More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_2517 on replicon NC_011989
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  100 
 
 		 778 aa  1578    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  52.8 
 
 		 781 aa  812    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  52.81 
 
 		 803 aa  812    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  70.35 
 
 		 779 aa  1068    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  53.25 
 
 		 785 aa  824    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  51.32 
 
 		 788 aa  780    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  44.68 
 
 		 798 aa  684    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  70.38 
 
 		 780 aa  1062    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  66.67 
 
 		 777 aa  1063    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  41.58 
 
 		 834 aa  593  1e-168  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.76 
 
 		 855 aa  576  1.0000000000000001e-163  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.74 
 
 		 856 aa  560  1e-158  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.76 
 
 		 857 aa  559  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.37 
 
 		 829 aa  557  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.49 
 
 		 821 aa  552  1e-156  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.99 
 
 		 841 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  38.46 
 
 		 843 aa  543  1e-153  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  37.6 
 
 		 843 aa  538  1e-151  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.92 
 
 		 844 aa  538  1e-151  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  36.57 
 
 		 841 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  37.51 
 
 		 852 aa  538  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  38.51 
 
 		 844 aa  536  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.34 
 
 		 854 aa  538  1e-151  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.03 
 
 		 854 aa  535  1e-150  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.03 
 
 		 864 aa  534  1e-150  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  37.66 
 
 		 834 aa  527  1e-148  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  37.75 
 
 		 840 aa  528  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  38.21 
 
 		 845 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5827  putative protective surface antigen precursor (Outer membrane protein D15)  37.12 
 
 		 782 aa  488  1e-136  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.68 
 
 		 785 aa  476  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  35.74 
 
 		 785 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1388  surface antigen (D15)  35.63 
 
 		 795 aa  471  1.0000000000000001e-131  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0577653  normal  0.0157833 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  36.22 
 
 		 794 aa  458  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  35.13 
 
 		 785 aa  424  1e-117  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2146  surface antigen (D15)  34.18 
 
 		 792 aa  415  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.766596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.47 
 
 		 804 aa  413  1e-114  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847749 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  33.25 
 
 		 767 aa  409  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2711  putative outer membrane protein  33.89 
 
 		 799 aa  409  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.902664  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3999  surface antigen (D15)  34.73 
 
 		 782 aa  407  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54012  normal  0.826111 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1407  surface antigen (D15)  32.86 
 
 		 796 aa  403  1e-111  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1369  surface antigen (D15)  33.42 
 
 		 799 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.747321  decreased coverage  0.00880921 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  30.44 
 
 		 905 aa  402  9.999999999999999e-111  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  32.09 
 
 		 910 aa  401  9.999999999999999e-111  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2453  surface antigen (D15)  31.53 
 
 		 772 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0002154 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  29.61 
 
 		 887 aa  377  1e-103  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  31.38 
 
 		 790 aa  354  4e-96  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  30.38 
 
 		 770 aa  352  2e-95  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1499  hypothetical protein  30.37 
 
 		 748 aa  350  4e-95  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696254  normal  0.873913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  31.07 
 
 		 752 aa  340  5e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  30.48 
 
 		 787 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  30.48 
 
 		 787 aa  337  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  30 
 
 		 751 aa  335  2e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  29.59 
 
 		 768 aa  333  5e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.52 
 
 		 769 aa  333  6e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.23 
 
 		 799 aa  333  6e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  29.39 
 
 		 769 aa  333  8e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  29.39 
 
 		 769 aa  333  8e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.79 
 
 		 769 aa  333  1e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  29.75 
 
 		 768 aa  332  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.88 
 
 		 769 aa  332  1e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  31.41 
 
 		 790 aa  333  1e-89  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  29.75 
 
 		 769 aa  332  2e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  29.59 
 
 		 769 aa  332  2e-89  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  29.75 
 
 		 769 aa  332  2e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  29.61 
 
 		 768 aa  330  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  29.61 
 
 		 769 aa  330  7e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.46 
 
 		 769 aa  330  7e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  29.61 
 
 		 768 aa  330  8e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  29.61 
 
 		 768 aa  330  8e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  29.61 
 
 		 768 aa  330  8e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.16 
 
 		 758 aa  329  1.0000000000000001e-88  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.33 
 
 		 768 aa  327  4.0000000000000003e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  29.03 
 
 		 792 aa  327  5e-88  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  30.6 
 
 		 760 aa  327  5e-88  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  30.1 
 
 		 765 aa  325  1e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.19 
 
 		 765 aa  326  1e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.89 
 
 		 752 aa  325  2e-87  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  30.81 
 
 		 779 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  28.84 
 
 		 763 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  29.26 
 
 		 786 aa  322  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.02 
 
 		 765 aa  321  3.9999999999999996e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  31.02 
 
 		 765 aa  320  5e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  29.13 
 
 		 786 aa  320  6e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3794  surface antigen (D15):surface antigen variable number  30.59 
 
 		 790 aa  318  2e-85  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173749 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.51 
 
 		 784 aa  318  3e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  31.23 
 
 		 765 aa  318  3e-85  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.84 
 
 		 787 aa  317  8e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  29.99 
 
 		 767 aa  317  8e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  28.22 
 
 		 769 aa  316  8e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0863  surface antigen (D15):surface antigen variable number  28.08 
 
 		 769 aa  315  9.999999999999999e-85  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  28.84 
 
 		 794 aa  316  9.999999999999999e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.15 
 
 		 808 aa  315  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.11 
 
 		 770 aa  315  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.73 
 
 		 797 aa  314  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  27.19 
 
 		 781 aa  314  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.19 
 
 		 781 aa  314  3.9999999999999997e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.64 
 
 		 765 aa  312  1e-83  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.87 
 
 		 784 aa  312  1e-83  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1766  surface antigen (D15)  29.02 
 
 		 766 aa  313  1e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0726033  normal  0.0207518 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.43 
 
 		 802 aa  312  2e-83  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>