More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2444 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_0365  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  44.33 
 
 
804 aa  705    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0847749 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2444  surface antigen (D15)  100 
 
 
785 aa  1602    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.873404  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1594  surface antigen D15  39.68 
 
 
785 aa  592  1e-167  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3188  surface antigen (D15)  39.63 
 
 
794 aa  522  1e-146  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1388  surface antigen (D15)  36.72 
 
 
795 aa  511  1e-143  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0577653  normal  0.0157833 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2797  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  36.18 
 
 
785 aa  486  1e-136  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0843475  normal  0.0789319 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2444  surface antigen (D15)  34.08 
 
 
841 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.51755  normal  0.253645 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1702  surface antigen (D15)  34.55 
 
 
843 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1851  Outer membrane protein  34.94 
 
 
843 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0454165 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0131  hypothetical protein  35.29 
 
 
834 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1138  surface antigen (D15)  35.87 
 
 
777 aa  458  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.309007  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4431  surface antigen (D15)  33.73 
 
 
834 aa  457  1e-127  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.35545  hitchhiker  0.00645464 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3260  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.69 
 
 
841 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1377  surface antigen (D15)  32.56 
 
 
905 aa  451  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0662411  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4509  surface antigen domain-containing protein  32.95 
 
 
852 aa  452  1e-125  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.263137  normal  0.782892 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2036  surface antigen (D15)  36.29 
 
 
785 aa  448  1.0000000000000001e-124  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1154  surface antigen  35.8 
 
 
781 aa  444  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.108315  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0751  surface antigen  33.75 
 
 
840 aa  444  1e-123  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1112  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  35.8 
 
 
803 aa  443  1e-123  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2849  surface antigen (D15)  33.25 
 
 
844 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.64374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2820  surface antigen (D15)  32.9 
 
 
845 aa  439  1e-121  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163282  normal  0.985968 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1388  surface antigen (D15)  34.29 
 
 
788 aa  438  1e-121  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.156909  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3837  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.69 
 
 
821 aa  428  1e-118  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0133754 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0295  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.09 
 
 
855 aa  426  1e-118  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.970191 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1952  surface antigen (D15)  32.34 
 
 
887 aa  429  1e-118  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0467846  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2517  group 1 outer membrane protein precursor  35.15 
 
 
778 aa  421  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0358941  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0589  OMP85 family outer membrane protein  32.25 
 
 
798 aa  416  1e-114  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00373174  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1848  surface antigen (D15)  32.14 
 
 
767 aa  412  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000894118  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3439  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.33 
 
 
856 aa  409  1e-113  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.535834 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2146  surface antigen (D15)  34.05 
 
 
792 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.766596  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0468  surface antigen (D15)  33.38 
 
 
910 aa  407  1.0000000000000001e-112  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.944558 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2041  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.93 
 
 
854 aa  405  1e-111  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.103106 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5827  putative protective surface antigen precursor (Outer membrane protein D15)  33.77 
 
 
782 aa  404  1e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.648958 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2081  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.82 
 
 
864 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220554  normal  0.237576 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1590  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.76 
 
 
779 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.281239  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2355  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.82 
 
 
854 aa  402  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.336912  normal  0.166651 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  33.58 
 
 
780 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.135415 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4783  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.78 
 
 
844 aa  401  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3999  surface antigen (D15)  33.07 
 
 
782 aa  397  1e-109  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.54012  normal  0.826111 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2711  putative outer membrane protein  32.75 
 
 
799 aa  395  1e-108  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.902664  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0638  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.98 
 
 
829 aa  390  1e-107  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.1817 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1531  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.52 
 
 
857 aa  386  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.511204  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1369  surface antigen (D15)  32.33 
 
 
799 aa  388  1e-106  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.747321  decreased coverage  0.00880921 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2453  surface antigen (D15)  30.38 
 
 
772 aa  368  1e-100  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0002154 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1407  surface antigen (D15)  30.8 
 
 
796 aa  367  1e-100  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.308963 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1499  hypothetical protein  32.32 
 
 
748 aa  356  8.999999999999999e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0696254  normal  0.873913 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2268  outer membrane protein, putative  29.58 
 
 
765 aa  356  1e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2357  surface antigen (D15)  30.43 
 
 
752 aa  353  5.9999999999999994e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0863  surface antigen (D15):surface antigen variable number  29.97 
 
 
769 aa  352  2e-95  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1251  putative outer membrane protein  28.57 
 
