More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_1952 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  63.35 
 
 		 905 aa  1094    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  58.84 
 
 		 910 aa  1047    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  100 
 
 		 887 aa  1804    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1388  surface antigen (D15)  40.3 
 
 		 795 aa  571  1e-161  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0577653  normal  0.0157833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  39.55 
 
 		 785 aa  566  1e-160  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  38.92 
 
 		 794 aa  560  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  36.03 
 
 		 785 aa  528  1e-148  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  36 
 
 		 834 aa  509  1e-143  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  34.55 
 
 		 843 aa  503  1e-141  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  34.25 
 
 		 852 aa  500  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  34.07 
 
 		 841 aa  494  9.999999999999999e-139  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  34.03 
 
 		 843 aa  496  9.999999999999999e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.2 
 
 		 841 aa  492  1e-137  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  33.66 
 
 		 840 aa  484  1e-135  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.3 
 
 		 855 aa  481  1e-134  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  34.26 
 
 		 845 aa  479  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  34.07 
 
 		 844 aa  477  1e-133  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  33.71 
 
 		 834 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.56 
 
 		 821 aa  472  1.0000000000000001e-131  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.12 
 
 		 804 aa  461  9.999999999999999e-129  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847749 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  32.28 
 
 		 785 aa  443  1e-123  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.91 
 
 		 829 aa  431  1e-119  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.63 
 
 		 854 aa  423  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  31.63 
 
 		 785 aa  423  1e-117  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.52 
 
 		 864 aa  423  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.52 
 
 		 854 aa  423  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  32.51 
 
 		 781 aa  421  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  32.4 
 
 		 803 aa  421  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.55 
 
 		 857 aa  416  9.999999999999999e-116  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.45 
 
 		 856 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.63 
 
 		 844 aa  419  9.999999999999999e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5827  putative protective surface antigen precursor (Outer membrane protein D15)  33.33 
 
 		 782 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  31.71 
 
 		 788 aa  400  9.999999999999999e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  32.53 
 
 		 777 aa  396  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  30.61 
 
 		 767 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3999  surface antigen (D15)  30.91 
 
 		 782 aa  391  1e-107  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54012  normal  0.826111 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2146  surface antigen (D15)  31.54 
 
 		 792 aa  387  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.766596  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2711  putative outer membrane protein  31.1 
 
 		 799 aa  383  1e-105  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.902664  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.91 
 
 		 780 aa  378  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  29.61 
 
 		 778 aa  375  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1407  surface antigen (D15)  30.67 
 
 		 796 aa  375  1e-102  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  29.8 
 
 		 798 aa  372  1e-101  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1499  hypothetical protein  31.66 
 
 		 748 aa  369  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696254  normal  0.873913 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1369  surface antigen (D15)  33.15 
 
 		 799 aa  368  1e-100  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.747321  decreased coverage  0.00880921 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2453  surface antigen (D15)  29.33 
 
 		 772 aa  353  5.9999999999999994e-96  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0002154 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.96 
 
 		 779 aa  353  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1412  putative outer membrane signal peptide protein  30 
 
 		 765 aa  336  1e-90  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.272317 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1286  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.76 
 
 		 765 aa  336  1e-90  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.368496  normal  0.747084 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1350  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.76 
 
 		 750 aa  335  2e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0760351  normal  0.942125 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  29.55 
 
 		 790 aa  333  7.000000000000001e-90  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0863  surface antigen (D15):surface antigen variable number  27.69 
 
 		 769 aa  333  1e-89  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.31 
 
 		 770 aa  329  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.6 
 
 		 808 aa  325  2e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1873  surface antigen (D15):surface antigen variable number  28.86 
 
 		 784 aa  321  3.9999999999999996e-86  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.836752  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2170  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.7 
 
 		 784 aa  320  1e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  31.14 
 
 		 770 aa  319  1e-85  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  29.29 
 
 		 913 aa  318  3e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1443  surface antigen (D15)  28.69 
 
 		 791 aa  318  3e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680805  decreased coverage  0.000148941 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  30.28 
 
 		 765 aa  315  1.9999999999999998e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.07 
 
 		 802 aa  315  3.9999999999999997e-84  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1071  OMP85 family outer membrane protein  29.35 
 
 		 773 aa  313  1e-83  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0702133  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  29.11 
 
 		 806 aa  311  2.9999999999999997e-83  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.98 
 
 		 793 aa  311  5e-83  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  29.03 
 
 		 820 aa  310  1.0000000000000001e-82  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.73 
 
 		 752 aa  310  1.0000000000000001e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.98 
 
 		 793 aa  308  3e-82  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.24 
 
 		 770 aa  308  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1147  surface antigen  28.29 
 
 		 844 aa  304  4.0000000000000003e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.003885  normal  0.883859 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  28.74 
 
 		 767 aa  304  4.0000000000000003e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  28.1 
 
 		 790 aa  305  4.0000000000000003e-81  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2894  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.04 
 
 		 826 aa  302  2e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0172199  normal  0.36533 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1489  surface antigen (D15)  28.04 
 
 		 826 aa  302  2e-80  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00390259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1453  surface antigen (D15)  28.04 
 
 		 826 aa  302  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000244779  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  28.85 
 
 		 768 aa  300  7e-80  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  28.85 
 
 		 768 aa  300  7e-80  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  28.85 
 
 		 768 aa  300  7e-80  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  28.85 
 
 		 769 aa  300  8e-80  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.67 
 
 		 768 aa  299  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  28.85 
 
 		 768 aa  299  1e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2807  surface antigen (D15)  27.75 
 
 		 826 aa  300  1e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000285002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1356  surface antigen (D15)  27.23 
 
 		 826 aa  299  2e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000205975  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  29.74 
 
 		 760 aa  299  2e-79  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2633  surface antigen (D15)  27.75 
 
 		 826 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000445373  normal  0.203506 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2700  surface antigen (D15)  27.75 
 
 		 826 aa  298  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000360043  hitchhiker  0.00504138 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  28.81 
 
 		 768 aa  298  3e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.67 
 
 		 769 aa  298  4e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1637  surface antigen  27.35 
 
 		 826 aa  297  6e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  28.67 
 
 		 769 aa  296  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  28.71 
 
 		 768 aa  297  8e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  28.71 
 
 		 769 aa  296  9e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  28.71 
 
 		 769 aa  296  9e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  28.67 
 
 		 769 aa  296  9e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  28.67 
 
 		 769 aa  296  9e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.61 
 
 		 797 aa  296  1e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  27.87 
 
 		 769 aa  296  1e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.53 
 
 		 769 aa  296  1e-78  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3273  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.38 
 
 		 827 aa  295  2e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000281786  hitchhiker  0.00225371 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.3 
 
 		 769 aa  295  3e-78  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1458  surface antigen (D15)  27.7 
 
 		 827 aa  295  3e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000234879  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  28.87 
 
 		 794 aa  294  4e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>