More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1531 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  73.88 
 
 		 844 aa  1244    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  75.35 
 
 		 856 aa  1303    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  90.77 
 
 		 829 aa  1512    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  48.81 
 
 		 834 aa  795    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  44.68 
 
 		 843 aa  710    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  75.58 
 
 		 854 aa  1315    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  43.68 
 
 		 834 aa  692    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  100 
 
 		 857 aa  1723    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  43.17 
 
 		 840 aa  683    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  44.87 
 
 		 845 aa  698    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  75.47 
 
 		 854 aa  1312    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  43.57 
 
 		 841 aa  694    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  56.12 
 
 		 821 aa  921    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  45.53 
 
 		 844 aa  712    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  44.64 
 
 		 843 aa  707    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  54.88 
 
 		 855 aa  910    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  75.32 
 
 		 864 aa  1320    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  44.69 
 
 		 852 aa  703    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  44.69 
 
 		 841 aa  714    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  39.15 
 
 		 777 aa  575  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  39.02 
 
 		 785 aa  569  1e-161  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  38.75 
 
 		 778 aa  565  1.0000000000000001e-159  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5827  putative protective surface antigen precursor (Outer membrane protein D15)  37.74 
 
 		 782 aa  560  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.07 
 
 		 803 aa  559  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  39.38 
 
 		 788 aa  561  1e-158  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  39.07 
 
 		 781 aa  558  1e-157  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.78 
 
 		 779 aa  550  1e-155  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.85 
 
 		 780 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  37.4 
 
 		 798 aa  526  1e-148  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.98 
 
 		 785 aa  504  1e-141  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  34.76 
 
 		 794 aa  498  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1388  surface antigen (D15)  36.57 
 
 		 795 aa  493  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0577653  normal  0.0157833 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  34.81 
 
 		 785 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  33.18 
 
 		 905 aa  444  1e-123  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  32.45 
 
 		 910 aa  427  1e-118  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  31.88 
 
 		 887 aa  423  1e-117  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2146  surface antigen (D15)  33.05 
 
 		 792 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.766596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  31.42 
 
 		 785 aa  395  1e-108  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.42 
 
 		 804 aa  394  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847749 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2711  putative outer membrane protein  32.23 
 
 		 799 aa  384  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.902664  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3999  surface antigen (D15)  32.78 
 
 		 782 aa  380  1e-104  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54012  normal  0.826111 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1369  surface antigen (D15)  31.76 
 
 		 799 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.747321  decreased coverage  0.00880921 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1407  surface antigen (D15)  29.2 
 
 		 796 aa  344  4e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  29.33 
 
 		 767 aa  340  9e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2453  surface antigen (D15)  29.98 
 
 		 772 aa  335  3e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0002154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1499  hypothetical protein  31.27 
 
 		 748 aa  321  3.9999999999999996e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696254  normal  0.873913 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0863  surface antigen (D15):surface antigen variable number  26.78 
 
 		 769 aa  314  3.9999999999999997e-84  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  28.85 
 
 		 820 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  28.36 
 
 		 913 aa  299  1e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  29.02 
 
 		 765 aa  297  5e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  28.29 
 
 		 751 aa  297  6e-79  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3972  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.51 
 
 		 848 aa  295  3e-78  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0128783  normal  0.80602 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.56 
 
 		 752 aa  293  1e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  27.97 
 
 		 806 aa  291  5.0000000000000004e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.73 
 
 		 793 aa  290  9e-77  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.85 
 
 		 793 aa  288  2e-76  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1071  OMP85 family outer membrane protein  26.87 
 
 		 773 aa  289  2e-76  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0702133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  28.14 
 
 		 770 aa  282  2e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  26.55 
 
 		 769 aa  281  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0718  OMP85 family outer membrane protein  27.79 
 
 		 744 aa  278  4e-73  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  27.37 
 
 		 763 aa  277  5e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.43 
 
 		 808 aa  277  6e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  26.68 
 
 		 790 aa  275  3e-72  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  26.56 
 
 		 769 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  26.56 
 
 		 769 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.44 
 
 		 769 aa  274  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.56 
 
 		 768 aa  272  2e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  26.2 
 
 		 769 aa  272  2e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.44 
 
 		 769 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  26.2 
 
 		 768 aa  271  4e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  26.73 
 
 		 760 aa  270  8.999999999999999e-71  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  26.16 
 
 		 768 aa  269  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  26.16 
 
 		 768 aa  269  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  26.16 
 
 		 769 aa  269  2e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  26.16 
 
 		 768 aa  269  2e-70  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  26.16 
 
 		 768 aa  269  2e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.41 
 
 		 784 aa  268  2.9999999999999995e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  26.05 
 
 		 768 aa  267  5e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  26.05 
 
 		 769 aa  267  8e-70  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  26.05 
 
 		 769 aa  267  8e-70  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.92 
 
 		 770 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.41 
 
 		 802 aa  266  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  27.92 
 
 		 888 aa  265  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  25.85 
 
 		 767 aa  265  3e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.81 
 
 		 769 aa  264  4.999999999999999e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.22 
 
 		 765 aa  264  4.999999999999999e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  28.13 
 
 		 790 aa  262  2e-68  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.93 
 
 		 770 aa  261  3e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  30.94 
 
 		 752 aa  258  3e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  25.57 
 
 		 791 aa  254  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  25.74 
 
 		 795 aa  254  6e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  26.79 
 
 		 790 aa  250  1e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_002978  WD1085  surface antigen  26.25 
 
 		 778 aa  249  2e-64  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  25.98 
 
 		 763 aa  248  3e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1280  surface antigen (D15)  26.64 
 
 		 781 aa  248  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.359483  normal  0.823842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  26.53 
 
 		 786 aa  247  6e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  25.85 
 
 		 787 aa  247  8e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  26.41 
 
 		 786 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0724  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.19 
 
 		 803 aa  246  9.999999999999999e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  0.000000000000238666  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.64 
 
 		 799 aa  246  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>