More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_0131 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  44.37 
 
 		 854 aa  705    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  43.32 
 
 		 864 aa  696    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  43.32 
 
 		 854 aa  695    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5827  putative protective surface antigen precursor (Outer membrane protein D15)  45.75 
 
 		 782 aa  702    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  72.52 
 
 		 843 aa  1228    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  74.97 
 
 		 841 aa  1251    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  75.24 
 
 		 840 aa  1278    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  74.53 
 
 		 845 aa  1247    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  43.7 
 
 		 857 aa  687    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  48.06 
 
 		 855 aa  774    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  78.41 
 
 		 852 aa  1357    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  75.12 
 
 		 841 aa  1296    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  100 
 
 		 834 aa  1692    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  73.85 
 
 		 844 aa  1245    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  73.76 
 
 		 843 aa  1235    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  43.21 
 
 		 856 aa  689    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  52.17 
 
 		 834 aa  836    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  41.69 
 
 		 844 aa  662    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  43.47 
 
 		 829 aa  681    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  48.47 
 
 		 821 aa  775    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  39.42 
 
 		 785 aa  578  1.0000000000000001e-163  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  39.63 
 
 		 781 aa  574  1.0000000000000001e-162  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.63 
 
 		 803 aa  573  1.0000000000000001e-162  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.59 
 
 		 785 aa  555  1e-156  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  38.9 
 
 		 788 aa  552  1e-155  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  38.26 
 
 		 777 aa  546  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  37.56 
 
 		 794 aa  546  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  37.66 
 
 		 778 aa  526  1e-148  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1388  surface antigen (D15)  37.48 
 
 		 795 aa  518  1.0000000000000001e-145  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0577653  normal  0.0157833 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  36.43 
 
 		 798 aa  512  1e-143  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.48 
 
 		 779 aa  506  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  37.22 
 
 		 785 aa  503  1e-141  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.76 
 
 		 780 aa  501  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  34.39 
 
 		 905 aa  493  9.999999999999999e-139  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  33.94 
 
 		 887 aa  476  1e-133  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.19 
 
 		 804 aa  473  1e-132  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847749 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  35.29 
 
 		 785 aa  469  1.0000000000000001e-131  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  34.16 
 
 		 910 aa  464  1e-129  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2146  surface antigen (D15)  34.62 
 
 		 792 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.766596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3999  surface antigen (D15)  34.69 
 
 		 782 aa  442  9.999999999999999e-123  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54012  normal  0.826111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2711  putative outer membrane protein  34.02 
 
 		 799 aa  438  1e-121  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.902664  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1369  surface antigen (D15)  34.6 
 
 		 799 aa  433  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.747321  decreased coverage  0.00880921 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1407  surface antigen (D15)  32.8 
 
 		 796 aa  420  1e-116  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  31.13 
 
 		 767 aa  388  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2453  surface antigen (D15)  31.55 
 
 		 772 aa  383  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0002154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1499  hypothetical protein  31.9 
 
 		 748 aa  369  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696254  normal  0.873913 
 
 
-
 
NC_002978  WD1085  surface antigen  29.39 
 
 		 778 aa  326  1e-87  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.84 
 
 		 808 aa  320  6e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  29.21 
 
 		 765 aa  319  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  27.52 
 
 		 751 aa  313  7.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  28.07 
 
 		 769 aa  311  2.9999999999999997e-83  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.71 
 
 		 802 aa  310  5.9999999999999995e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  27.91 
 
 		 763 aa  306  1.0000000000000001e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.98 
 
 		 752 aa  303  1e-80  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  28.88 
 
 		 820 aa  302  2e-80  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.45 
 
 		 793 aa  301  3e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  27.23 
 
 		 806 aa  300  6e-80  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.21 
 
 		 793 aa  297  5e-79  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  26.81 
 
 		 790 aa  297  5e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  27.45 
 
 		 792 aa  290  8e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  28.72 
 
 		 801 aa  290  1e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000907033  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0949  outer membrane protein assembly factor YaeT  29.66 
 
 		 809 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00135315  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  27.66 
 
 		 913 aa  283  1e-74  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  28.64 
 
 		 787 aa  282  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  28.52 
 
 		 787 aa  280  6e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0715  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.58 
 
 		 805 aa  280  6e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000733739  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  26.8 
 
 		 796 aa  280  9e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0265  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.91 
 
 		 803 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000300024  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  25.96 
 
 		 768 aa  279  1e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  26.56 
 
 		 795 aa  280  1e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  28.3 
 
 		 790 aa  280  1e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  26.9 
 
 		 786 aa  278  2e-73  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.78 
 
 		 804 aa  279  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25845  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0262  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.91 
 
 		 803 aa  278  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  26.9 
 
 		 786 aa  278  3e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.18 
 
 		 810 aa  278  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  0.197895 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  26.08 
 
 		 788 aa  278  4e-73  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0250  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.18 
 
 		 810 aa  278  4e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.609554  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.67 
 
 		 787 aa  277  5e-73  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.06 
 
 		 797 aa  277  5e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  27.79 
 
 		 888 aa  277  5e-73  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  27.39 
 
 		 786 aa  277  6e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3352  outer membrane protein assembly factor YaeT  28.79 
 
 		 815 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346772  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  26.03 
 
 		 794 aa  276  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.84 
 
 		 799 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.01 
 
 		 784 aa  275  3e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00175  hypothetical protein  27.06 
 
 		 810 aa  274  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000980871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3426  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.06 
 
 		 810 aa  274  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480767  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0179  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.06 
 
 		 810 aa  274  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000266992  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  26.77 
 
 		 791 aa  275  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0187  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.06 
 
 		 810 aa  274  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00010789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0170  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.06 
 
 		 810 aa  274  4.0000000000000004e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000513305  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3483  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.06 
 
 		 810 aa  274  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000802072  normal  0.102232 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00174  hypothetical protein  27.06 
 
 		 810 aa  274  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00018653  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0181  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.06 
 
 		 810 aa  274  4.0000000000000004e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000194171  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  27.72 
 
 		 790 aa  274  5.000000000000001e-72  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.24 
 
 		 787 aa  273  7e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.38 
 
 		 784 aa  273  1e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0188  outer membrane protein assembly factor YaeT  26.93 
 
 		 810 aa  273  1e-71  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000418762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3427  outer membrane protein assembly factor YaeT  28.04 
 
 		 795 aa  272  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000902719  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>