More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2444 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  78.27 
 
 		 852 aa  1381    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  42.96 
 
 		 854 aa  680    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  43.43 
 
 		 857 aa  684    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  76.3 
 
 		 843 aa  1311    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  49.53 
 
 		 855 aa  804    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  48.24 
 
 		 821 aa  784    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5827  putative protective surface antigen precursor (Outer membrane protein D15)  44.01 
 
 		 782 aa  687    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  42.19 
 
 		 856 aa  679    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  72.29 
 
 		 840 aa  1228    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  81.89 
 
 		 845 aa  1400    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  44.1 
 
 		 829 aa  688    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  75.12 
 
 		 834 aa  1289    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  100 
 
 		 841 aa  1706    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  42.96 
 
 		 864 aa  681    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  80.61 
 
 		 844 aa  1368    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  77.18 
 
 		 843 aa  1318    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  43.08 
 
 		 854 aa  685    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  50.58 
 
 		 834 aa  848    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  41.54 
 
 		 844 aa  660    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  81.24 
 
 		 841 aa  1395    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  38.99 
 
 		 781 aa  591  1e-167  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.99 
 
 		 803 aa  591  1e-167  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  38.21 
 
 		 785 aa  591  1e-167  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  38.72 
 
 		 777 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  39.3 
 
 		 788 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  38.27 
 
 		 798 aa  551  1e-155  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  38.72 
 
 		 785 aa  540  9.999999999999999e-153  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  37.94 
 
 		 785 aa  536  1e-151  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  36.57 
 
 		 778 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  38 
 
 		 794 aa  530  1e-149  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1388  surface antigen (D15)  36.32 
 
 		 795 aa  524  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0577653  normal  0.0157833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  37.07 
 
 		 779 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.45 
 
 		 780 aa  502  1e-140  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  35.01 
 
 		 905 aa  501  1e-140  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  34.09 
 
 		 910 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  34.53 
 
 		 887 aa  488  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  34.45 
 
 		 804 aa  478  1e-133  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0847749 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  34.08 
 
 		 785 aa  474  1e-132  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2146  surface antigen (D15)  33.61 
 
 		 792 aa  446  1e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.766596  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3999  surface antigen (D15)  33.83 
 
 		 782 aa  439  1e-121  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54012  normal  0.826111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2711  putative outer membrane protein  33.17 
 
 		 799 aa  431  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.902664  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1407  surface antigen (D15)  33.33 
 
 		 796 aa  424  1e-117  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1369  surface antigen (D15)  32.54 
 
 		 799 aa  421  1e-116  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.747321  decreased coverage  0.00880921 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  30.01 
 
 		 767 aa  387  1e-106  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2453  surface antigen (D15)  31.33 
 
 		 772 aa  383  1e-105  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0002154 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1499  hypothetical protein  31.04 
 
 		 748 aa  368  1e-100  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696254  normal  0.873913 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.36 
 
 		 808 aa  345  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.45 
 
 		 752 aa  336  1e-90  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.2 
 
 		 802 aa  332  2e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  28.41 
 
 		 751 aa  327  4.0000000000000003e-88  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  28.5 
 
 		 769 aa  326  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2844  surface antigen (D15)  28.71 
 
 		 913 aa  315  2.9999999999999996e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  28.93 
 
 		 765 aa  313  6.999999999999999e-84  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  28.45 
 
 		 763 aa  306  2.0000000000000002e-81  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1085  surface antigen  28.04 
 
 		 778 aa  303  1e-80  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0863  surface antigen (D15):surface antigen variable number  26.15 
 
 		 769 aa  302  2e-80  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38910  surface antigen  27.42 
 
 		 792 aa  296  8e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1209  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.79 
 
 		 793 aa  296  1e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1542  outer membrane protein  26.83 
 
 		 795 aa  295  2e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1081  surface antigen (D15)  26.91 
 
 		 806 aa  296  2e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.506143  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  27.64 
 
 		 790 aa  296  2e-78  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1140  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.79 
 
 		 793 aa  293  6e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.275795  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1351  surface antigen (D15):surface antigen variable number  27.08 
 
 		 791 aa  292  2e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3782  outer membrane protein assembly factor YaeT  28.44 
 
 		 801 aa  292  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000907033  hitchhiker  0.00340919 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1109  surface antigen (D15)  26.77 
 
 		 796 aa  290  6e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.242384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0949  outer membrane protein assembly factor YaeT  28.21 
 
 		 809 aa  290  1e-76  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00135315  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  27.15 
 
 		 787 aa  288  2e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  27.72 
 
 		 770 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1561  OMP85 family outer membrane protein  27.86 
 
 		 817 aa  288  4e-76  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.347163  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.83 
 
 		 799 aa  288  4e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3045  surface antigen (D15)  27.03 
 
 		 786 aa  287  5.999999999999999e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  27.03 
 
 		 787 aa  286  8e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4178  surface antigen (D15)  26.82 
 
 		 786 aa  286  9e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.39317  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  26.82 
 
 		 786 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1120  surface antigen (D15)  27.78 
 
 		 820 aa  286  1.0000000000000001e-75  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0155272 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1278  surface antigen (D15)  27.56 
 
 		 763 aa  286  2.0000000000000002e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1154  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.82 
 
 		 787 aa  284  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0265  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.65 
 
 		 803 aa  284  6.000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000300024  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.45 
 
 		 784 aa  283  9e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.42 
 
 		 804 aa  283  1e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.25845  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0715  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.61 
 
 		 805 aa  283  1e-74  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000733739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1491  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  26.27 
 
 		 797 aa  282  2e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17150  putative outer membrane antigen  26.6 
 
 		 794 aa  282  2e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0262  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.65 
 
 		 803 aa  281  3e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.642005 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3745  surface antigen (D15)  26.83 
 
 		 888 aa  281  5e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00175  hypothetical protein  27.99 
 
 		 810 aa  280  1e-73  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.0000980871  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3426  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.99 
 
 		 810 aa  280  1e-73  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000480767  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0170  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.99 
 
 		 810 aa  280  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000513305  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0187  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.99 
 
 		 810 aa  280  1e-73  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00010789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3483  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.99 
 
 		 810 aa  280  1e-73  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000802072  normal  0.102232 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0179  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.99 
 
 		 810 aa  280  1e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000266992  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00174  hypothetical protein  27.99 
 
 		 810 aa  280  1e-73  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00018653  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0181  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.99 
 
 		 810 aa  280  1e-73  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000194171  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0246  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.57 
 
 		 810 aa  279  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.24449  normal  0.197895 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0250  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.57 
 
 		 810 aa  279  2e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.609554  normal  0.808726 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3352  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.62 
 
 		 815 aa  278  3e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0346772  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  25.87 
 
 		 768 aa  277  5e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3157  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.96 
 
 		 805 aa  276  9e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.0017892  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0188  outer membrane protein assembly factor YaeT  27.75 
 
 		 810 aa  276  1.0000000000000001e-72  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000418762  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0665  surface antigen (D15)  26.95 
 
 		 760 aa  275  3e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.381453  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>