 
751 aa  345  2e-93  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  0.0000000000000031125  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3237  surface antigen (D15)  29.23 
 
 
769 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00806439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0760  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.5 
 
 
752 aa  340  8e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0162806  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2118  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.46 
 
 
769 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3421  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.03 
 
 
802 aa  338  2.9999999999999997e-91  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0839  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.59 
 
 
808 aa  337  5.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1452  outer membrane protein, OMP85 family  31.13 
 
 
781 aa  336  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1168  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  31.13 
 
 
781 aa  336  1e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1071  OMP85 family outer membrane protein  28.88 
 
 
773 aa  328  3e-88  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.0702133  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0793  surface antigen (D15)  29.64 
 
 
770 aa  326  1e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.27416 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1330  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  30.1 
 
 
770 aa  323  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1690  putative outer membrane antigen  29.43 
 
 
767 aa  323  7e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0520611  normal  0.149871 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2571  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.75 
 
 
799 aa  319  1e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.227309 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2428  OMP85 family outer membrane protein  29.58 
 
 
769 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.195214  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2574  OMP85 family outer membrane protein  29.58 
 
 
769 aa  318  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.131452  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2035  OMP85 family outer membrane protein  29.71 
 
 
768 aa  318  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.139503  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1319  OMP85 family outer membrane protein  29.58 
 
 
768 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1547  OMP85 family outer membrane protein  29.22 
 
 
769 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2047  OMP85 family outer membrane protein  29.58 
 
 
768 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.912739  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3264  OMP85 family outer membrane protein  29.58 
 
 
768 aa  317  4e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.337401  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1913  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.23 
 
 
768 aa  317  5e-85  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.426313 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2484  OMP85 family outer membrane protein  29.58 
 
 
768 aa  317  5e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2447  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.23 
 
 
770 aa  316  8e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158511  hitchhiker  0.00286506 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2031  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.31 
 
 
769 aa  316  9e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.675693  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6066  surface antigen (D15)  29.08 
 
 
769 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.298817  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2011  surface antigen (D15)  29.08 
 
 
769 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1522  surface antigen (D15)  29.04 
 
 
790 aa  315  1.9999999999999998e-84  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0389707  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3017  surface antigen (D15)  28.53 
 
 
763 aa  314  2.9999999999999996e-84  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.602177  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0357  outer membrane antigen  29.26 
 
 
784 aa  314  2.9999999999999996e-84  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.433119  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2044  surface antigen (D15)  28.95 
 
 
768 aa  314  3.9999999999999997e-84  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3485  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.61 
 
 
769 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.935009  normal  0.0697984 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1257  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.76 
 
 
787 aa  313  7.999999999999999e-84  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0901212  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0322  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.35 
 
 
784 aa  313  7.999999999999999e-84  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2385  surface antigen (D15)  28.88 
 
 
787 aa  313  1e-83  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.437807  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5321  surface antigen (D15)  28.82 
 
 
769 aa  312  2e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.202175 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3373  surface antigen family protein  28.75 
 
 
787 aa  310  5e-83  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.241276 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4940  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.4 
 
 
765 aa  309  1.0000000000000001e-82  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.269346  normal  0.0745121 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1265  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.42 
 
 
769 aa  307  4.0000000000000004e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.88133  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0718  OMP85 family outer membrane protein  28.55 
 
 
744 aa  305  3.0000000000000004e-81  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2577  surface antigen (D15)  28.01 
 
 
765 aa  300  8e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.489897  normal  0.089041 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1231  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.01 
 
 
765 aa  299  1e-79  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1085  surface antigen  28.39 
 
 
778 aa  298  3e-79  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1831  surface antigen (D15)  27.63 
 
 
765 aa  298  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01121  outer membrane antigen  28.53 
 
 
788 aa  295  2e-78  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.385807  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0816  Outer membrane protein  29.5 
 
 
766 aa  295  3e-78  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.468447  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1167  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  29.18 
 
 
758 aa  293  8e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.190139  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1446  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  28.54 
 
 
800 aa  293  1e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4074  outer membrane protein assembly complex, YaeT protein  27.57 
 
 
784 aa  290  6e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.184474 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1996  surface antigen (D15)  27.77 
 
 
779 aa  289  1e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.685861  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0571  surface antigen (D15)  28.24 
 
 
790 aa  289  1e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1599  surface antigen family outer membrane protein  27.66 
 
 
786 aa  288  2.9999999999999996e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.728985  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>