More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0468 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  100 
 
 		 910 aa  1851    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  58.72 
 
 		 905 aa  1070    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  58.63 
 
 		 887 aa  1046    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  41.88 
 
 		 794 aa  572  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1388  surface antigen (D15)  42.61 
 
 		 795 aa  564  1.0000000000000001e-159  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0577653  normal  0.0157833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  42.03 
 
 		 785 aa  561  1e-158  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  39.68 
 
 		 785 aa  529  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  35.55 
 
 		 834 aa  513  1e-144  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  33.81 
 
 		 852 aa  497  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  33.74 
 
 		 841 aa  496  1e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  33.52 
 
 		 843 aa  487  1e-136  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.56 
 
 		 841 aa  485  1e-135  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  33.41 
 
 		 845 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  33.75 
 
 		 844 aa  480  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  32.7 
 
 		 843 aa  478  1e-133  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.48 
 
 		 821 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  33.6 
 
 		 840 aa  469  9.999999999999999e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.07 
 
 		 855 aa  469  9.999999999999999e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  34.48 
 
 		 834 aa  463  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.3 
 
 		 829 aa  433  1e-120  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  33.85 
 
 		 777 aa  429  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.11 
 
 		 854 aa  422  1e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.47 
 
 		 857 aa  421  1e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.11 
 
 		 804 aa  421  1e-116  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847749 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.19 
 
 		 864 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.92 
 
 		 844 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.19 
 
 		 854 aa  418  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  34.71 
 
 		 788 aa  416  1e-114  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  33.46 
 
 		 785 aa  414  1e-114  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.94 
 
 		 856 aa  412  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  33.46 
 
 		 781 aa  407  1.0000000000000001e-112  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.46 
 
 		 803 aa  408  1.0000000000000001e-112  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  33.12 
 
 		 785 aa  409  1.0000000000000001e-112  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  32.09 
 
 		 778 aa  400  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5827  putative protective surface antigen precursor (Outer membrane protein D15)  33.11 
 
 		 782 aa  402  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.69 
 
 		 779 aa  382  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3999  surface antigen (D15)  33.38 
 
 		 782 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54012  normal  0.826111 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.82 
 
 		 780 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1369  surface antigen (D15)  33.69 
 
 		 799 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.747321  decreased coverage  0.00880921 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2146  surface antigen (D15)  33.38 
 
 		 792 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.766596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  30.96 
 
 		 767 aa  376  1e-102  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2711  putative outer membrane protein  33.69 
 
 		 799 aa  373  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.902664  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1407  surface antigen (D15)  33.2 
 
 		 796 aa  360  4e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  31.25 
 
 		 798 aa  358  1.9999999999999998e-97  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2453  surface antigen (D15)  30.22 
 
 		 772 aa  342  1e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0002154 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0863  surface antigen (D15):surface antigen variable number  30.55 
 
 		 769 aa  332  2e-89  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1499  hypothetical protein  30.25 
 
 		 748 aa  331  4e-89  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696254  normal  0.873913 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1071  OMP85 family outer membrane protein  30.84 
 
 		 773 aa  311  5e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0702133  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.32 
 
 		 770 aa  303  7.000000000000001e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  29.83 
 
 		 770 aa  298  3e-79  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  28.59 
 
 		 768 aa  297  7e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  28.59 
 
 		 768 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  28.59 
 
 		 769 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  28.59 
 
 		 768 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  28.59 
 
 		 768 aa  295  2e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  28.45 
 
 		 769 aa  295  3e-78  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  28.45 
 
 		 768 aa  295  3e-78  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  28.45 
 
 		 769 aa  295  3e-78  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.12 
 
 		 808 aa  294  6e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.72 
 
 		 768 aa  293  8e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.59 
 
 		 769 aa  293  1e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  28.04 
 
 		 769 aa  292  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  28.04 
 
 		 769 aa  292  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.18 
 
 		 769 aa  291  4e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  27.76 
 
 		 768 aa  291  4e-77  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  27.45 
 
 		 769 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  28.83 
 
 		 765 aa  288  4e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1443  surface antigen (D15)  28.89 
 
 		 758 aa  288  4e-76  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.380953  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  30.29 
 
 		 913 aa  287  5e-76  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.92 
 
 		 802 aa  286  1.0000000000000001e-75  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.42 
 
 		 752 aa  285  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.77 
 
 		 770 aa  285  4.0000000000000003e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_002978  WD1085  surface antigen  27.78 
 
 		 778 aa  284  5.000000000000001e-75  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  27.45 
 
 		 765 aa  284  6.000000000000001e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  29.2 
 
 		 790 aa  284  6.000000000000001e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.99 
 
 		 769 aa  281  3e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  27.95 
 
 		 781 aa  281  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.95 
 
 		 781 aa  281  5e-74  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  26.87 
 
 		 791 aa  279  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  27.19 
 
 		 784 aa  278  3e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  27.7 
 
 		 767 aa  278  3e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.42 
 
 		 765 aa  278  4e-73  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.28 
 
 		 750 aa  278  5e-73  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  27.46 
 
 		 790 aa  276  9e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.43 
 
 		 784 aa  276  2.0000000000000002e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.12 
 
 		 765 aa  275  3e-72  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2607  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.78 
 
 		 811 aa  273  1e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.745531  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  28.38 
 
 		 788 aa  273  1e-71  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  28.02 
 
 		 765 aa  272  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.4 
 
 		 765 aa  271  2.9999999999999997e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  28.26 
 
 		 765 aa  271  4e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.28 
 
 		 793 aa  271  4e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  28.24 
 
 		 806 aa  270  5.9999999999999995e-71  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.15 
 
 		 793 aa  270  8e-71  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  26.29 
 
 		 769 aa  270  1e-70  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  29.04 
 
 		 794 aa  270  1e-70  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4254  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.76 
 
 		 800 aa  268  2e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  28.48 
 
 		 792 aa  269  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  27.32 
 
 		 820 aa  269  2e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.89 
 
 		 799 aa  268  2.9999999999999995e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>