.75 
 
 		 820 aa  296  2e-78  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  26.68 
 
 		 806 aa  290  9e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.44 
 
 		 793 aa  288  2.9999999999999996e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.94 
 
 		 801 aa  286  1.0000000000000001e-75  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000907033  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.56 
 
 		 793 aa  285  2.0000000000000002e-75  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  26.16 
 
 		 792 aa  280  6e-74  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.39 
 
 		 768 aa  277  7e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0949  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.97 
 
 		 809 aa  275  3e-72  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00135315  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.63 
 
 		 769 aa  275  3e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  26.84 
 
 		 790 aa  274  6e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0718  OMP85 family outer membrane protein  28.12 
 
 		 744 aa  273  8.000000000000001e-72  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  27.43 
 
 		 786 aa  273  8.000000000000001e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  26.36 
 
 		 795 aa  273  9e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  28.11 
 
 		 804 aa  273  1e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25845  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  25.71 
 
 		 768 aa  273  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0715  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.36 
 
 		 805 aa  273  1e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000733739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0265  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.98 
 
 		 803 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000300024  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0262  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.98 
 
 		 803 aa  272  2e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  26.52 
 
 		 767 aa  272  2e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00175  hypothetical protein  27.97 
 
 		 810 aa  271  4e-71  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000980871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3426  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.97 
 
 		 810 aa  271  4e-71  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480767  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0181  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.97 
 
 		 810 aa  271  4e-71  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000194171  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  26.87 
 
 		 763 aa  271  4e-71  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0187  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.97 
 
 		 810 aa  271  4e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00010789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3483  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.97 
 
 		 810 aa  271  4e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000802072  normal  0.102232 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0179  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.97 
 
 		 810 aa  271  4e-71  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000266992  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00174  hypothetical protein  27.97 
 
 		 810 aa  271  4e-71  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00018653  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.02 
 
 		 769 aa  271  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0170  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.97 
 
 		 810 aa  271  4e-71  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000513305  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  25.71 
 
 		 769 aa  271  5e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3157  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.5 
 
 		 805 aa  271  5e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0017892  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.98 
 
 		 770 aa  270  5.9999999999999995e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.74 
 
 		 770 aa  270  7e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.9 
 
 		 810 aa  270  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  0.197895 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  26.63 
 
 		 794 aa  270  8e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0250  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.9 
 
 		 810 aa  270  8e-71  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.609554  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  25.68 
 
 		 768 aa  270  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  25.68 
 
 		 768 aa  270  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  26.28 
 
 		 790 aa  269  1e-70  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  25.72 
 
 		 796 aa  269  1e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  25.68 
 
 		 768 aa  270  1e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  25.68 
 
 		 768 aa  270  1e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  25.46 
 
 		 769 aa  270  1e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  25.46 
 
 		 769 aa  270  1e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>