More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3260 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  46.19 
 
 		 829 aa  712    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  48.79 
 
 		 855 aa  773    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  52.6 
 
 		 834 aa  858    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  75.62 
 
 		 843 aa  1286    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  45.08 
 
 		 857 aa  710    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  43.79 
 
 		 844 aa  682    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  100 
 
 		 841 aa  1701    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  49.33 
 
 		 821 aa  781    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  44.78 
 
 		 864 aa  699    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  70.89 
 
 		 840 aa  1187    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  89.47 
 
 		 845 aa  1503    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  77.71 
 
 		 852 aa  1345    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  81.24 
 
 		 841 aa  1417    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  44.07 
 
 		 856 aa  706    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  88.52 
 
 		 844 aa  1474    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  78.07 
 
 		 843 aa  1310    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5827  putative protective surface antigen precursor (Outer membrane protein D15)  44.58 
 
 		 782 aa  691    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  74.97 
 
 		 834 aa  1255    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  44.78 
 
 		 854 aa  699    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  44.73 
 
 		 854 aa  701    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  40.45 
 
 		 803 aa  602  1.0000000000000001e-171  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  40.45 
 
 		 781 aa  603  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  39.55 
 
 		 785 aa  603  1.0000000000000001e-171  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  40.59 
 
 		 777 aa  586  1e-166  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  39.56 
 
 		 788 aa  571  1e-161  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  38.51 
 
 		 798 aa  546  1e-154  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  38.4 
 
 		 794 aa  547  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  37.99 
 
 		 778 aa  546  1e-154  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.22 
 
 		 785 aa  544  1e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.3 
 
 		 780 aa  526  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.06 
 
 		 779 aa  528  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  37.09 
 
 		 785 aa  515  1e-144  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1388  surface antigen (D15)  36.72 
 
 		 795 aa  515  1e-144  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0577653  normal  0.0157833 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  34.76 
 
 		 887 aa  496  1e-139  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  34.55 
 
 		 905 aa  490  1e-137  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  33.52 
 
 		 910 aa  486  1e-136  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.4 
 
 		 804 aa  484  1e-135  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847749 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  33.69 
 
 		 785 aa  462  9.999999999999999e-129  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2146  surface antigen (D15)  35.21 
 
 		 792 aa  451  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.766596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3999  surface antigen (D15)  34.43 
 
 		 782 aa  446  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54012  normal  0.826111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2711  putative outer membrane protein  34.53 
 
 		 799 aa  444  1e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.902664  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1369  surface antigen (D15)  34.17 
 
 		 799 aa  438  1e-121  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.747321  decreased coverage  0.00880921 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1407  surface antigen (D15)  33.61 
 
 		 796 aa  424  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  31.57 
 
 		 767 aa  398  1e-109  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2453  surface antigen (D15)  32.05 
 
 		 772 aa  382  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0002154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1499  hypothetical protein  31.13 
 
 		 748 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696254  normal  0.873913 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.11 
 
 		 808 aa  331  4e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1085  surface antigen  29.12 
 
 		 778 aa  325  3e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.82 
 
 		 752 aa  321  3.9999999999999996e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0863  surface antigen (D15):surface antigen variable number  27.28 
 
 		 769 aa  320  6e-86  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.39 
 
 		 802 aa  315  2.9999999999999996e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  27.4 
 
 		 769 aa  310  9e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  29.21 
 
 		 820 aa  308  2.0000000000000002e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  28.15 
 
 		 790 aa  306  7e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  27.74 
 
 		 806 aa  305  2.0000000000000002e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.38 
 
 		 793 aa  303  6.000000000000001e-81  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  27.6 
 
 		 791 aa  302  1e-80  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  27.28 
 
 		 792 aa  301  2e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.5 
 
 		 793 aa  302  2e-80  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  27.11 
 
 		 751 aa  300  6e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  27.47 
 
 		 795 aa  300  9e-80  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  27.74 
 
 		 765 aa  299  1e-79  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.05 
 
 		 797 aa  299  1e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  27.03 
 
 		 794 aa  299  2e-79  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  29.23 
 
 		 790 aa  297  5e-79  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  29.08 
 
 		 763 aa  295  3e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  27.23 
 
 		 796 aa  293  6e-78  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  28.43 
 
 		 913 aa  293  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.99 
 
 		 787 aa  291  3e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  27.59 
 
 		 786 aa  290  6e-77  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  27.47 
 
 		 786 aa  290  6e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  27.47 
 
 		 786 aa  290  7e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1071  OMP85 family outer membrane protein  27.65 
 
 		 773 aa  290  7e-77  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0702133  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.61 
 
 		 784 aa  290  8e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0718  OMP85 family outer membrane protein  28.52 
 
 		 744 aa  289  2e-76  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  28.94 
 
 		 790 aa  289  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  27.36 
 
 		 763 aa  289  2e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  26.8 
 
 		 787 aa  288  4e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  26.8 
 
 		 787 aa  287  5e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.46 
 
 		 799 aa  287  5e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  32.71 
 
 		 752 aa  283  6.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  28.79 
 
 		 888 aa  283  1e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0322  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.64 
 
 		 784 aa  282  2e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  26.53 
 
 		 784 aa  282  2e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  27.59 
 
 		 770 aa  279  1e-73  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  26.42 
 
 		 788 aa  279  1e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1561  OMP85 family outer membrane protein  27.01 
 
 		 817 aa  278  2e-73  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347163  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3381  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.56 
 
 		 895 aa  278  3e-73  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.97 
 
 		 787 aa  278  4e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  26.03 
 
 		 768 aa  276  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  25.53 
 
 		 768 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  25.53 
 
 		 769 aa  276  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1356  surface antigen (D15)  27.34 
 
 		 826 aa  276  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000205975  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  25.53 
 
 		 768 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  25.53 
 
 		 768 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2807  surface antigen (D15)  27.98 
 
 		 826 aa  275  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000285002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.9 
 
 		 769 aa  273  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  28.03 
 
 		 801 aa  273  1e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000907033  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2894  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.87 
 
 		 826 aa  273  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172199  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  25.78 
 
 		 769 aa  273  1e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>